Name : hom (N565_00139) Accession : YP_008538056.1 Strain : jejuni jejuni 00-2538 Genome accession: NC_022351 Putative virulence/resistance : Unknown Product : homoserine dehydrogenase Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : 1.1.1.3 Position : 144984 - 146231 bp Length : 1248 bp Strand : - Note : - DNA sequence : ATGAAAGTAGCGATTCTTGGTTATGGCACTGTTGGAAGTGCGGTGGTTAAATTTCTTTTAGAAAATGATAAACTCATTCG TGCAAGATGTGGGCAAAGCATAACTCCTGTGATCGCTCTTGCTAGAAGTCCTAAAAAAAATGCTTTAATTCCAATTACTC ATAGCGTTGCAGAAATTTTAAATGCTGATGTAGATGTTTTTGTAGAATTAATGGGTGGGGTGGATGAAGCTTTTAAAATA GTGAGTGAAATTTTAAAAAAGAAAAAAGCTGTTGTTACTGCAAATAAAGCTATGCTTGCTTATCATCGTTATGAACTTGA AAATTTGGCTAAAAATTTAGCTTTTGGTTATGAAGCAAGTGTGGCTGGAGGAATTCCTATTATCAAGGTTTTAAAAGAAG GTTTAAGTGCAAATAATATTTTGGCTATAAAAGGGATTTTAAATGGTACGAGTAATTATATTTTAAGTTCTATGAGTCAA AAAAATATGAGTTTTAAACAAGCTTTGCAAATAGCTCAAAATTTAGGTTATGCAGAGGCTGATCCAACTTTTGACATAGA AGGGCAAGATGCAGCACATAAACTGCTTGTTTTATCAAGTATCGCTTATAATCTTAAAGCTAAACCTGAAGATATTTTGA TCGAGGGTATTAGTGAAATTGCACCTGAAGATATGTATTTTGCTAATGAGTTTGAATTTACCATAAAACTTTTAGGTATA GCTAAGGTGCGTGAAAATAAAGTAGAATTAAGGGTGCATCCTACTATGATAGATAAAGAAAAAATGCTTGCAAAAGTTGA TGGAGTGATGAATGCTATAAGCATTAATGGAGATTTGTTGGGTGAAAGTTTGTATTATGGAGCAGGAGCAGGAGGAGAGG CCACTGCAAGTGCTGTGATTTCAGATCTTATGGATATAGCAAGAGATCAGGTAAAAGCACCAATGCTTGGTTTTGTGAAT ACTTTAGAATACAAGCTTTTAAGCAAAGATGAAATTTATACAAAATATTATTTAAGGGTGAAAGTTGAAGATAAAATAGG GATTTTATCTAAAATCACACAATTGATGAGTGAAAATAATATTTCTATCGATAGTTTTTTACAAAAACCTAAAAAAAATG ATGAAAATTACAGTACTTTGTTTTTTACTACACATTTAACTTATGAAAAAAGCATACAAAATTTGCTTGAAATTTTACGC AAACAAGATTTTATAAAAACCAAGCCTTTTATGATGCGTATAGAATAA Protein sequence : MKVAILGYGTVGSAVVKFLLENDKLIRARCGQSITPVIALARSPKKNALIPITHSVAEILNADVDVFVELMGGVDEAFKI VSEILKKKKAVVTANKAMLAYHRYELENLAKNLAFGYEASVAGGIPIIKVLKEGLSANNILAIKGILNGTSNYILSSMSQ KNMSFKQALQIAQNLGYAEADPTFDIEGQDAAHKLLVLSSIAYNLKAKPEDILIEGISEIAPEDMYFANEFEFTIKLLGI AKVRENKVELRVHPTMIDKEKMLAKVDGVMNAISINGDLLGESLYYGAGAGGEATASAVISDLMDIARDQVKAPMLGFVN TLEYKLLSKDEIYTKYYLRVKVEDKIGILSKITQLMSENNISIDSFLQKPKKNDENYSTLFFTTHLTYEKSIQNLLEILR KQDFIKTKPFMMRIE |
Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
BJAB07104_00305 | YP_008207770.1 | Homoserine dehydrogenase | Not tested | AbaR25 | Protein | 1e-59 | 46 |
BJAB0868_00309 | YP_008211635.1 | Homoserine dehydrogenase | Not tested | AbaR26 | Protein | 1e-59 | 46 |