Gene Information

Name : SBOV43471 (BN855_43340)
Accession : -
Strain : Salmonella enterica 3114
Genome accession: NC_022241
Putative virulence/resistance : Virulence
Product : large repetitive putative inner membrane protein,possible pseudogene
Function : -
COG functional category : -
COG ID : -
EC number : -
Position : 4320438 - 4335990 bp
Length : 15553 bp
Strand : +
Note : possible pseudogene, C-terminal may be missing

DNA sequence :
ATGGGAAATAAAAGCATACAAAAGTTTTTTGCCGATCAAAATTCTGTAATTGATTTATCTTCTTTGGGTAATGCCAAAGG
CGCAAAAGTTTCTCTTTCCGGGCCAGACATGAACATTACCACGCCGCGTGGTTCAGTGATCATTGTCAATGGCGCTCTTT
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TAATTAGCGTCGATACTGCTATTTCAATACCGATAGTTTCATTGAGCCCGGATTCAGATTCGGGAATTGCAGATGATAAT
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CGGCAAGACGTGGTTCAACGCTACCCAGAGCGCGACGCCGGGCGCCTGGGATTATATCTGGCCGGATGATGTGGCCGACG
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GTGAAGGTAGAAGATAGGGCCGGAAATGTGAAGCAGTCCGCGCCGTTGACGGTGACAGTGGACACGCATATCGCCATTGA
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TACCGGCGGATGTTAACGGTGTAAGACTGAGTATTGATGGCGGCAAAACGTGGTTTGACGCCACGCAGAGCGCGACGTCG
GGCGTCTGGGATTACACCTGGCTGACGAATGTGGCTAACGGCCCTCACACCCTGATGGTGGAAGCGTCCGACAAGGCGGG
AAACAAAACGACGCAGAAACTGGACTTCACCATCGATACCATTCTGTCAGAACCGACGATTACCCTGGACAGCGCGGATG
ATAGCGCCGCTGGCGATAACATCACCAACGTTAAGATGCCAGGCTTTACCCTCGGTAATATCGACGCCGACGTGACCAAA
GTGGTGGTGACGGTGGCGCATGATGGTAAGAACCAACAGATAGAGTTGATTAAGAACGGCGGTGTGTGGCGCTTTACGCC
GGGCGCAGCCTGGACCGATGGCGACTATACGCTGACGGTAAAGGTAGAAGATAAGGCGGGTAATACAAATTATTCTGCGC
CGCTGACGGTGACTATCGATACGCAAACGTCTATTGATCGCATTGAGCTTCTTAATGACACGGGTATTGTCGGGGATAAC
CTGACCAATGAAGCACGTCCACAGTTTCATATTACGGTACCGACGGACGTGAACTCTGTGCAACTGAGTCTTGATGGCGG
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TTTTATTATCGGCGGTATTGATTCTGACGTGACTCAGGTCGTCGTGCAGGTGATGCGCGATGGTCACAGCGAGGAGGTGG
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ACGCAGCAACTGGACTTCATCATCGATACCCTACTGTCAGAACCGACTATCGTGCTGGACAGCACGGACGACAGCGGAAC
AAAAGGCGATAACCTGACCAACGTAAATAAGCCGACGTTTTTACTGGGCAATATTGACGCAGACGCGCGGTATGTCACGG
TTGAGGTGCAGCATGGCGGCACGAAAGAAGTGCTGACGGCCACCAAAGGCGCGACCGGCATCTGGAGCGTGACACCGACC
GGCACATGGGCAGATGGCGACTATACGCTGACGGTGAGGGTGGAGGATGATGCAGGGAACGTAAAATACTCAGCGCCGCT
GACGGTCACGGTTGATACCCAAATCACCATCGATGTTATTGAACTGGTTAATGATAACGGTATTCCCGGCGACAACCTGA
CCAATGACGTTCGTCCACACTTCCGCGTCACGGTGCCAGGGGATGTCAACGAGGTACGTTTGAGTATCGACGGCGGTAAT
ACGTGGGTTCGTGCAACACAGGGCACGGCAGGGACCTGGGATTACACCTGGCCGAAAGATGTGACCGACGGGCTACATAC
CCTGACGGTAGAAGCGACCGATAAGGCGGGAAATAAGACGACGCAGACGCTCGATTTTACCATTGATACCCGGCTGTCAA
CGCCTACCATCACTATGGATAGCAGGGACGATACAGGCGCCATTGGCGATCATATTACGAGCGTCAAAAGACCGGGCTTT
ACCATTGGCAATATTGACGCCGATGCGCACTCGGTCATTTTGCGGATCACACAGGGCGGCAATAGCCAGGAAGTGACACT
AACCCAGGTTGGAGGACAGTGGCGCTTTACGCCAGATGCTGACTGGGCGGACGGTAGCTATACACTGACGGTAGAGGTAA
CGGATAACGCAGGAAACGTTCGTCAGTCCACGCCGCTGATAGTGACGGTAGATACGCAAACCAGCATTACCGATATTACA
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TGTGAATTCTGTGCAACTGAGCATTGATGGGGGCGCAAACTGGGTGAGCGCGGCGCAGGGTATCGAAGGCGTCTGGGGCT
ATACCTGGCCAACGGATATGGGCGATGGAAAACACACCCTTACCGTCATGGTCACCGACAGAGCGGGCAATACGGCGACG
CAAACGCTTGAATTTTTCATCGACACCCGGTTGTCGACGCCGACCATTGCGCTGGATAGCACGGATGATACCGGTACGCC
TGGCGATGATATGACCAATCGCACCCGACCGACCTTTATTCTGCAGAATATCGATTCGGATGTTATCAACGTTACAGTCA
GCGTCACGCATAATGGAACGACAACCTCGTTTACTGCGACACAGGGGGCTGGAGGATGGAGCTTTACACCGCCAGCGCCG
TGGGGCGACGGTGATTATACGCTGACGGTGACAGTGGAGGATCGGGCGGGAAATACGCGTCCGTCTACGCCGCTGACGGT
GACAGTGGATACGCAAATAGCCATTGATCGTATTGAATTAGTCAACGATAGCGGCGTCCCTGGCGATAATGTGACAAAAC
ATGTGCGTCCGCAGTTCCAGATCTCGGTACCGGATGATGTGGAAAAGGTTCTTCTGAGTATTGACGGCGGCACGACCTGG
GTTACTGCAATCAAGAGTTCGACGGCTGGCATTTGGGATTACACCTGGCCGACGGATATGCCAGAGGGACAGCATACCCT
GACCGTGGAAGTGACTGACGGTGCGGGTAATAAGATGACGGAGACGCTCAATTTCACTATCGATATCACGTTGTTAACGC
CAACCATTGAGCTAGCGCCCGATCAGGATACCGGACAGAATAAGAACGATAATCTGACCAGCGTCACTCAGCCGGTATTT
GTGTTGGGGAGTATCGATAAAGATGTTCGACACGTGGAATTGAGTATTGAGCATAACGGCACGTTTAAAACGGTGGTACT
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TGATTCTGACGTTACGCGCGTGATGGTCAAAGTAACTTACAACGGTAAAACGCACGAGGAAGCGGCGGTATTCACCAATG
GTCAATGGCGCTTTACGCCTTCTGCGAGCTGGGCTGATGGCTCATATCAGTTAGCCGTTGTGGTGGAAGATCTGGCGGGG
AATGTAAAAGAGTCTGCGCCGTTTGAGGTGCGTATTGATACCACGACAACCATTAACAATATCGTATTGCTTAATGATAC
CGGCGTGCAGAATGATCAATTAACGAATGTTGCCAAACCGTCATTCAGAATTGACGTTCCCGGTGATGTCGTCCAGGTAC
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TTACTAATATTTCACGACCCACCTTTACGATTGGTAATGTTGACCCCGATGTTATCAAAGTCGTGGTGACGATTGATGGT
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ATCAACCGCTGTCTGACGGTCAGCATACGATCTCTGTTACCGTAACGGATATTGCTGGTAATACCAAAACATCGGCCGAA
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TGTCACCAATGCTACCCGTCCCTCTTTTGAAATTGCAACGCCTGATGATGTGACATCGGTGCTGGTTTCTTTCGATGGCG
TAAACTGGACGCCCATCAGTAAAAATGCGGCCGGGCAGTGGGAATTTACTGCAGGTAGCGCATTGCCTGATGGTCATTAT
ACTCTCCATGTCCAGGCGACGGATCGGGCAGGGAATACGGCAAATTCCACGCTGGGCTTCACCGTGGATACGCAGATTGA
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AATAAATGGCTGTTTACCCCTGATACACCGTTAGTGGATGGAACTTACAAAATAGAAATAGTGGCTGAAGATATCGCAGG
TAATAAAATTAGCAAAGAGGTATCATTCACAATAGACACTATTGTTTCTGATCCCAGTATTGATTTGCTGGATGCGGATG
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CCGTGGTATTACGCGAAGCTGATGACAGTGGCAAAGTTGGCGACTGGATCACCAATAAATCTCATGTCACCATCGATGGT
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GATAAATATGATCTGATTACCAATAATAAGTCTCCGGTACTGGTTGCCATGACCGATCCCGGCGCGACGGTACAGGTTTA
TATTAATGGTGTGTTACAAGGCACAGTAGAGGCGAGTTCGTCAGGTAATATTAGCTATACCATGCCGGCAAATAGCGCCG
ACGGCGAGTATCAGGTGCAATTTGTTGCTACGGATACTGCTGGTAACCGGGTTGAGTCTGCGATTACAACCGTGACAATC
GATTCTCAAATTGCTGTCTTTGACATTGATGAAGATTCATTACCGGCCCTCTCTAATAACCGGGCGTTGTCAGTCTCAGG
TGTCGGGGAGGCTGGTTCTCAGGTCAGCATCTTTGTCGATGGTAAATTAGTCAACGTTGTTATGGTTGAGGCTGATGGCA
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TGGTTCACTTGACGATCTGATTACTAGTCACAACAAGCCTGTGTTAGTTGGCACCGCAGAAGCGGGAGCCACAATCCATA
TTTATGTGGATGAAAAGATCGTGGCAAATGTTCTTGTGCTTGAAGATGGAACCTGGTCCTATCAGTTTGATAATGCGTTA
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TCGCTATTGATTCTATCGGCGGACAAACGTTAGCAGAGATGACCGGTAGTGATGGCAAAATATATATAACGGACACGACA
CGTAACTTATTGTTTAGTGGCAGTGCCGAGCCCAATAGCAAAATAGAAATCATCATTAATGGCTTAAATGTGGGGGAAGT
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GAGCTTGATGACAATAAATCATCATCGAAAACGGACTGGTGGAGTAATAGCTCCACTATTACCATGAGAGGTATGGGGGA
AATTGGCGCTACGGTATCATTAATCGTGGCAGGGGTCACGCTGGCAACCGCTGTCGTTGCGGCTAATGGGCAGTGGGAGT
TATCGACCGATCAGCTTCCGGAAGGGAAATACGATATCACGTTGAGTATTGAGGATAACGCAGGCAACCGTAAGGAAGAG
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TATGCAGGGGACGGCGGAAGCCAAATCTCAGCTAATAATAACCGATAGTAATGGGAATACTTATACGTTAACCGTTCCTG
ATAATGGTAAATGGAGTATGGCGATCCCGTATCCATCGGAAGGGAAGTTTACCATTACGAGTGTGGATGCGATTGGTAAC
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ACACCCAGCCTAAGTTCACGCTGCAGCATATTGATGCTGATGTGACCGGGGTGACCGTAAACGTGACGCATAATGGCGTG
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GCTGAGCGTGACGGTGGTGGATCGCGCGGGGAACTCACAGCAATCTGCTTCGCTAGCGGTGACGGTTGACTCAACGGTGA
CGGTAACAGCGGATAGCCAGCATAACGATGCGAGCGATGACGCCACGGCAACAGCGGTTACTCCACCGGAGTCTGAAACA
GTGAATGCCGAAAGCGCTACGCATCTTCGTACAGTGCCGTCTGTGGCGGAAGAAAGCGTGGTGAAGGAGACAGCCTATAG
TATTACATTGTTAAACGCTGACTCTGGGGATGAAATAGATCGTTCAATTAGTCAGACACCTTCTTTTGAAATATCAGTAC
CTGAGAATATTGTTAATGTCAGTGTTATGTTTGAAGGAGAAGAGTTTACTCTGCCGATAACTAACCAGAAAGCAATATTC
GAAGTTCCGCTATCTTTGGAAGATGGTGAATATACTATGGACGTGAAATTCATTGATAAGGACGATGATTTCCTGATTAA
GGAGAAAACATTCTCAGTCGATCACTCCTCGGCGGATATTGTGAACGCAATGAATGCAAGAGGAAAGACCGAGGATGATA
TTAATGATTCCCCTTCAACGAGTTCTGTAGGGCACAACAATAACGGCGCTATTGATGTTTTCGCCGTTAATGAAGTTACG
TTACCTGTAGATAATCAAGAAGAACACGCATAA

Protein sequence :
-

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
SC4140 YP_219127.1 inner membrane protein Not tested SPI-4 DNA 0.0 99.2
siiE CAE11797.1 large repetitive protein Virulence SPI-4 DNA 0.0 98.9
STM4261 NP_463126.1 inner membrane protein Not tested SPI-4 DNA 0.0 98.9