Gene Information

Name : HMPREF0946_00276 (HMPREF0946_00276)
Accession : YP_008476554.1
Strain : Fusobacterium sp. 3_1_36A2
Genome accession: NC_022196
Putative virulence/resistance : Unknown
Product : sodium/glutamate symporter
Function : -
COG functional category : -
COG ID : -
EC number : -
Position : 1013550 - 1014749 bp
Length : 1200 bp
Strand : +
Note : -

DNA sequence :
ATGTTTGAATATCAATTAAATATGGCTGAAACAGTCGGATTTGCAATTATTTTATTATTATTAGGAAGATGGATTAAAAG
AAGAGTTAATTTCTTTGAAAAATTCTTTATTCCTGCACCAGTTATTGGAGGAACATTATTTTCAATAATACTTTTAATAG
GACATCAAACTGAAACATTTACTTTTAGTTTTAATGATGATATCAAAAACTTATTGATGATAGCATTCTTTACAACAGTT
GGTTTCTCAGCAAGTTTAAAAATTTTGAAAAAAGGTGGAGTAGGAGTTGCATTATTCTTGCTAGCAGCAGTTATATTGGT
TGTAATGCAAGATATAGTTGGTCCAGTTCTAGCTAAGGCGTTAGGAATTAATCCATTATTAGGATTAGCAGCAGGATCTA
TTCCTTTAACAGGAGGACATGGAACATCGGGAGCATTTGGACCTGAATTAGAAAAATTAGGGGCAACAGGAGCAACAGTT
GTTGCAGTTGCATCAGCTACTTATGGTTTAATAGCAGGATGTTTAATAGGTGGACCAATAGCTAGAAGATTAATGATTAA
AAATAATCTAAAACCTACTGAAAGTAAAGAAGGAGTAGATAATTCTTTATTAGGAAGTACAACAGAAGTAACTGAAGAAA
GTTTGTTTTCAGCTGTAGTTTATGTTGGTATTGCAATGGGTATCGGAGCTCTAATAAATAATATGTTAGCAAAGGCTGGA
ATAAAATTTCCTGTTTATTTAATGGGAATGGTTGTTGCTGCTATAATAAGAAATATATTAGATTTTAACCAAAAACAATT
ACCATTTAGTGAAATAGGAATTGTAGGAAATATATCTCTTTCATTATTCTTATCTATGGCCTTAATGTCTATGAAATTAT
GGCAATTAATTGACTTAGCAGTTCCTCTAATTATAATTTTATTAGTTCAAACAGTTTTAATGGCATTCTTTGCTTATTTT
ATAACTTTCAATATAATGGGAAGAGATTATGATGCAGCTGTTATGTCAACTGGACACTGTGGATTTGGTTTAGGAGCTAC
ACCAAATGCTATGGCAAATATGGAAACATTTACTAAGGCAAATGGTCAATCAGTAAAAGCTTTCTTTATAATTCCAATAG
TAGGATCTTTATTTATAGACTTTATTAATGCAGGGGTAATTCAAACATTTGCTAGTTGGATAGTTAAGAATTTTATGTAA

Protein sequence :
MFEYQLNMAETVGFAIILLLLGRWIKRRVNFFEKFFIPAPVIGGTLFSIILLIGHQTETFTFSFNDDIKNLLMIAFFTTV
GFSASLKILKKGGVGVALFLLAAVILVVMQDIVGPVLAKALGINPLLGLAAGSIPLTGGHGTSGAFGPELEKLGATGATV
VAVASATYGLIAGCLIGGPIARRLMIKNNLKPTESKEGVDNSLLGSTTEVTEESLFSAVVYVGIAMGIGALINNMLAKAG
IKFPVYLMGMVVAAIIRNILDFNQKQLPFSEIGIVGNISLSLFLSMALMSMKLWQLIDLAVPLIIILLVQTVLMAFFAYF
ITFNIMGRDYDAAVMSTGHCGFGLGATPNAMANMETFTKANGQSVKAFFIIPIVGSLFIDFINAGVIQTFASWIVKNFM

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
gltS NP_273147.1 sodium/glutamate symport carrier protein Not tested IHT-A Protein 3e-47 42
unnamed AEA34672.1 sodium/glutamate symport carrier protein Not tested Not named Protein 2e-42 41