Gene Information

Name : HMPREF0946_01846 (HMPREF0946_01846)
Accession : YP_008475667.1
Strain : Fusobacterium sp. 3_1_36A2
Genome accession: NC_022196
Putative virulence/resistance : Unknown
Product : hypothetical protein
Function : -
COG functional category : -
COG ID : -
EC number : -
Position : 20388 - 21905 bp
Length : 1518 bp
Strand : -
Note : -

DNA sequence :
ATGTCTACAAAAGAAAAAAAGAAAAGAGGATTTCCCACTGCTTTCACAGTATTAGCTATTATTTTAGTTTTAGCTGCTGC
TTTAACTTACATAATTCCATCAGGTCAATTTTCAAGATTAACTTATGATGATAGTACAAATGAGTTTGTTATTACAGACC
ACGATAATAATGTAAAAACAGAACCTGCAACACAAGAAGTTTTAGATAGACTTCAAATTCAATTAAGTTTAGATAAATTT
ACTGATGGAGTAATTAAAAAACCTATTGCTATTCCTGGTACTTATCAAAGAATTGAACAACATCCACAAGGATTTTTAGA
TGTAATTAAAGCACCAATTACTGGTTCAATGGATACAGTTGATATTATGCTTTTTGTTCTTATTCTTGGAGGAGTTATAG
GAATTATTAATAAAATAGGAGCTTTTGATGCTGGAATGGCAGCTCTATCAAAAAGAACTAAGGGAAAAGAATTTTTATTA
GTAACTCTTGTTTTTGTATTGACAACCTTAGGAGGAACAACTTTTGGTTTAGCAGAAGAAACTATTGCTTTTTACCCTAT
TCTTATGCCTATATTTTTATTGAGTGGTTTTGATGTATTAACTTGTATTGCTGCAATTTATATGGGTTCATCTATTGGAA
CAATGTTCTCAACTACCAACCCTTTTGCTACTGTTATTGCATCCAATGCAGCTGGAATTTCATTTACAAAAGGATTGACG
TTTAGAATAGTAGCTTTAGTTTTAGCTTCAGTTATCACTTTGGCATATATGTATTGGTATGCTCAAAAAGTTAAAAAAGA
CAAAACAAAATCTTATGTCTATGTTGATGAAGAAGAGATACATAAAAGATTTTTAGGTGAATATGATGCAAATTCAGAAA
AAGAGTTTACTTGGAGAAGAAAACTATGTTTGCTTATATTTGCCTTAGCATTCCCTGTTTTAATTTGGGGAGTTTCTCTT
GGTGGATGGTGGTTTGAAGAAATGTCAGCACTATTCTTAGGAGTAGCTGTTGCTCTTATGTTTCTTTCTGGGCTATCAGA
AAAAGAAGCTATTAATACTTTTATAGGTGGTTCAGCAGATTTGGTTGGGGTTGTCTTGATTGTAGGGTTAGCTCGTTCTA
TTAATATAGTAATGGATAATGGTTTTATTTCTGATACTTTATTATACTATTCAACTGAATTTGTTGCAGGTATGAGTAAA
GGTGCATTTGCTGTTGCACAGTTAATAATTTTCTCTTTCTTAGGATTTTTTATTCCATCATCTTCTGGACTGGCTGTACT
TTCTATGCCTATTATGGCTCCACTTGCAGATACAGTTGGTCTATCAAGAGAAGTTGTAATCAATGCATATAACTGGGGAC
AAGGTTGGATGTCTTTTATTACACCTACTGGCTTAATTTTAGTAACATTAGAAATGGCAGGAACTACTTTTGATAAATGG
CTAAAATATATTTTACCACTAATGGGAATTATGGGAGTTTTCTCTGTATTGATGTTGATTATAAACACAATGTTATAA

Protein sequence :
MSTKEKKKRGFPTAFTVLAIILVLAAALTYIIPSGQFSRLTYDDSTNEFVITDHDNNVKTEPATQEVLDRLQIQLSLDKF
TDGVIKKPIAIPGTYQRIEQHPQGFLDVIKAPITGSMDTVDIMLFVLILGGVIGIINKIGAFDAGMAALSKRTKGKEFLL
VTLVFVLTTLGGTTFGLAEETIAFYPILMPIFLLSGFDVLTCIAAIYMGSSIGTMFSTTNPFATVIASNAAGISFTKGLT
FRIVALVLASVITLAYMYWYAQKVKKDKTKSYVYVDEEEIHKRFLGEYDANSEKEFTWRRKLCLLIFALAFPVLIWGVSL
GGWWFEEMSALFLGVAVALMFLSGLSEKEAINTFIGGSADLVGVVLIVGLARSINIVMDNGFISDTLLYYSTEFVAGMSK
GAFAVAQLIIFSFLGFFIPSSSGLAVLSMPIMAPLADTVGLSREVVINAYNWGQGWMSFITPTGLILVTLEMAGTTFDKW
LKYILPLMGIMGVFSVLMLIINTML

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
SAV1171 NP_371695.1 hypothetical protein Not tested vSa¥ã Protein 3e-97 44
SA1014 NP_374287.1 hypothetical protein Not tested vSa¥ã Protein 3e-97 44
SACOL1183 YP_186046.1 hypothetical protein Not tested vSa¥ã Protein 9e-98 44
SAUSA300_1064 YP_493762.1 TRAP family protein Not tested vSa¥ã Protein 9e-98 44
MW1052 NP_645869.1 hypothetical protein Not tested vSa¥ã Protein 7e-98 44
SAKOR_01092 YP_008491280.1 Arginine/ornithine antiporter Not tested vSa¥ã Protein 3e-98 44