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Name : HMPREF0946_01294 (HMPREF0946_01294) Accession : YP_008477592.1 Strain : Fusobacterium sp. 3_1_36A2 Genome accession: NC_022196 Putative virulence/resistance : Virulence Product : hypothetical protein Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 2042293 - 2044104 bp Length : 1812 bp Strand : - Note : - DNA sequence : ATGAATAGTGTAAGGAAATTAATAAAATTTTTAATAGATATATTTTTATTAAATATGTCATTAATTATTTCTATTTTTCT AAAATATGATCAAATGCAGATGGTAGATAGAAATATAAATTTCTTTATTTATTATAATATTTCTTTTTGTGTTATATATT TTATTTTAAAAATCTATAATAACAGTTGGAGATTTAGTGGAATATCTGAATACACAGCTTTAATAAGTTTAAGCATATCT ACAACGGTTTTATCATATATACTAAGAGTTTTTTTAAAACTATCTACAAGGAGTAGCTTATATTTTGAAACTTTTATAAT ATTTACATTTTTATTGATACTTTCAAGATTTTTAATGTTCTTAACTAGAATGAAAGGAATTATAAAGAAAGATTTAAATC AAGAAAATGTGCTTATCTATGGTGCAGGAGAATCAGGGGTCTTATTAGTAAAAGAATCTAAAATAAATCCAAATTTTCCA TATAGAATAGTTGGTTTTTTAGACGATAATGTAAATAAAATAGGTGGAAAAGTTTATGGTTTAAAAGTTTTAGGAGGTTT AGATAGAGTAAGAGAAATAGTAGAAAAAAAAGATATTTCTAAAATAATTATATCTATGCCATCAGTGAGTCAAAATAAAG TTTCTAATATTTTAAAGGAGATAAATAAAATAGAAGGATTATCTGTAAAGATATTACCAAATGTAGACAATTTAATAGAA GAAGGGAATTTAGCAACTCAACTTAGAAATATAAAATTAGAAGATTTATTAGGTAGAGATGAAATAAAAATAAATACGAA GGAAGTATTTGACTTTGTTCAAGATAAAATAATATTTGTGACTGGTGGTGGGGGAAGTATTGGTTCTGAACTTATTAACC AAATTGCAAAATATAATCCTAAGAAAATTATTAATATAGAAATTAATGAAAATGCTTCTTATCTTATGGAATTAGAATTA AAAAGAAAGTATCCGTATTTAGATTATAAAACTGAAATTGCAAGTATAAGAGATTTTAATAAACTTGATATATTATTTAA TAAATACAAGCCAGATATATTATTTCATGCTGCTGCACATAAACATGTGCCACTTATGGAAAACAATCCAGAAGAAGCTA TAAAAAATAATATATTTGGAACTAAAAATATAGCTGAATGTTGTTTAAAATATAAATTAGGATCAGTAGTTTTAATTTCG ACAGATAAAGCTGTTAATCCAACTAACATTATGGGAACAACAAAAAGAGTCTGTGAAATGATTTTTCAAAAGTATTCAGA AAAATCAAGTGATACAAAATTTATAGCAGTTAGATTTGGAAATGTTTTAGGAAGTAATGGCTCAGTTATTCCAATATTTT CAAAATTAATAGAAGAAGGAAAAAATTTAACACTTACCCATAGAGATATTATAAGATACTTTATGACTATACCAGAAGCA GCTCAATTAGTTATAGAAGCAGCAACTATTGGTAAAGGTGGAGAGATATTAATTTTAGATATGGGAGAGCCAGTTAAAAT ATATGATTTAGCTAAAAATATGATTAAATTATCAGGCTCTAATGTTGGAATAGATATAGTTGGTTTAAGACCAGGTGAAA AGCTATTTGAAGAGCTACTGTATGATGTAAATTCATCAGAAAAAACATCGAATAATAAGATATTTATTACTAATATGGAA AATGAGAAAGTAAAAGTCAATATAGATGATTATTATACAATTCTTAAAGATTTAATTAAAGAAAATGATATTATTGGTAT GAGAAGAACTCTTGCTAATATTATTGGAACTTTTAAAGGGAGAGTGGAATAA Protein sequence : MNSVRKLIKFLIDIFLLNMSLIISIFLKYDQMQMVDRNINFFIYYNISFCVIYFILKIYNNSWRFSGISEYTALISLSIS TTVLSYILRVFLKLSTRSSLYFETFIIFTFLLILSRFLMFLTRMKGIIKKDLNQENVLIYGAGESGVLLVKESKINPNFP YRIVGFLDDNVNKIGGKVYGLKVLGGLDRVREIVEKKDISKIIISMPSVSQNKVSNILKEINKIEGLSVKILPNVDNLIE EGNLATQLRNIKLEDLLGRDEIKINTKEVFDFVQDKIIFVTGGGGSIGSELINQIAKYNPKKIINIEINENASYLMELEL KRKYPYLDYKTEIASIRDFNKLDILFNKYKPDILFHAAAHKHVPLMENNPEEAIKNNIFGTKNIAECCLKYKLGSVVLIS TDKAVNPTNIMGTTKRVCEMIFQKYSEKSSDTKFIAVRFGNVLGSNGSVIPIFSKLIEEGKNLTLTHRDIIRYFMTIPEA AQLVIEAATIGKGGEILILDMGEPVKIYDLAKNMIKLSGSNVGIDIVGLRPGEKLFEELLYDVNSSEKTSNNKIFITNME NEKVKVNIDDYYTILKDLIKENDIIGMRRTLANIIGTFKGRVE |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| cap1D | AAA64643.1 | type 1 capsule synthesis gene | Virulence | SCCcap1 | Protein | 8e-71 | 43 |
| Gene | GenBank Accn | Product | ID of source DB | Alignment Type | E-val | Identity |
| HMPREF0946_01294 | YP_008477592.1 | hypothetical protein | VFG1300 | Protein | 3e-68 | 42 |
