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Name : HPSA20_0159 (HPSA20_0159) Accession : YP_008471125.1 Strain : Helicobacter pylori SouthAfrica20 Genome accession: NC_022130 Putative virulence/resistance : Unknown Product : transporter, lactate permease family protein Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 147086 - 148735 bp Length : 1650 bp Strand : + Note : - DNA sequence : ATGGAATTTTATCAAGTCTATGATCCATTAGGCAATATTTGGCTAAGCGCTCTAGTGGCGCTCTCGCCTATTGCACTCTT TTTTATTTCTCTTATTGTTTTCAAACTTAAAGGCTATAGCGCTGGGTTTTTAAGCTTAGTGCTTTCAATCATTATTGCGT TATTTGTGTATAAAATGCCCGCTCAAATGGTGAGTGCAAGTTTTTTCTATGGCTTTCTTTATGGCTTATGGCCGATCGCA TGGATTGTGATCGCTGCGATTTTTCTTTACAACCTTTCAGTGAAATCCGGGTATTTTGAGATTTTAAAAGAAAGCATTTT AACTTTAACGCCGGATCATCGCATTTTAGTGATTTTGATCGGTTTTTGTTTTGGCTCGTTTTTAGAAGGAGCGATTGGTT TTGGAGGTCCGGTAGCGATCACAGCGGCGATTTTAGTAGGCTTAGGGCTAAACCCCTTATACGCTGCCGGGTTGTGCCTA ATCGCTAACACCGCTCCTGTGGCTTTTGGCGCGGTGGGTATCCCTATTACGGCTATGGCTAGTGTGGTGGGTGTCCCTGA ATTAGAGATTTCTCAAATGGTGGGCAGGGTGTTGCCCATTTTTTCTATTGGTATTCCTTTTTTCATCGTGTTTTTAATGG ATGGTTTTAAGGGGATTAGAGAAACTTTTCCGGCGGTAGCGGTTACCGGGTTTAGCTTTGCGATCGCGCAATTTTTAAGC TCCAATTATTTAGGGCCGCAACTTCCGGATATTATTTCGGCTTTAGTGTCATTGATTTCTACCACTTTATTTTTAAAGTT TTGGCAGCCTAAAAATATTTTCACTAGCAATGGCAAAGAGCCAACAATTAGCACAGAAAAACACCATATTTGCAAGGTGA TCGTGGCGTGGATGCCTTTTGTGTTGCTCACTATTACGATCATTATATGGACACAACCTTGGTTTAAAGCGCTCTTTAAA GAAGGCGGGGCTTTGGCGTTTTCTAGCTTTGCGTTTGAATTTGATTCTATCAGTCAAAAGATTTTTAAAACCGTTCCCAT TGTTACTGAAGCGACCAATTTTCCTGTCGTGTTCAAACTCCCTTTAATCTTAACGACAGGCACTTCCATCTTTTTAGCCG CTCTTTTGAGCGTGTTTTTGTTGCGCGTGAAAGTCAGCGATGCGATAGGGGTTTTTGGGGCCACTTTAAAAGAAATGCGT TTGCCGATTTTAACCATTGGCGTGGTTTTGGCGTTTGCGTATGTGGCTAATTATAGCGGCATGAGCGCTACTTTAGCCTT AGCGTTAGCCGATACTGGGCATGTTTTCACTTTCTTTTCGCCTGTTGTAGGCTGGCTTGGGGTGTTTTTAACCGGAAGCG ACACAAGCTCCAATCTTTTATTTGGCTCTTTACAAATGCTCATCGCTACACAGCTTGGCTTGCCTGAAGTGCTTTTCTTA GCGGCAAACACTTCAGGGGGTGTTGTGGGTAAAATGATAAGCCCTCAAAGTATCGCTATCGCTTGCGCAGCGGTGGGATT AGTGGGTAAAGAGAGCGAATTGTTTAGATTTACAGTAAAATACTCTATCGCTTTGGCAATCATTATGGGGATTGTCTTCA CTCTTATTGCTTATGTCTTCCCCTTTATTATTCCAGTTACTCCTACTTAA Protein sequence : MEFYQVYDPLGNIWLSALVALSPIALFFISLIVFKLKGYSAGFLSLVLSIIIALFVYKMPAQMVSASFFYGFLYGLWPIA WIVIAAIFLYNLSVKSGYFEILKESILTLTPDHRILVILIGFCFGSFLEGAIGFGGPVAITAAILVGLGLNPLYAAGLCL IANTAPVAFGAVGIPITAMASVVGVPELEISQMVGRVLPIFSIGIPFFIVFLMDGFKGIRETFPAVAVTGFSFAIAQFLS SNYLGPQLPDIISALVSLISTTLFLKFWQPKNIFTSNGKEPTISTEKHHICKVIVAWMPFVLLTITIIIWTQPWFKALFK EGGALAFSSFAFEFDSISQKIFKTVPIVTEATNFPVVFKLPLILTTGTSIFLAALLSVFLLRVKVSDAIGVFGATLKEMR LPILTIGVVLAFAYVANYSGMSATLALALADTGHVFTFFSPVVGWLGVFLTGSDTSSNLLFGSLQMLIATQLGLPEVLFL AANTSGGVVGKMISPQSIAIACAAVGLVGKESELFRFTVKYSIALAIIMGIVFTLIAYVFPFIIPVTPT |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| glcA | CAE85240.1 | GlcA protein, putative glycolate permease | Not tested | PAI V 536 | Protein | 2e-132 | 55 |
