Gene Information

Name : I871_03360 (I871_03360)
Accession : YP_008415776.1
Strain : Borrelia miyamotoi LB-2001
Genome accession: NC_022079
Putative virulence/resistance : Unknown
Product : PTS glucose transporter subunit IIB
Function : -
COG functional category : -
COG ID : -
EC number : -
Position : 679086 - 680630 bp
Length : 1545 bp
Strand : +
Note : Derived by automated computational analysis using gene prediction method: GeneMarkS+.

DNA sequence :
ATGGGAAAATTTTTTGAGAATGCTCAAAAAGTTGGGCGTTCTTTTATGTTACCTATTTCTATTCTTCCTGCAGCAGGATT
GTTTTTAGGTATTGGAGGTGCTTTTTCTAATCCAGCAACTATTAGTGCATATTCTTTTTTAGATGTGTTTGCTCTTCAAT
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ACTGGAGCAAAGGGAGTTATTATCAGGGGCAGTGGAGTTCAGGTGATTTATGGGCCTGGTGTTAGTGTGCTTAAAAATGA
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Protein sequence :
MGKFFENAQKVGRSFMLPISILPAAGLFLGIGGAFSNPATISAYSFLDVFALQSVFNVMRAAGAIIFVNLPPIFAIGVAV
GLAKSDKGTAGLAAFIGYLVLNATVGILIEIFGKVEDLSRGSVGSILGIRTLETGVFGGIIVGALTYSLHNSFNKVEFPR
VLGFFSGSRFIPILVSFSSMILAVFMFMFWPFVQFGISKVGVLVEATGYVGTFIYGVFLRMIGPFGLHHIFYLPFWTTGL
GGSEIINGRLVEGTQNIFFAELASQGTGKFFVGTSRFMSGRFITMMFGLPGAALAIYRLAKPSQKAKVFGLLCSSAFTSF
LTGITEPLEFSFLFVAPVMYVSHAIFDGLAFMLAHILQITIGQTFSGGFIDFILFGILQGNSRTNWILVPVVGFFWFFLY
YFAFTFLITKFNYQTPGRGDIIESKNIPLSNADGKEINIAFQVIKGLGGFDNIVELDCCATRLRVTVKDSVKVLKNILES
TGAKGVIIRGSGVQVIYGPGVSVLKNEIEEIMGN

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
ef0067 AAM75272.1 EF0067 Not tested Not named Protein 1e-85 45
APECO1_2642 YP_859416.1 PTS system, glucose-specific IIBC component Not tested Not named Protein 6e-75 41