Gene Information

Name : hslU (L144_01455)
Accession : YP_008407479.1
Strain : Borrelia burgdorferi CA382
Genome accession: NC_022048
Putative virulence/resistance : Unknown
Product : ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU
Function : -
COG functional category : -
COG ID : -
EC number : -
Position : 303775 - 305121 bp
Length : 1347 bp
Strand : -
Note : COG1220 ATP-dependent protease HslVU (ClpYQ), ATPase subunit

DNA sequence :
ATGAATAAATTAGAAGAGCACTATATAGTTCCCAAAGATGTAGTTGCAGAACTTGATAAATATATAATAGGTCAAGACGA
AGCTAAAAAATTAGTATCAATTGCTCTTGTTAATAGATATATAAGGTCTAGGCTTCCAAAAGAAATAAAAGATGAGGTAA
TGCCTAAAAACATTATTATGATTGGATCAACTGGCATTGGGAAGACCGAGATTGCAAGAAGACTTTCTAAATTAATTAAA
GCTCCTTTTATTAAAGTTGAGGCTACAAAATATACTGAGGTTGGTTATGTTGGTCGTGATGTTGAATCTATGGTTAGAGA
TTTAATGAGCATTGCAGTTAATATGGTAAAAGAAGAGATGTATAGTACTGTAAGAGATGATGCTTTAGTAAGAACAGAGG
AGAGAATAGTTGATAGTCTTTTTAAGGGATCTAGTAATTCTGAGAATATGGATCCAAATGAAATAAAGGCGGAAGAAAAG
GTAAAAGAGAAGCTTAGAAAAAAGCTTAGAGCAGGTGAGCTTGATGATACTACTATTGAAATACAAATTTCTAGTAAAAT
GCCATTTTCTACAATAGAAATATTTACGGGTGGTAATTTTGAAGAGATTGATATGGGAATTGGCGGTTTGCTGGGTAATA
TATTTGATAGAAAAAAGAAAAGAGAATTGAAGATTAAAAAAGCAAAGGAAATAATATTAGCAGAAGAGCTTGAGAAATTG
GTCGATCACGAAAACATTTCAGATATTGCAAAATCTAAAGTTGAAAATATGGGAATTATTTTTATTGATGAGATCGATAA
AATAGCTGCTAAGAATAGGAGTGGCAATGATGTGTCCAGAGAAGGTGTTCAAAGAGATATTTTGCCAATTATTGAAGGTT
CTAAAGTTAATACAAAATATGGAATAGTTGATACTTCTCATATTTTATTTATTGCAGCAGGAGCATTTAATTTAGCTAAA
CCTTCTGATTTAATACCCGAGCTTCAAGGAAGATTTCCTATTAAGGTTGAACTTAAGAGCTTAAGCATAGACGATTTGAA
AAAAATTTTAAAACAAACAAAAAATTCTTTAATAAAACAATATGTTGCGATGTTTAAGGTTTATGATTTAGATTTAAAGT
TTAGTGAGGAAGCTATAGATAGAATTGCAGAGCTTACTTTTAATATGAATCTTGAGAGTGAAAATCTTGGTGCCAGAAGA
CTTCACGGTGTTATGGAAATAGTGCTTGCAGATCTTTTTTTTGAAGTGCCTGGCAGTAAGTTGAAAAAATTTGAAATAAA
CTTGGACTATGTTAATAAAAAAATACAAATTAACGAACAAAAAGATTTGAATTATTATATAATTTAG

Protein sequence :
MNKLEEHYIVPKDVVAELDKYIIGQDEAKKLVSIALVNRYIRSRLPKEIKDEVMPKNIIMIGSTGIGKTEIARRLSKLIK
APFIKVEATKYTEVGYVGRDVESMVRDLMSIAVNMVKEEMYSTVRDDALVRTEERIVDSLFKGSSNSENMDPNEIKAEEK
VKEKLRKKLRAGELDDTTIEIQISSKMPFSTIEIFTGGNFEEIDMGIGGLLGNIFDRKKKRELKIKKAKEIILAEELEKL
VDHENISDIAKSKVENMGIIFIDEIDKIAAKNRSGNDVSREGVQRDILPIIEGSKVNTKYGIVDTSHILFIAAGAFNLAK
PSDLIPELQGRFPIKVELKSLSIDDLKKILKQTKNSLIKQYVAMFKVYDLDLKFSEEAIDRIAELTFNMNLESENLGARR
LHGVMEIVLADLFFEVPGSKLKKFEINLDYVNKKIQINEQKDLNYYII

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
hslU YP_003728753.1 heat shock protein HslU Not tested cag PAI Protein 5e-73 47