|
Name : tssN (BB2000_0808) Accession : YP_008397365.1 Strain : Proteus mirabilis BB2000 Genome accession: NC_022000 Putative virulence/resistance : Unknown Product : TssN Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 920271 - 923819 bp Length : 3549 bp Strand : - Note : matching_protein_id: YP_002150502.1; similar to IcmF; matching_locus_tag: PMI0736 DNA sequence : ATGAAATTACCGGTTTTCTCCATTTCAAACATTACGAGTTCGGTAAAAAAACTCTTTTTTGCTGATAAATCTAAAATTGC CTCCTTTTTGCTATTTTTATTGGCATTACTTCCCGCTTTGCTCATTATTTGGATCTGGTGGTGGGGGCCAACATTTCGTT ATCAAGATTCCATACCGTTTAGCGAGGTCACCACACGTTGGTTAGCAACCGTCGTTATTGTATTGCTTGTTGTGAGTTGG ATTGGTCTAGCAACATGGCGTCGAGTTAAAAAATTGGAAGCATTAAAACTTGATGTCGAATTAGCTGTAGTTGATCCGGT AAGACAAGATCTTGATTTTCAAAAACGTTATTTAAACTATTGGAAATCACAATTTATTCGTCACTTAAATGGTCATACTA AAGCGGTTTATTTACGCCCTTGGTATTTTGTTTTAGGTGCTAACCAAAGTGGAAAGCATAGCTTATTAAAAAATACGGTA AACCCATTAGATATTGCGCCTAGCGACAATATTGTTAACGAACAAAATATTGCATTAAATATTCAATGTCTATTAACCGA CAATGCTGTACTTTTTGTCCCTAATGGTGATCTATTAACCCAGCCGGCAAATCAGGCTGATAAACCTCAACTTTATCACC GTTTGTGGGGCGATTTACTCAATTGGATCAAAACTAACCGCCCAAGACAACCAATGAATGGCATCGTCTTAACTGTCGAT ACCCTATCGTTATTAACCAATAGTAAGGAGCAAAATAGTCAGCTACTTGCTGATTTACAAATGCGTATTGAAGAAATACG CATGACATTTAATAGTCGCTTGCCTTTATATATCGTCTTAACCAAGCTAGATCTATTACGTGGTTTTGACTCAATGTATC AATCATTAGATGTTCAACAACGTAATGAAGTATTAGGTGTTTCTTTCAACCAGAAAGCAAAAAGTAATTGGAAAAAGGAA TTAAATCATTTTTGGTCACAATGGGTAGGCCAAATGAACAGCGCATTACCAGAAATGATGCTACAAAGAGCAGAAGGTAA CCAGCGTAGTGATCTATTTAGTTTCGTGCGCCAAATTGAAGGGTTACAACATTCTGTATGCACATTAATTGATGCATTGC TCATCAATAATGAGCAACATAATATCTGTTTAAGAGGGGTTTATTTAACTTCTGCATTGCAAATCGGTCAAATCGATGAT GTGTTTAGCCAAACAGCGTCCGAACAATATCATTTACCAACAGCACCTCTTACTACATGGCCAATTAATGATAGCCACCC TTATTTTACTACCCAATTATTTAGTCAAGTGCTATTTAGTGAGCCTAATATTGCAGCAGAAAACCATTATTGGGTTAAAA AACATCGGACTCGCCTATTAGTCACCACTGCTGTTAGCTTTGTCGGCTTAATCGCAATTTGGAATGGTTGGAGCCACTAT TACGACAAAAACTATCGTGCTGGAGAAAACGTTCTTAATGAGGTAAAAGCATTCCGTGCTATTGAGAACAATGCTCAGAA AGATACTGATGGTAGCCTACAATTACCGGTGCTCAATCCATTACGTGAAGCAACCTTAGCTTATGGTAATCATCGTGATA AAAATGTGCTCTTTTCTGATATGGGTCTTTACCAAGGTCAAAAAGTAGGCCCACAAGTTGAACAAGTCTATTTACAACTA CTCACCGATCGCTTTTTACCTGCGGTTATGTCTGGGTTGTTAAATGAACTTAACAGTGCCGATAAAGGAAGTGAAGATAA GTTAGAGATATTGCGTATTATGCGCATGTTAGAAGATAAAAGTGGCCGTAATAATGGCATGGTAGAAGATTTTATGGCTG ATTATTGGAGCCAACTGTTCACTGGTCAACGTGAAAAACAACTGCAACTAAAAGCCCATTTGCGCTATGCCCTTGAGCAC ACAGATTGGAAACAAGAGCGTGAAAAAGGGTTTGTTTCAGCCACTAAAGCCTTTATGCCTTTTGCTGGACCTATAAAAAA TGCACAAGCAGAGTTAAGTGTATTGTCACTTTATCAGCGTGTATATCAAGCCTTACGCTTAAAGGCTAATCAAGAGCTTT CAGCGCCTTTAAATTTACAACATCAAATTGGCCCAAGTTTTAATACGGTCTTTACGGCTATTGATGATGATAAATTAGAA ATTCCACAATTCTTAACGCGCTCAGGGTTATTAAACTATTTTATCCGCCAAAATGATAAATTGGTCGAGCTAACATTACT TGATGCTTGGGTTCTTAATCTAACCACCAACACACAATATAGTGAAAGTGATCGTAAAGAAATTCAGCGTCAAATCAGTG AACAATATCTTAGTGACTATACGGCTCAATGGCGTAATGCCATGAGCAATTTAGAAATTCGTCAATTTGATTCAATACAA GATGAAATTACCGCTCTTGAGCAAATTATTAGTGGTGAACAACCATTACGCCGAGCATTACAAGTTCTACGTGATAACAC GGTTATTCCAACTATTGATGAAAATTTACCACTTGATGAACAAAAAACACTGATGGCTGAGCCATCTTACCGTTTATTAA CCCGCTTAGATCGCGAATTTACTCCTCAAACTGAGATATTAGTCAGTAACCAAGGGGAAAATTTACAGAATCTGAATCAA AAACTAAATGACTTACATCGTTACCTATTGGGGATCCAAAACTCTCCAGTGCCGGGGAAAGCGGCGCTTAAAGCAGTTTC GATGCGCTTAAACGATAATAATCGCGACGCTATTTTTGAGCTATCACAAATGGCGAAAACATTACCAGAGCCGCTTAACC GCTGGGTCGATGAGTTATCAGTGCAAGCATGGAATGTGGTCCAAAAAGAAGCTATTCGTTATATGGAAGTAGAATGGAAT GAAAATGTTGTCAAACAATACAATACTTATATTGCCGGTCGTTATCCATTTAACCCAGCAGCTAAACAAGATGTTCCTTT AAGTGAATTTGAACGTTTCTTCAAACCAAATGGAACATTAGATAGCTTCTATCAACAAAATCTGCGTTTATTCGTTGAGA ATAACTTAGTTAACGATAGTGATAGCCAATCATTGATCCGCGCTGATGTATTAGCACAAATTGAAATAGCCAATCGTATT AGAGAAACCTTCTTTAATGCCCAAGGTAATTTAGAAGCACAATATGCTATTGAGCCACTGTCATTAAGTGGTAATAAGCG TCGTAGCATCTTAAATCTTGATGGACAATTGATTGATTACGCTCATAGTCGCAGCCATGTGACACACTTGGTATGGCCAA ACTCAATGCGTTCCAATATTGAAAGTAAACTGACTTTAGTGCCTCTTTCCGGTGATAAATCGCCACGTTCAATCAGTTTC TCTGGGCCATGGGCACAAATGCGATTAGTTGATAATGCAAAACTCATTAATATCAAACCTAACTCATTCGATATTCGCTT CACAATCGACGGTGGTGATATGACTTATCGAGTTATAGTTGATGAATCTAATAATCCTTTCTTCGGTGGATTATTCACAA AATTCCGTTTACCTGAAACGCTTTATTAA Protein sequence : MKLPVFSISNITSSVKKLFFADKSKIASFLLFLLALLPALLIIWIWWWGPTFRYQDSIPFSEVTTRWLATVVIVLLVVSW IGLATWRRVKKLEALKLDVELAVVDPVRQDLDFQKRYLNYWKSQFIRHLNGHTKAVYLRPWYFVLGANQSGKHSLLKNTV NPLDIAPSDNIVNEQNIALNIQCLLTDNAVLFVPNGDLLTQPANQADKPQLYHRLWGDLLNWIKTNRPRQPMNGIVLTVD TLSLLTNSKEQNSQLLADLQMRIEEIRMTFNSRLPLYIVLTKLDLLRGFDSMYQSLDVQQRNEVLGVSFNQKAKSNWKKE LNHFWSQWVGQMNSALPEMMLQRAEGNQRSDLFSFVRQIEGLQHSVCTLIDALLINNEQHNICLRGVYLTSALQIGQIDD VFSQTASEQYHLPTAPLTTWPINDSHPYFTTQLFSQVLFSEPNIAAENHYWVKKHRTRLLVTTAVSFVGLIAIWNGWSHY YDKNYRAGENVLNEVKAFRAIENNAQKDTDGSLQLPVLNPLREATLAYGNHRDKNVLFSDMGLYQGQKVGPQVEQVYLQL LTDRFLPAVMSGLLNELNSADKGSEDKLEILRIMRMLEDKSGRNNGMVEDFMADYWSQLFTGQREKQLQLKAHLRYALEH TDWKQEREKGFVSATKAFMPFAGPIKNAQAELSVLSLYQRVYQALRLKANQELSAPLNLQHQIGPSFNTVFTAIDDDKLE IPQFLTRSGLLNYFIRQNDKLVELTLLDAWVLNLTTNTQYSESDRKEIQRQISEQYLSDYTAQWRNAMSNLEIRQFDSIQ DEITALEQIISGEQPLRRALQVLRDNTVIPTIDENLPLDEQKTLMAEPSYRLLTRLDREFTPQTEILVSNQGENLQNLNQ KLNDLHRYLLGIQNSPVPGKAALKAVSMRLNDNNRDAIFELSQMAKTLPEPLNRWVDELSVQAWNVVQKEAIRYMEVEWN ENVVKQYNTYIAGRYPFNPAAKQDVPLSEFERFFKPNGTLDSFYQQNLRLFVENNLVNDSDSQSLIRADVLAQIEIANRI RETFFNAQGNLEAQYAIEPLSLSGNKRRSILNLDGQLIDYAHSRSHVTHLVWPNSMRSNIESKLTLVPLSGDKSPRSISF SGPWAQMRLVDNAKLINIKPNSFDIRFTIDGGDMTYRVIVDESNNPFFGGLFTKFRLPETLY |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| pmt1 | AAN64194.1 | Pmt1 | Not tested | macrophage toxin pathogenicity island | Protein | 0.0 | 56 |
| aec30 | AAQ96724.1 | Aec30 | Not tested | AGI-1 | Protein | 0.0 | 49 |
| aec30 | YP_851415.1 | hypothetical protein | Not tested | PAI II APEC-O1 | Protein | 0.0 | 49 |
