Gene Information

Name : hemC (SSDC_00860)
Accession : YP_008343807.1
Strain : Candidatus Profftella armatura DC
Genome accession: NC_021885
Putative virulence/resistance : Unknown
Product : porphobilinogen deaminase
Function : -
COG functional category : -
COG ID : -
EC number : -
Position : 202661 - 203608 bp
Length : 948 bp
Strand : -
Note : COG0181 Porphobilinogen deaminase

DNA sequence :
TTGAAAACTTCTTTTCTTTCTAAGTTAATTATTGCCTCTCGAAAAAGTAGATTAGCTATATGGCAAGCAGAATATGTTCG
AAAAAAAATCATTGAATTATATCCATGGTGTAAAGTAGAAATACTTGGTATAACAACAAAAGGTGATAAAATTTTTGAAA
AAGTTCCATTAAAAATAAATGAAAAGGGATTATTTACTAAAGAATTAGAGATGGCAATAATTAAGGGTAAAGCTGATTTA
GCGGTACATTCATTAAAAGATATACCTATGAATTTGCCAAGTGGTTTTATACTTTGCGCTATTTTAAAAAGAGAAGATCC
ACGTGATGCGTTTATATCAAATGATTATATTTCTTTATCTACTTTACCTAAAAATGCAGTAGTTGGAACTAATAGTTTAC
GTAGAAAGGTTTTAATAAAATCATTTTTTCCTTCACTAATAATTAAATCATTACGAGGTAATATCGACACTCGACTTAAT
AAATTAGATAAAGGTGAATATGCAGCTATTATTTTAGCAGCAGCCGGTCTTAAAAGATTAAATTTACAAAAAAGAATACG
TATGTTATTTAGTCCGAATCAAATTTTACCGGCTCCTGGACAAGGTGCTATAGCAATTGAAATTTTAGATAATCGTAAAG
AATTAATGGAAATGTTAATACCATTAAATCACTATTTTAGTGAGCAAACCGTGAAAGCTGAGCGTGCTGTATCTCGTAAT
TTTAATGGAAGTTGTAAAATTTCGTTAGCAGCATTTGCTATGGTAAATAATTTCAATGAATCTGAAATCAATTTAAGAGC
CATAATAACTAATCCTAATGGATTAAAAATAATAACAGCAGAAGTTAATGGTCCTATTGACACACCAGAAACTGTAGGAC
TGTATGCAGCAGAATTATTAAAAAAAAAAGGTGCAATAGAAATTATAAAATCATACGAAAAAAAATAA

Protein sequence :
MKTSFLSKLIIASRKSRLAIWQAEYVRKKIIELYPWCKVEILGITTKGDKIFEKVPLKINEKGLFTKELEMAIIKGKADL
AVHSLKDIPMNLPSGFILCAILKREDPRDAFISNDYISLSTLPKNAVVGTNSLRRKVLIKSFFPSLIIKSLRGNIDTRLN
KLDKGEYAAIILAAAGLKRLNLQKRIRMLFSPNQILPAPGQGAIAIEILDNRKELMEMLIPLNHYFSEQTVKAERAVSRN
FNGSCKISLAAFAMVNNFNESEINLRAIITNPNGLKIITAEVNGPIDTPETVGLYAAELLKKKGAIEIIKSYEKK

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
BJAB07104_00327 YP_008207792.1 Porphobilinogen deaminase Not tested AbaR25 Protein 6e-55 44
BJAB0868_00331 YP_008211657.1 Porphobilinogen deaminase Not tested AbaR26 Protein 6e-55 44