|
Name : lctP (A7H1H_0034) Accession : YP_008330003.1 Strain : Arcobacter butzleri 7h1h Genome accession: NC_021878 Putative virulence/resistance : Unknown Product : L-lactate permease Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 44528 - 46168 bp Length : 1641 bp Strand : - Note : Pfam match to PF02652.9 Lactate_perm DNA sequence : ATGCAAACTTGGCAACAAGTATATGCACCAATTGGAGGAAGTTTAGGTTTATCTGCACTTGTAGCACTAATTCCTATCGT TTTTTTCTTTTTGGCGCTTGCAGTATTTAGAATGAAAGGTCACTATGCAGCAATCATTACATTAGCATTATCGATGATTG TAGCAGTTTTTGGATTTGAAATGCCAGTTAATATGGTATTTGCATCTGCTGAATATGGTTTCTTATTTGGTTTATGGCCA ATCGCTTGGATTATTGTCGCATCAGTATTCTTATACAAATTAACTGTAAAAAGTGGACAATTTGAAATTATTAGAAATTC GATTATTTCAATAACTGAAGATCAAAGAATTCAAGTTATCTTAATTGGTTTCTCATTTGGTGCTTTTTTAGAAGGTGCTG CTGGTTTTGGTGCACCTGTTGCAATTACAGCTGCAATTTTAGTAGGACTTGGATTTAAACCATTATATGCAGCTGGATTG TGTCTTATTGCAAATACAGCACCTGTTGCTTTTGGAGCACTTGGAGTTCCAATTATTGTTGCAGGACAAGTAACTTCAAT TGATGCTTTTACAATTGGAGCAATGGCAGGTAGACAGTTACCACTATTATCTTTAATTATTCCTTTATGGCTAGTTGCAA TGATGGACGGATGGAAAGGTATAAAAGAAGTTTGGCCAGCAGCTTTAGTTGCAGGTGCAAGTTTTGCTATTTCTCAATAT CTTACTTCAAATTTTATAGGTCCTGAATTACCAGATGTTACTTCTGCTATAGTTTCTATCGTTGCAACAACAGTATTTTT AAAATACTGGAAACCAAAAAATGTTATGAAAACAGTAGAATTAGATGAGGTTGTTTCATCATCACATACAAGTGCTCAAG TATTTAAAGCATGGTCTCCATTTATTATTCTTTCTGTAATGGTTACAATTTGGACAACAGGTTGGTTTAAAGCCTTTTTT GCAAAAGGTCAAGTTTTAGCAAGTACTATTTTCAAATTTGAATTCTCTGCTATTCATAATATGATTTTCAAAATGCCTCC AATTACTAGTGCACCAAAATCTTTTGATGTTGTATATACATTTAATCCTATTTCAGCAACAGGTACAGCTATTTTCTTAA CAGCTATTATCACTTTATTTATTTTTAGATTAAATATATCAACTGCTACAAAAACAATGGGTGAAACACTATTTGAATTA AAATGGGCTATCGTATCAATTGGTATGGTTCTTGGTTTTGCATTTGTAATGAACTATTCAGGTATGTCTTCAACTATGGC ATTAGTTTTAGCAAATACAGGTTTCTTATTCCCTTTCTTCTCTCCGTTTCTTGGATGGCTTGGAGTATTCTTAACAGGTT CAGATACTTCATCAAATGCACTTTTCTGCGGATTACAACAACAAACTGCTCAACAATTAGGACTTAATGAAACATTAATG GTTGCAGCAAATACAACTGGTGGGGTTTGTGGAAAAATGATTTCTCCTCAATCAATTTCTATTGCTTGTGCATCAACAGG AATTGTTGGAAAAGAGTCTGATTTATTTAGATTTACAGTTAAACATAGTTTAATTCTTGTAGTAATTATGGGACTTATAA CTATGACTCAAGCTTACGTTTTAACATGGATGATTCCATAA Protein sequence : MQTWQQVYAPIGGSLGLSALVALIPIVFFFLALAVFRMKGHYAAIITLALSMIVAVFGFEMPVNMVFASAEYGFLFGLWP IAWIIVASVFLYKLTVKSGQFEIIRNSIISITEDQRIQVILIGFSFGAFLEGAAGFGAPVAITAAILVGLGFKPLYAAGL CLIANTAPVAFGALGVPIIVAGQVTSIDAFTIGAMAGRQLPLLSLIIPLWLVAMMDGWKGIKEVWPAALVAGASFAISQY LTSNFIGPELPDVTSAIVSIVATTVFLKYWKPKNVMKTVELDEVVSSSHTSAQVFKAWSPFIILSVMVTIWTTGWFKAFF AKGQVLASTIFKFEFSAIHNMIFKMPPITSAPKSFDVVYTFNPISATGTAIFLTAIITLFIFRLNISTATKTMGETLFEL KWAIVSIGMVLGFAFVMNYSGMSSTMALVLANTGFLFPFFSPFLGWLGVFLTGSDTSSNALFCGLQQQTAQQLGLNETLM VAANTTGGVCGKMISPQSISIACASTGIVGKESDLFRFTVKHSLILVVIMGLITMTQAYVLTWMIP |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| glcA | CAE85240.1 | GlcA protein, putative glycolate permease | Not tested | PAI V 536 | Protein | 1e-133 | 65 |
