Gene Information

Name : dapB (A7H1H_2028)
Accession : YP_008331905.1
Strain : Arcobacter butzleri 7h1h
Genome accession: NC_021878
Putative virulence/resistance : Unknown
Product : dihydrodipicolinate reductase
Function : -
COG functional category : -
COG ID : -
EC number : 1.3.1.26
Position : 1971259 - 1972032 bp
Length : 774 bp
Strand : -
Note : Pfam matches to PF05173.9 DapB_C, and to PF01113.15 DapB_N

DNA sequence :
ATGGTTAAAATAGGTATTTTAGGAAGCACTGGAAGAGTTGGTTCACTATTAATTGATGATTTACAAAATGATAAAGATGC
TAGATTATCAGCAGTTCATGTTACTAGCAAGTTATTAAAAAGTTTGCCACAAGATACAATTGTTACAAATGATATAAAAG
TTTTATTCGATTCTTGTGATGTAATTATTGATTTTAGTAAACCTTCTGGAACAGAAGCTCTTTTGACTGAAGTTATTGAA
AATGGTGCAAAAAAACCATTGGTGATTGCAACAACTGGATTAAATAAACATCAGCAAAATTTGTTGCTTGAAGCTAGCAA
ATTAGTACCTATTTTATATGCAACTAATATGAGTTTAGGAGTTGCTGTTTTAAATAAACTTGTAACTTTAGCATCTAAAA
CTTTAAGAGATTTTGATATTGAAATTGTTGAACAACATCATAGACATAAAATTGATGCACCTTCTGGAACAGCTTTAACT
TTAGCTGAACATGCAGCAAGTGCAAGAGATTTAAACTTGGATGATGTAAGAATTTCTGGACGTGATGGAAATATTGGTGC
TAGAACTAAAGATGAAATTGCTGTTATGGCATTAAGAGGTGGAGATATAGTAGGACGACATACAGTTGGTTTATACAATG
ATGGAGAATTCTTAGAATTAAATCATACAGCAACTGCAAGAAATACTTTTTCTAAAGGTGCAATTAAAGTTGCTAAATGG
ATTGTAGGAAAAGATGCAAGATTATACTCAATCAATGATGCTTTAGGTCTATAA

Protein sequence :
MVKIGILGSTGRVGSLLIDDLQNDKDARLSAVHVTSKLLKSLPQDTIVTNDIKVLFDSCDVIIDFSKPSGTEALLTEVIE
NGAKKPLVIATTGLNKHQQNLLLEASKLVPILYATNMSLGVAVLNKLVTLASKTLRDFDIEIVEQHHRHKIDAPSGTALT
LAEHAASARDLNLDDVRISGRDGNIGARTKDEIAVMALRGGDIVGRHTVGLYNDGEFLELNHTATARNTFSKGAIKVAKW
IVGKDARLYSINDALGL

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
HP0510 AAR03941.1 HP0510 protein Not tested cag PAI Protein 6e-46 45