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Name : amt (A7H1H_1142) Accession : YP_008331074.1 Strain : Arcobacter butzleri 7h1h Genome accession: NC_021878 Putative virulence/resistance : Unknown Product : ammonium transporter Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 1082795 - 1084114 bp Length : 1320 bp Strand : + Note : Pfam match to PF00909.16 Ammonium_transp DNA sequence : ATGAAAAAGTGGGTTTTATTAACTTCACTAATGAGTTCTTTAGCTTTTGCTGAAGAAGTAACGGAGCCAGCTGTATTAAA TACAGGAAATACTGCTTGGATGATGATGTCAACTGCATTAGTATTACTAATGACACCAATTGGTTTAGCTTTATTCTACT CTGGTATGACAAGAGTAAAAAATGTTTTAAATACTTATTTAATGGTATTTGGTGCTTTTACTATAGCATTTATTGCATGG GTTGTTGCAGGTTTTTCAATCGCATTTGGAACAGTAGAGGGATCATTAAATGAATTCATTGGTGGATTTTCTCACATAAT GTTAAGTGGTATTAGTTGGTCTGACCTTTCAGCTGACTCTGGAGAAACATATCCAAAGTTTGTATTCATTGTATTTCAAG GTACTTTTGCAGCTATTACAATAGCAATTGCAGCTGGTTCAGTTATTGAAAGAATGAAGTTTTCTACTTGGATGATTTTT GCATTTATTTGGACGATAGTTGTTTATGCTCCAATTGTACACATGGTTTGGGGTGGAGGATACCTATTTAATGAAGGTGC TTTAGACTTTGCTGGTGGAACAGTTGTTCATATGAATGGTGGTTTAGCTGGTTTAGTTCTTGCAATTTTACTTGGTAAAA GAAATGATTATCCAAGAACTGCGATGAAACCTGCAAGTATCATCTTAACAGCTGTTGGTGCAGGTTTATTATGGTTTGGA TGGTATGGATTTAACGGTGGTTCAGCATTTGGTGCAAATGAAATAGCTGGTCTTGCTTACCTTACAACAACTATAGCAAC ATCAATTGCAGCTATTACTTGGTTGATTATTGAAACAATTATATTTAAAAAAGCTACTCTTTTAGGTGCAGCTTCAGGTG CAATAGCAGGTTTAGTAGCTATTACTCCAGCAGCAGGATTTGTTGATGTTAGTGGTTCTTTAATAATAGGTATAGTTGGT TCTATTGTAGCATTCTTCGGGGTTGCTATGTTGAAGAAAAAACTTGGATATGATGATAGTTTAGATGCATTTGGTATTCA CTTCCTTGCTGGTATGTGGGGAGCAGTTGCAACAGGAATCTTTGCTCTAAATGATAAAGATCTTTTATGGGATGGTCCAT TAAAAGATGCTGATGATAGATTAGCTCAAATTTTTGTTCAATTTGAATCAATAGTAGTTGTAGGTATCTATACATTAATT GGAACAATAGTTGTTTACTATATAGCTTCAATGTTAACAAAAGGTGCAAGAGTTACTGAAGAAGAAGAAAGACAAGGTCT TGATGAGTCGTTACACGGTGAACGTGGATTTAACCTATAA Protein sequence : MKKWVLLTSLMSSLAFAEEVTEPAVLNTGNTAWMMMSTALVLLMTPIGLALFYSGMTRVKNVLNTYLMVFGAFTIAFIAW VVAGFSIAFGTVEGSLNEFIGGFSHIMLSGISWSDLSADSGETYPKFVFIVFQGTFAAITIAIAAGSVIERMKFSTWMIF AFIWTIVVYAPIVHMVWGGGYLFNEGALDFAGGTVVHMNGGLAGLVLAILLGKRNDYPRTAMKPASIILTAVGAGLLWFG WYGFNGGSAFGANEIAGLAYLTTTIATSIAAITWLIIETIIFKKATLLGAASGAIAGLVAITPAAGFVDVSGSLIIGIVG SIVAFFGVAMLKKKLGYDDSLDAFGIHFLAGMWGAVATGIFALNDKDLLWDGPLKDADDRLAQIFVQFESIVVVGIYTLI GTIVVYYIASMLTKGARVTEEEERQGLDESLHGERGFNL |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| BJAB07104_00287 | YP_008207752.1 | Ammonia permease | Not tested | AbaR25 | Protein | 1e-54 | 49 |
| BJAB0868_00291 | YP_008211617.1 | Ammonia permease | Not tested | AbaR26 | Protein | 1e-54 | 49 |
