Name : N134_05935 (N134_05935) Accession : YP_008326474.1 Strain : Lactobacillus reuteri TD1 Genome accession: NC_021872 Putative virulence/resistance : Unknown Product : preprotein translocase subunit SecA Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 1248666 - 1251020 bp Length : 2355 bp Strand : - Note : Derived by automated computational analysis using gene prediction method: Protein Homology. DNA sequence : ATGACGCACCCCAATTTTAGGTTACAAAAAGTAAAACATACCCTTGCTAAAGTAAATGCCCTGGCAAGTGAAATGCGAGG GATGAGCGATGAAGAACTTAAACATCAAACTGTTCTATTAAAAAAAGAACTAGCTAATGGTAAAACAGTTGATGATATCT TACCGCGGGCATTTGCGACCATTCGGGAAGCGGACTACCGGATTTTAGGAATGTTCCCGTATGATGTTCAAGTTATGGGA GCAATTGTCTTAAATCAAGGTAATATTGCAGAAATGAAGACGGGGGAAGGAAAGACTCTAACAGCAACGATGCCTTTGTA TTTGAATGCTTTAACCGGAAAGGGAACTTTTTTATTAACGCCAAATAACTACTTAGCCCAACGTGATAAAGAGCAATTAC AGCCAGTTTATGAATGGTTAGGATTAACGGTCAGTCTTGGTTTTGAGCCTGATGACCAAGAAAAGAAGACAACGCCGGCG ATTAAGCGGAGTTGGTATAATGCGGATATTACTTATACAACTGCTAGTAGTTTAGCTTTTGACTACTTGTTTAATAATCT TGCTACCCGGCGCGAAGATCAATATTTACGCCCATTTAATTATGTCATTATCGATGAAGTTGATGCGATTCTACTTGATG AAGCGACTTCACCTTTTGTAGTCTCAAGTATGCCGATGGTTCAATCAAATTTATATCAGTTAGCGGATGCTTTTATTCAT ATTTTACAGCCTAAAATTGACTATAGATTGAATGAAGATCATGATGCGGTATGGCTGACTCTTCACGGAATCCAACGTGC AGAACGTTTTTTTCGTATTCCAGATCTTTTTATAAGCGAATATCGGGAAATTTATCGTCATATTATCCTTGCTTTACGAG CACACTTTATTATGGAAAATGGTCATGATTATTTAGTTAGCGAAGGGGAAGTTGTTTTACTTGATGAGGCAAATGGGCGA CTGAAAAAAGGAGTAAAGGTCAGTACAGGGTTGCATCAAGCAATTGAAGCGAAAGAACACGTTGACCTTACGCCTAACCA ACAAGTGGCGGCATCAATTACCTTTCCTAGTCTGTTTGGTTTGTTTAATAAAATCGCTGGAATGAGTGGGACAGTCAAAA GTGATGAGCAAGAGTTCTCTGAAGTGTATAAGATGCGAGTTATCCAAATTCCCACTCGCAAAAAGGTAATTCGTAGAGAT TATCCAGAGCAAATTTATTTAACAACTCGTCAAAAGTTAATTCATGCTCTTGATGAGACAATAGAGCTTCATAAAGCAGG GCGTCCAGTTTTATTAGTGGCTGGTTCGGTAGAAAATTCAGAAATTATTTCTGAATTATTATTAGACCGTGGTATCTCTC ATAATGTTTTAAATGCATTTAATGTCGCCCGCGAAGCTGATATTGTAAAAGATGCTGGACAAAAAGGGGCGGTGACTGTT GCTACTAATATGGCGGGTCGTGGGACTGACATCAAGCTCGGAGTTGGCGTTAAAGAATTAGGCGGCCTTGCGGTAATTGG GACAGAAATGCTACCAGCGCGAGTAAAAATGCAATTAGCTGGTCGAGCTGGGCGGCAAGGTGATCCTGGTTCGAGTAAGT TTTATATTTCATTAGAAGATAGCTATCTTGCCAAAAACAGTACTAAACGGTTCAAAAATTATTATCGCCAATTACAAAAG AAAAAGACCGATAAACAGTTGCGTAGCCCCCGTTTAAAAATGAGTATCACAATGTTAAATGAACGGGTAGCTGCTAATCA ACAAATGGTACGTAGCAATGTTAATAAAAATGAAGCTGCATTAAAAATTCAGCGTAAGTATCTTTATGATCAGCGTGATC AGTTAATGAGAACCGCACATTTAGAAACAGAAGTTGGAAAATGGTTAAGCAGAGGGATTTCCCTTTACCTTACTGAAAAA GCAGAATGGAGTGCCCTAGAATTGCGGCATTTAATGAATCAACATTTTACTTATGATGTTGTTAGTTTGCCAGATACTCT AGAACTAAACCACAAAAAAATACAAAAATATTTAGAACGTTTTTGCCAAGAGAGGTTAGAACAGAAGGCTCAAGTATTAA TCAATAATGAACAATTAAATCAATTTTATCGTTCAGCCTTATTAAATGCGCTTGATAGTAGCTGGACTGATCAGATGGCT TATTTATCAAAACTATCAGTAATCGTCCAGCCATGGGCAACAGCACAACGGGACCCTAAGTTTATGTACCAAGAAAAGGC TTATCAAGCATTTGAAAAAATGTTTGATACTGTCGCTAAAAAAGTAGTTGATAATTTAATGTTAAGCACTATTAGATTGG ATAAAGATAATAATTTAATTGTTCACTTTAATTGA Protein sequence : MTHPNFRLQKVKHTLAKVNALASEMRGMSDEELKHQTVLLKKELANGKTVDDILPRAFATIREADYRILGMFPYDVQVMG AIVLNQGNIAEMKTGEGKTLTATMPLYLNALTGKGTFLLTPNNYLAQRDKEQLQPVYEWLGLTVSLGFEPDDQEKKTTPA IKRSWYNADITYTTASSLAFDYLFNNLATRREDQYLRPFNYVIIDEVDAILLDEATSPFVVSSMPMVQSNLYQLADAFIH ILQPKIDYRLNEDHDAVWLTLHGIQRAERFFRIPDLFISEYREIYRHIILALRAHFIMENGHDYLVSEGEVVLLDEANGR LKKGVKVSTGLHQAIEAKEHVDLTPNQQVAASITFPSLFGLFNKIAGMSGTVKSDEQEFSEVYKMRVIQIPTRKKVIRRD YPEQIYLTTRQKLIHALDETIELHKAGRPVLLVAGSVENSEIISELLLDRGISHNVLNAFNVAREADIVKDAGQKGAVTV ATNMAGRGTDIKLGVGVKELGGLAVIGTEMLPARVKMQLAGRAGRQGDPGSSKFYISLEDSYLAKNSTKRFKNYYRQLQK KKTDKQLRSPRLKMSITMLNERVAANQQMVRSNVNKNEAALKIQRKYLYDQRDQLMRTAHLETEVGKWLSRGISLYLTEK AEWSALELRHLMNQHFTYDVVSLPDTLELNHKKIQKYLERFCQERLEQKAQVLINNEQLNQFYRSALLNALDSSWTDQMA YLSKLSVIVQPWATAQRDPKFMYQEKAYQAFEKMFDTVAKKVVDNLMLSTIRLDKDNNLIVHFN |
Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
secA2 | YP_006310687.1 | preprotein translocase subunit SecA2 | Not tested | FWisland_3 | Protein | 2e-155 | 45 |