|
Name : tkt (STAIW_v1c06610) Accession : YP_008311576.1 Strain : Spiroplasma taiwanense CT-1 Genome accession: NC_021846 Putative virulence/resistance : Unknown Product : transketolase Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 625845 - 627812 bp Length : 1968 bp Strand : - Note : - DNA sequence : ATGAACAAAAACAATAAAAATTTAAATGCATTACGTATTCTTGGAGTTGAAGCTGTAAACAAAGCTAATTCAGGTCACCC AGGAATTATTCTTGGTGCAGCACCAATTGTTTATTCATTATTTACAAAGATAATGAACATTAATCCTAAAAACCCGACTT GATTTAATAGAGATAGATTCGTGTTAAGTGCAGGTCATGGAAGTGGATTATTATATAGTGCATTACATTTATCAGGTTTT GATTTATCAATTGAAGATTTAAAACAATTTAGACAATTAAACTCAAAAACACCAGGTCACCCTGAATTTCAACATACTCC AGGAGTTGAAGCAACAACAGGTCCTTTAGGACAAGGATTTGCAATGGGAGTTGGAATGGCACTTGCAGAAAGTCATTTAG CTGCAAAATATAATCAAAAAGATTTAGAAATAATAAATCACTTTACATATGTTTTATGTGGAGATGGAGATTTACAAGAA GGTGTTTGTCAAGAGGCAATTAGTTTTGCAGGAAGATATAAATTAAATAAATTAATTGTTATTCATGACTCAAATGATAT TCAATTAGATGCACCAGTAAATGTTGCACAAAGTGAAAATATTGCTGATCGCTTTAAAGCAGCAGGTTGAAATACTTTAA GAATTGATAATGGTGAAGATTTAGAAAACATTGTTAAATCAATAGAAAAAGCTCAAAAAAATGATAAACCAACATATATT GAGGTAAAAACAATAATTGGAATTGGTGCAACAAATCAAGGAACTGTAAAAGTTCATGGTGCTGCGTTAGGTGAAGATAT TAAAGTAGTTAAAGACTATTTTAATTGAAATGAATCAGATTTTAGTATTCCAAGTGATGTATATAATTTTTATAAAGAAA ATGTTTTAAATAGGGGAGTTGAATCAAATAAAAAGTGAAACGATTTATTTGAAAAATATCAATTAACCTTTCCACAATTA GCAACTCAACTTTTAAACTCAATCAATAAAGAATGAGATATTGATATTGATCAATTAATGAATTTAAATGAAAAACAAGA ACAAGCAACAAGAGTTTCTTCATCAAATACTTTTAATTGATTGAGCAAAAATATTTCAAGTATAATTGGGGGAAGTGCAG ACTTAAGCGAATCAACAAAAATTAAAGGTGCTGATGGCAATTATGATTTTAATAATAAAACAGGCAGAAATATTATGTAT GGTGTAAGAGAATTTGCTATGAGTGCAATTAATAATGGAATTGCATTACATACTGGTCTTTTACCAATTGCATCAGGTTT CTTTGTTTTTGCAGATTATTTAAAACCAGCGTTAAGAATGAGTGCAATTATGAAAATTCAAACACTTTCAGTATTTACAC ATGATTCAATAGCTGTTGGAGAAGATGGGCCAACTCATCAACCAATTGAACAACTTGCAATGCTTAGAAGTATACCAAAT ATAAGTGTTTATAGACCTTGTGATATGGCAGAAACTCTTGCTAGTTATTATTGTGCTTTAAATAATAAAACAAAACCAAG TGTTATTGTAGCTACTCGTCAAAATTTAAAAGAGCTTGATCATTCAAAAGATATTTTAAATGAAGTAAAAAAAGGAGCTT ATTTAATTTCAAAATCACAAAATGCAGATATAACTCTAATTGCATCAGGAAGTGAAGTTCAACTTGCATTAGAAATTAAA GAAATTTTGGAAAATAAAAATCATAAGGTAAATGTTGTTTCAATGGTAAATATGAATGAATTTTTACTTCAATCAAAAGA ATATCAAAATCAAATAATTGATAAAAATACAAAAAGATTTTCAATAGAATTATCATCAACTTTTGGTTGACACCAATTTT TAGGTGATAGTGGAGTAGCATTTGGTGTGGATACATTTGGTTATTCAGCACCATTTAATGATGTTTTAAAACATATTAAA TTTGATGCACAAAATATTTCACAAGAAATTTTAAATAGTATTGATTAA Protein sequence : MNKNNKNLNALRILGVEAVNKANSGHPGIILGAAPIVYSLFTKIMNINPKNPTWFNRDRFVLSAGHGSGLLYSALHLSGF DLSIEDLKQFRQLNSKTPGHPEFQHTPGVEATTGPLGQGFAMGVGMALAESHLAAKYNQKDLEIINHFTYVLCGDGDLQE GVCQEAISFAGRYKLNKLIVIHDSNDIQLDAPVNVAQSENIADRFKAAGWNTLRIDNGEDLENIVKSIEKAQKNDKPTYI EVKTIIGIGATNQGTVKVHGAALGEDIKVVKDYFNWNESDFSIPSDVYNFYKENVLNRGVESNKKWNDLFEKYQLTFPQL ATQLLNSINKEWDIDIDQLMNLNEKQEQATRVSSSNTFNWLSKNISSIIGGSADLSESTKIKGADGNYDFNNKTGRNIMY GVREFAMSAINNGIALHTGLLPIASGFFVFADYLKPALRMSAIMKIQTLSVFTHDSIAVGEDGPTHQPIEQLAMLRSIPN ISVYRPCDMAETLASYYCALNNKTKPSVIVATRQNLKELDHSKDILNEVKKGAYLISKSQNADITLIASGSEVQLALEIK EILENKNHKVNVVSMVNMNEFLLQSKEYQNQIIDKNTKRFSIELSSTFGWHQFLGDSGVAFGVDTFGYSAPFNDVLKHIK FDAQNISQEILNSID |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| tktA | AAO17218.1 | TktA | Not tested | tcd island | Protein | 3e-118 | 42 |
| APECO1_2641 | YP_859417.1 | transketolase | Not tested | Not named | Protein | 7e-118 | 41 |
