Name : nrdE (STAIW_v1c01210) Accession : YP_008311104.1 Strain : Spiroplasma taiwanense CT-1 Genome accession: NC_021846 Putative virulence/resistance : Unknown Product : ribonucleotide-diphosphate reductase subunit alpha Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 120980 - 123139 bp Length : 2160 bp Strand : + Note : - DNA sequence : ATGAATGAAAAAAATTTTTCTACTTTGTCAGGTTCAGAAGAATCAGACGAATATATAAAATTAAATGCAAGATCTAAACT ATTTGTTAAAGATCAGGACAACTTTAAATTAGATATTGAAGCAGCACAACTTTATATGAAAGAACACATTGTTCCAAATA CAAAAAAATTTAAAGATGTTAAGGAAAGAATTAATTATTTAGTTGAAAATCAATATTATGATGAGAAAATAGTTAATCAA TATAATATAAATGAAATTGAAGAAATTACCAAAATTGCTTATGACTATAATTTCAAATTTCCAAGTTTTATGGGAGCATT AAAGTTTTTTAATGCATATGCATTAAAAAGTTTTGATGGCAAACAATACTTGGAAAATTATGAGGATAGAGTTATTATGA ATGCTTTATTTTTAGCAGGAGGAAATTTTTTAAAAGCTAAAAAAATTATGAAGCAAATAATTACTGGAAGATTTCAACCA GCAACACCAACTTTTTTAAATGCGGGAAAAAAACAAAGAGGAGAATATGTTTCATGTTATTTACTTAGAGTAGAAGACAA TATGGAATCAATTGGTAGAGCAGTTACAACTTCACTTCAATTATCAAAACGAGGTGGTGGAGTTGCTTTATGTTTAACAA ATATTCGTGAATTTGGAGCACCTATAAAAAATATTGAAAATCAAGCTACTGGAATTGTTCCAATAATGAAAATTTTAGAA GACTCATTTTCATATGCAAATCAGTTAGGGCAAAGACAAGGAGCTGGTGCTGTTTATTTACATGCACATCATCCGCAAAT TCTTGATTTTTTAGATACAAAACGTGAAAACGCTGATGAAAAAATAAGAATAAAATCATTGTCACTTGGAATTGTTATTC CAGATATTACTTTTGAATTAGCAAAAAATAATGAACAAATGGCTTTATTTAGTCCATATGATGTTGAAAAAGAGTATAAA AAAGCTTTTTCAGATATATCAGTAACTGAGGAATATCAAAATCTTTTAAATAATCCTAAAATTAAAAAAACTTTTATTGA TGCAAGAAAATTATTTCAAGCAATAGCAGAATTACATTTTGAGAGTGGATATCCATATTTATTATTTGATGATACAGTAA ATAATAGAAATGCACATCCTGGAAGAATTGTTATGAGTAATTTATGTAGTGAAATTGTTCAAGTTTCAACACAAAGTGAA TTTTCATCAGATTTAAGTTTTAAAAAAATTGGTGAGGATATTTGTTGTAATTTAGGAAGTATTAATATTGCAAAAGCAAT GGAAAGTGGAACAGAATTTGAAGAATTGATTTATAATTCAATTCTTGCATTAGATCATGTTTCAAGAAATAGTGATTTGT CAAGTGCCCCATCTATTGAACAAGGAAATAAAAAAAATCATGCAGTTGGTTTAGGTGCTATGAATTTACATGGATTTTTA GCAACAAATTTCATTTATTATAATTCAAGTGATGCTATAGACTTTACAAATATGTTTTTTTATACAATGGCATATTATTG CTTTAAAGCTTCAAATAAATTAGCAAAAGAATTTAGTCCTTTTGAAGGATTTAGCAAAACTAAATTTGCTGATGGAAAAT ATTTTGAAAAATATACAAAATGTGAAGAAAATAAATGAACACCAGAATCAAAGACAGTTTCTGAGTTATTTAAAAAATTT AATGTCGAGATACCATCACAAAAAGATTGAATTGAATTAGTTGAAGAAATTAAAAAAACTGGAATTGCTAATTCACACTT AATGGCAGTTGCTCCAACAGGGTCAATTAGTTATTTATCTTCATGTACACCAAGTTTGCAACCAGTTGTTGCTCCAGTTG AAGTAAGAAAGGAAGGAATGCTTGGTCGTGTTTATGTGCCAGCTTATAATATAAATTTTGATAATATGGGATATTATTCA CTTGGAGCATATGAAGTTGGACCAGATCCAATAATTGATATTGCTGCAGCTGCACAACAACATGTAGATCAGGCTATTTC ATTAACTTTATTTATGACAGACCAAGTCACAACTCGTGATTTAAATAAAGCTTATATAAGAGCTTTTAAAAAAGGTTGTG CTTCAATTTATTATGTAAGGGTGAGACAAGAAGTTCTTGAAGATAGTGAAAATTATGAATGTGATGCATGTGTAATTTAA Protein sequence : MNEKNFSTLSGSEESDEYIKLNARSKLFVKDQDNFKLDIEAAQLYMKEHIVPNTKKFKDVKERINYLVENQYYDEKIVNQ YNINEIEEITKIAYDYNFKFPSFMGALKFFNAYALKSFDGKQYLENYEDRVIMNALFLAGGNFLKAKKIMKQIITGRFQP ATPTFLNAGKKQRGEYVSCYLLRVEDNMESIGRAVTTSLQLSKRGGGVALCLTNIREFGAPIKNIENQATGIVPIMKILE DSFSYANQLGQRQGAGAVYLHAHHPQILDFLDTKRENADEKIRIKSLSLGIVIPDITFELAKNNEQMALFSPYDVEKEYK KAFSDISVTEEYQNLLNNPKIKKTFIDARKLFQAIAELHFESGYPYLLFDDTVNNRNAHPGRIVMSNLCSEIVQVSTQSE FSSDLSFKKIGEDICCNLGSINIAKAMESGTEFEELIYNSILALDHVSRNSDLSSAPSIEQGNKKNHAVGLGAMNLHGFL ATNFIYYNSSDAIDFTNMFFYTMAYYCFKASNKLAKEFSPFEGFSKTKFADGKYFEKYTKCEENKWTPESKTVSELFKKF NVEIPSQKDWIELVEEIKKTGIANSHLMAVAPTGSISYLSSCTPSLQPVVAPVEVRKEGMLGRVYVPAYNINFDNMGYYS LGAYEVGPDPIIDIAAAAQQHVDQAISLTLFMTDQVTTRDLNKAYIRAFKKGCASIYYVRVRQEVLEDSENYECDACVI |
Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
cur_1481 | YP_001800875.1 | ribonucleotide-diphosphate reductase subunit alpha | Not tested | Not named | Protein | 3e-179 | 55 |