|
Name : M640_01170 (M640_01170) Accession : YP_008300788.1 Strain : Listeria monocytogenes J1776 Genome accession: NC_021839 Putative virulence/resistance : Virulence Product : internalin Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 233969 - 236362 bp Length : 2394 bp Strand : + Note : Derived by automated computational analysis using gene prediction method: GeneMarkS+. DNA sequence : GTGAGAAGAAAACGATATGTATGGTTGAAAAGTATACTAGTAGCAATATTAGTATTTGGCAGTGGAGTATGGATTAACAC GAGTAACGGGACAAATGCTCAGGCAGCTACAATTACACAAGATACTCCTATTAATCAGATTTTTACAGATACAGCTCTAG CGGAAAAAATGAAGACGGTCTTAGGAAAAACGAATGTAACAGACACGGTCTCGCAAACAGATCTAGACCAAGTTACGACG CTTCAGGCGGATAGATTAGGGATAAAATCTATCGATGGATTGGAATACTTGAACAATTTAACACAAATAAATTTCAGCAA TAATCAACTTACGGATATAACGCCACTTAAAGATTTAACTAAGTTAGTTGATATTTTGATGAATAATAATCAAATAGCAG ATATAACTCCGCTAGCTAATTTGACGAATCTAACTGGTTTGACTTTGTTCAACAATCAGATAACGGATATAGACCCGCTT AAAAACCTAACAAATTTAAATCGGCTAGAACTATCTAGTAACACGATTAGTGATATTAGTGCGCTTTCAGGTTTAACTAG TCTACAGCAATTATCTTTTGGTAATCAAGTGACAGATTTAAAACCATTAGCTAATTTAACAACACTAGAACGACTAGATA TTTCAAGTAATAAGGTGTCGGATATTAGTGTTCTGGCTAAATTAACCAATTTAGAAAGTCTTATCGCTACTAACAACCAA ATAAGTGATATAACTCCACTTGGGATTTTAACAAATTTGGACGAATTATCCTTAAATGGTAACCAGTTAAAAGATATAGG CACATTGGCGAGTTTAACAAACCTTACAGATTTAGATTTAGCAAATAACCAAATTAGTAATCTAGCACCACTGTCGGGTC TAACAAAACTAACTGAGTTAAAACTGGGAGCTAACCAAATAAGTAACATCAGTCCCCTAGCTGGTCTAACCGCCCTCACT AACTTAGAGCTAAATGAAAATCAGTTAGAAGATATTAGCCCAATTTCTAACTTGAAAAATCTCACATATTTAACGTTGTA CTTTAATAATATAAGTGATATAAGCCCAGTTTCTAGTTTAACAAAGCTTCAAAGATTATTTTTCTATAATAACAAGGTAA GTGACGTAAGCTCGCTTGCGAATTTAACCAATATTAATTGGCTTTCGGCTGGGCATAACCAAATTAGCGATCTTACACCA TTGGCTAATTTAACAAGAATTACCCAATTAGGATTGAATGACCAAGAATGGACAAATCCACCAGTGAACTACAAAGTAAA TGTATCCATTCCCAACACGGTGAAAAATGTGACGGGCGCTTTGATTGCACCAGCTACTATTAGCGATGGCGGTAGTTACG CAGAACCTGATATAACATGGAACTTACCTAGTTATACCAATGAAGTAAGTTATACCTTTAATCAATCTGTCACCATTGGA AAAGGAACGACAACATTTAGCGGAACAGTGACGCAGCCACTTAAGGCAATTTTTAATGCTAAGTTTCATGTGGACGGCAA AGAAACAACAAAAGAAGTGGAAGCTGGGAATTTATTGACTGAACCAGCTAAGCCTGTAAAAGAAGGTTACACATTTATTG GGTGGTTTGATGCCCAAACCGGCGGAACTAACTGGAATTTCAGTACGGATAAAATGCCGACAAATGACATCGATTTATAT GCGCAATTTAGTATTAACAGCTACACAGCAACCTTGGATAATGACGGTGTAACAACATCTCAAACAGTAGATTATCAAGG CTTGCTACAAGAACCTACGGCACCAACAAAAGAAGGTTATACTTTTAAAGGCTGGTATGACGCAAAAACTGGCGGTGACA AGTGGGATTTTGCAACTAGTAAGATGCCTGCTAAAAACATCACCTTATATGCTCAATATAGCGCCAATAGCTATACAGCA ACCTTTGATGTTGATGGAAAAACAACGACTCAAGCAGTAGACTATCAAGGACTTCTAAAAGAACCAAAAACGCCAACAAA AGCCGGATATGCTTTCAAAGGTTGGTATGACGAAAAAACAGATGGTAAAAAATGGGATTTTGCGACAGATAAAATGCCAG CAAACGATATTACGCTGTACGCTCAATTCACGAAAAATCCTGTGGCACCACCAACAACTGGAGGGAACACTCCGCCGACT ACAAATAACGGAGGGAACACTACACCACCTTCCGCAAATATACCTGGAAGCAACACATCAACTGGGAATTCAGCTAGCAC AACAAGTACAATGAACGCTTATGACCCTTATAATTCAAAAGAAGCTTCACTCCCTACAACTGGCGATAGCTATAATGCGC TCTACCTGTTGATAGGATTGTTAGCAGTAGGAACTGCAGTGGCTCTTACTAAAAAAGCACGTGCTAGTAAATAG Protein sequence : MRRKRYVWLKSILVAILVFGSGVWINTSNGTNAQAATITQDTPINQIFTDTALAEKMKTVLGKTNVTDTVSQTDLDQVTT LQADRLGIKSIDGLEYLNNLTQINFSNNQLTDITPLKDLTKLVDILMNNNQIADITPLANLTNLTGLTLFNNQITDIDPL KNLTNLNRLELSSNTISDISALSGLTSLQQLSFGNQVTDLKPLANLTTLERLDISSNKVSDISVLAKLTNLESLIATNNQ ISDITPLGILTNLDELSLNGNQLKDIGTLASLTNLTDLDLANNQISNLAPLSGLTKLTELKLGANQISNISPLAGLTALT NLELNENQLEDISPISNLKNLTYLTLYFNNISDISPVSSLTKLQRLFFYNNKVSDVSSLANLTNINWLSAGHNQISDLTP LANLTRITQLGLNDQEWTNPPVNYKVNVSIPNTVKNVTGALIAPATISDGGSYAEPDITWNLPSYTNEVSYTFNQSVTIG KGTTTFSGTVTQPLKAIFNAKFHVDGKETTKEVEAGNLLTEPAKPVKEGYTFIGWFDAQTGGTNWNFSTDKMPTNDIDLY AQFSINSYTATLDNDGVTTSQTVDYQGLLQEPTAPTKEGYTFKGWYDAKTGGDKWDFATSKMPAKNITLYAQYSANSYTA TFDVDGKTTTQAVDYQGLLKEPKTPTKAGYAFKGWYDEKTDGKKWDFATDKMPANDITLYAQFTKNPVAPPTTGGNTPPT TNNGGNTTPPSANIPGSNTSTGNSASTTSTMNAYDPYNSKEASLPTTGDSYNALYLLIGLLAVGTAVALTKKARASK |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| inlA | CAC20628.1 | internalin A | Virulence | Internalin | Protein | 0.0 | 97 |
| inlF | AAB67968.1 | internalin | Virulence | Internalin | Protein | 8e-136 | 45 |
| Gene | GenBank Accn | Product | ID of source DB | Alignment Type | E-val | Identity |
| M640_01170 | YP_008300788.1 | internalin | VFG0075 | Protein | 0.0 | 97 |
