Gene Information

Name : M641_11645 (M641_11645)
Accession : YP_008299830.1
Strain : Listeria monocytogenes R2-502
Genome accession: NC_021838
Putative virulence/resistance : Virulence
Product : internalin
Function : -
COG functional category : -
COG ID : -
EC number : -
Position : 2264936 - 2267338 bp
Length : 2403 bp
Strand : -
Note : Derived by automated computational analysis using gene prediction method: GeneMarkS+.

DNA sequence :
GTGAGAAGAAAACGATATGTATGGTTGAAAAGTATACTAGTAGCAATATTAGTATTTGGCAGTGGAGTATGGATTAACAC
GAGTAACGGGACAAATGCTCAGGCAGCTACAATTACACAAGATACTCCTATTAATCAGATTTTTACAGATACAGCTCTAG
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CAAATGATATTACGCTGTACGCTCAATTCACGAAAAATCCTGTGGCACCACCAACAACTGGAGGGAACACTCCGCCGACT
ACAAATAACGGAGGGAACACTACACCACCTTCCGCAAATATACCTGGAAGCAACACATCTAACACATCAACTGGGAATTC
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ATAATGCGCTCTACCTGTTGATAGGATTGTTAGCAGTAGGAACTGCAGTGGCTCTTACTAAAAAAGCACGTGCTAGTAAA
TAG

Protein sequence :
MRRKRYVWLKSILVAILVFGSGVWINTSNGTNAQAATITQDTPINQIFTDTALAEKMKTVLGKTNVTDTVSQTDLDQVTT
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TNNGGNTTPPSANIPGSNTSNTSTGNSASTTSTMNAYDPYNSKAASLPTTGDSDNALYLLIGLLAVGTAVALTKKARASK

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
inlA CAC20628.1 internalin A Virulence Internalin Protein 0.0 98
inlF AAB67968.1 internalin Virulence Internalin Protein 3e-137 45

• Homologs from VFDB (virulence genes)

GeneGenBank Accn Product ID of source DB Alignment Type E-val Identity
M641_11645 YP_008299830.1 internalin VFG0075 Protein 0.0 98