Gene Information

Name : M639_00345 (M639_00345)
Accession : YP_008294718.1
Strain : Listeria monocytogenes J2-031
Genome accession: NC_021837
Putative virulence/resistance : Virulence
Product : internalin
Function : -
COG functional category : -
COG ID : -
EC number : -
Position : 67829 - 70231 bp
Length : 2403 bp
Strand : -
Note : Derived by automated computational analysis using gene prediction method: GeneMarkS+.

DNA sequence :
GTGAGAAAAAAACGATATGTATGGTTGAAAAGTATACTAGTAGCAATATTAGTATTTGGCAGTGGAGTATGGATTAACAC
GAGCAACGGGACAAATGCTCAGGCAGCTACAATTACACAAGATACTCCTATTAATCAGATTTTTACAGACGCAGCTCTAG
CGGAAAAAATGAAGACGGTCTTAGGAAAAACGAATGTAACAGACACGGTCTCACAAACAGATCTAGACCAAGTTACGACG
CTTCAGGCGGATAGGTTAGGGATAAAATCTATCGATGGAGTGGAATACTTGAACAATTTAACACAAATAAATTTCAGCAA
TAATCAACTTACGGACATAACGCCACTTAAAAATTTAACTAAGTTAGTTGATATTTTGATGAATAATAATCAAATAGCAG
ATATAACTCCGCTAGCTAATTTGACGAATCTAACTGGTTTGACTTTGTTCAACAATCAGATAACGGATCTAGACCCGCTT
AAAAATCTAACAAATTTAAATCGGCTAGAACTATCTAGTAACACGATTAGTGATATTAGTGCGCTTTCAGGTTTAACTAG
TCTACAGCAATTATCTTTTGGTAATCAAGTGACAGATTTAAAACCATTAGCTAATTTAACGACACTAGAACGACTAGATA
TTTCAAGTAATAAGGTGTCAGATATTAGTGTTCTGGCTAAATTAACCAATTTAGAAAGTCTTATCGCTACTAACAACCAA
ATAAGTGATATAACTCCACTTGGGATTTTAACAAATTTGGACGAATTATCCTTAAATGGTAACCAGTTAAAAGATATAGG
CACATTGGCGAGTTTAACAAACCTTACAGATTTAGATTTAGCAAATAACCAAATTAGTAATCTAGCACCACTGTCGGGTC
TAACAAAACTAACTGAGTTAAAACTTGGAGCTAACCAAATAAGTAACATCAGTCCCCTAGCAGGTTTAACCGCACTCACT
AACTTAGAGCTTAATGAAAATCAGCTGGAAGATATTAGCCCAATTTCTAACCTGAAAAATCTCACATATTTAACTTTGTA
CTTTAATAATATAAGTGATATAAGCCCAGTTTCTAGTTTAACAAAGCTTCAAAGATTATTTTTCTATAATAACAAGGTAA
GTGACGTAAGCTCACTTGCGAACTTAACAAATATTAATTGGCTTTCAGCTGGGCATAACCAAATTAGCGATCTTACACCA
TTGGCTAATTTAACAAGAATCACCCAACTAGGGTTGAATGATCAAGCATGGACAAATGCACCAGTAAACTACAAAGCAAA
TGTATCCATTCCAAACACGGTGAAAAATGTGACTGGCGCTTTGATTGCACCAGCTACTATTAGCGATGGTGGTAGTTATG
CAGAACCTGATATAACATGGAACTTACCTAGTTATACGAATGAAGTAAGTTATACCTTTAACCAATCTGTCACCATTGGA
AAAGGAACGACAACATTTAGTGGAACTGTGACGCAGCCACTTAAGGCAATTTTTAATGCTAAGTTTCATGTGGACGGCAA
AGAAACAACCAAAGAAGTGGAAGCTGGGAATTTATTGACTGAACCAGCTAAGCCTGTAAAAGAAGGTTACACATTTATTG
GGTGGTTTGATGCCAAAACAGGTGGAACTAAATGGAATTTCAGTACGGATAAAATGCCGACAAATGACATCGATTTATAT
GCGCAATTTAGTATTAACAGCTACACAGCAACCTTGGATAATGACGGTGTAACAACATCTCAAACAGTAGATTATCAAGG
CTTGCTACAAGAACCTACGGCACCAACAAAAGAAGGTTATACTTTTAAAGGCTGGTATGACGCAAAAACTGGCGGTGACA
AGTGGGATTTTGCAACTAGTAAGATGCCTGCTAAAAACATCACCTTATATGCTCAATATAGCGCCAATAGCTATACAGCA
ACCTTTGATGTTGATGGAAAAACAACGACTCAAGCAGTAGACTATCAAGGACTTCTAAAAGAACCAAAAACGCCAACAAA
AGCCGGATATACTTTCAAAGGTTGGTATGACGAAAAAACAGATGGTAAAAAATGGGATTTTGCGACAGATAAAATGCCAG
CAAATGATATTACGCTGTACGCTCAATTCACGAAAAATCCTGTGGCACCACCAACAACTGGAGGGAACACGCCGCCGACT
ACAAATAACGGAGGGAATACTACACCACCTTCCGCAAATATACCTGGAAGCGACACATCTAACACATCAACTGGGAATTC
AGCCAGCACAACAAGTACAATGAACGCTTATGACCCTTATAATTCAAAAGAAGCTTCACTCCCTACAACTGGCGATAGCG
ATAATGCGCTCTACCTTTTGTTAGGGTTATTAGCAGTAGGAACTGCAATGGCTCTTACTAAAAAAGCACGTGCTAGTAAA
TAG

Protein sequence :
MRKKRYVWLKSILVAILVFGSGVWINTSNGTNAQAATITQDTPINQIFTDAALAEKMKTVLGKTNVTDTVSQTDLDQVTT
LQADRLGIKSIDGVEYLNNLTQINFSNNQLTDITPLKNLTKLVDILMNNNQIADITPLANLTNLTGLTLFNNQITDLDPL
KNLTNLNRLELSSNTISDISALSGLTSLQQLSFGNQVTDLKPLANLTTLERLDISSNKVSDISVLAKLTNLESLIATNNQ
ISDITPLGILTNLDELSLNGNQLKDIGTLASLTNLTDLDLANNQISNLAPLSGLTKLTELKLGANQISNISPLAGLTALT
NLELNENQLEDISPISNLKNLTYLTLYFNNISDISPVSSLTKLQRLFFYNNKVSDVSSLANLTNINWLSAGHNQISDLTP
LANLTRITQLGLNDQAWTNAPVNYKANVSIPNTVKNVTGALIAPATISDGGSYAEPDITWNLPSYTNEVSYTFNQSVTIG
KGTTTFSGTVTQPLKAIFNAKFHVDGKETTKEVEAGNLLTEPAKPVKEGYTFIGWFDAKTGGTKWNFSTDKMPTNDIDLY
AQFSINSYTATLDNDGVTTSQTVDYQGLLQEPTAPTKEGYTFKGWYDAKTGGDKWDFATSKMPAKNITLYAQYSANSYTA
TFDVDGKTTTQAVDYQGLLKEPKTPTKAGYTFKGWYDEKTDGKKWDFATDKMPANDITLYAQFTKNPVAPPTTGGNTPPT
TNNGGNTTPPSANIPGSDTSNTSTGNSASTTSTMNAYDPYNSKEASLPTTGDSDNALYLLLGLLAVGTAMALTKKARASK

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
inlA CAC20628.1 internalin A Virulence Internalin Protein 0.0 99
inlF AAB67968.1 internalin Virulence Internalin Protein 1e-136 46

• Homologs from VFDB (virulence genes)

GeneGenBank Accn Product ID of source DB Alignment Type E-val Identity
M639_00345 YP_008294718.1 internalin VFG0075 Protein 0.0 99