Gene Information

Name : deoA (SDIMI_v3c06050)
Accession : YP_008292704.1
Strain : Spiroplasma diminutum CUAS-1
Genome accession: NC_021833
Putative virulence/resistance : Unknown
Product : thymidine phosphorylase
Function : -
COG functional category : -
COG ID : -
EC number : -
Position : 669903 - 671213 bp
Length : 1311 bp
Strand : -
Note : -

DNA sequence :
ATGAACTTTGCAAATATTATAGACAAGAAAAAAAATAACAAAGAATTGACAGCAGAAGAAATATATTGAACAGTTAATTC
TTTTGTAAATAACTCACTAAAAGATTATCAAATGTCAGCTTTTAATATGGCTGTTTGATTTAATGGTATGACACCAACTG
AAATAGCTTCTTTTACACAAGCTATGATCGATTCTGGAATAACTTATAATTTAGATGGTGTTGATGGATTAAAAGCAGAT
AAACATTCAACAGGTGGAGTAGGAGATAAAACAAGTCTTATTTTTTCACCTTTAGTTGCAAAATTTGGAATAAAAGTTGC
AAAACTTTCTGGAAGAGGTTTAGGCCAAACTGGAGGTACAATTGATAAATTGGAAAGCTGTCCAGGTTGAACTGGTGAAA
TTTCAGAAACTAGATTTAAAGAAATTTTAAATACAGTTGGAATATCAATTATGAGTCAATCAAGTGAAATTGTTCCAGCT
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AAAACTTGTAATACCAGCAGATAGCATAATTCTAGATGTTAAAATGGGAAGTGGAGCTTTCATGAAAGATTTAGATAATG
CAATTGCATTATCTAAATCAATGATTACTATTGGAAAAGAACATAAAAGAAATGTTAGTGTAATGATTACAAATATGGAT
AAACCACTTGGAAGAGCAATTGGAAATGCAATAGAAGTTAAAGAAGCATGAGATACATTAAATGGTAATGGACCAGAAGA
TTTAATAGAATTGTGTGTAACTGCAGCGGGATTAACTTTAGTTCAAAATAATGTCTTTAAAGACTTAGAAACAGCAAAAG
TAGAGCTTAATAAAGTTTTACAAGATAAAAGTGCTGCACACTTATTAAAAGACTTTATAGAAGCTCAAAATGGTGATTTT
AATGTTATTTTAGACTATGAAAATAACTTTAAAACAAAATATACAATTCAAATTCTAGCTCAAAATGATGGGTATTTAAG
TTTTGCAAGTGCAGATCAATTAGGATACCTTTCAATGCATTTAGGTGCAGGGCGAGCAACTAAAGAAGAGAGTATAGATT
TTGCAGCAGGAATTTATTTAAATAAAACTTCAAATGAATTTGTAAAAAAAGGTGATGTTATTATGACTTTATATACAAAT
AGAGAAGATATTGATAATTTCAAACAGAAGGCACAAGAATTAATAGTTTTAAATAAAGAACTTCATCAAGAAGAGTTAAT
TTTAAAATTATTAACAAATGAAGATGTTTAA

Protein sequence :
MNFANIIDKKKNNKELTAEEIYWTVNSFVNNSLKDYQMSAFNMAVWFNGMTPTEIASFTQAMIDSGITYNLDGVDGLKAD
KHSTGGVGDKTSLIFSPLVAKFGIKVAKLSGRGLGQTGGTIDKLESCPGWTGEISETRFKEILNTVGISIMSQSSEIVPA
DKKLYALRDVTGTVDSIPLIASSIMSKKLVIPADSIILDVKMGSGAFMKDLDNAIALSKSMITIGKEHKRNVSVMITNMD
KPLGRAIGNAIEVKEAWDTLNGNGPEDLIELCVTAAGLTLVQNNVFKDLETAKVELNKVLQDKSAAHLLKDFIEAQNGDF
NVILDYENNFKTKYTIQILAQNDGYLSFASADQLGYLSMHLGAGRATKEESIDFAAGIYLNKTSNEFVKKGDVIMTLYTN
REDIDNFKQKAQELIVLNKELHQEELILKLLTNEDV

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
deoA YP_005163381.1 Thymidine phosphorylase Not tested Not named Protein 4e-71 43