|
Name : tkt (SDIMI_v3c04170) Accession : YP_008292516.1 Strain : Spiroplasma diminutum CUAS-1 Genome accession: NC_021833 Putative virulence/resistance : Unknown Product : transketolase Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 467542 - 469509 bp Length : 1968 bp Strand : + Note : - DNA sequence : ATGAATAAAAACAACAAAAATTTAAATGCATTAAGAATTTTAGGAATTGAAGCTGTTAATAAAGCAAATTCAGGTCACCC TGGAATAGTATTAGGAGCAAGTCCAATAGTTTATACTTTATTTACAAAATTTATGAACTTAAATCCATCAAATCCATCAT GATTTAATAGAGATAGATTTGTATTAAGTGCAGGACACGGTAGTGCACTGTTATACAGCGCACTACACTTGTCAGGTTTT AATCTTTCAATAGAAGAGATTAAAAATTTTAGACAACTTAATTCAAAAACACCAGGGCACCCAGAATTTGGTCATACACA AGGTGTAGAAGCAACAACAGGACCATTAGGACAAGGATTTGCAATGGGTGTTGGAATGGCACTTGGAGAAAGTCATCTAG CTGGAATGTATAATAAAGATGATTTAAAACTTATAAATCACTTTACTTATGTTTTATGTGGTGATGGTGACTTACAAGAA GGTGTATGTCAAGAAGCAATAAGTTTTGCTGGAAGATATAAACTAAATAAATTAATAGTTTTACATGATTCAAATGATAT TCAACTTGATGCTCCAGTTGAAGTTGCACAAAGTGAAGATATTCAACTTAAATTTAAAGCAGCAGGATGAAATACTTTAA AAGTTGAAAATGGTGAAGATTTAATTGCAATTGAAAATGCAATTAAATCAGCTCAACAAAGTGATAAACCTACATATATT GAAGTAAAAACAATTATTGGAATTGGTTCAACAAATCAAGGAACTACAAAAGTTCATGGTGCACCATTAGGAAATGATAT TCAAACAGTTAAAAATTACTTTAACTGAAATGAATCAGAATTTGTAATTCCCCAAGATGTATATGACTTTTGAAAAGAAA ATGTTTTAAATAGGGGAGTTGAAGCAAACAATCAATGAAATGAAATGTTTGAAAAATATAAAGAATCAAATCCTCAATTA GCAGAACAACTTTTAAAATCAATTGACAAACAATGAGATATTGACTTAAAAGAACTTGAAGCTTTAAATAAATCAACTGA ACAAGCTACAAGAGTAAGTTCAGGAGAAGTATTTAACTTATTGAGTAAAAACATCCCTGCAATAATTGGAGGAAGTGCAG ATCTTTGTGAATCAACAAAGATCAAAGGTGCTGATGGTAATTATGATTTTGATAATACAAAAGCAAGAAATATAATGTAT GGAGTTAGAGAATTTGCGATGAGTGCAATAAACAATGGTATGGCTCTTCATGGAGGATTACTTCCTGTAGCATCAGGTTT CTTTGTATTTGCAGATTATTTAAAACCAGCTTTAAGAATGAGTGCAATTATGAACATTCAAACATTGAGTGTATTTACTC ATGATTCAGTTGCAGTTGGAGAAGATGGACCAACTCACCAACCAATAGAACAACTTGCAATGTTAAGAAGTATACCAAAT ATGAGTGTTTATAGACCTTGCGACATGGCAGAAACTATTGCAAGTTATTATAATGCATTAAATAATAAAAATAATCCAAG TGTTATTATTGCAACCCGTCAAAATTTAAAAGAATTGGATCATTCAAGTAATTTAATAGATCAAGTTAAAAAAGGAGCAT ATATTTTAAGCGAAACACCAAATGCAAATATTACTTTAATTGCAACTGGAAGTGAAGTTAGCTTAGCTCTTGATATTAAA CAAATTTTAGAAAGAGAAAACCAAAAAGTAAATGTTGTTTCAATGATTAATATGAATGAATTTAATAAACAATCAAAAGA ATATCAAGATTCAATTATTAACAGAAATACAACTAGATTTTCAATTGAACTTGGTTCTACTTATGGATGACATAAATTCT TAGGTGATCAAGGAAAAGCATATGGTATTGATACATTTGGTTATTCAGCTCCTTTTGCTGATGTAATAAAAGAAATTAAA TTTACTTCAGAAGAAATAGCAAAAGACATAATATCTGTATTAAAATAA Protein sequence : MNKNNKNLNALRILGIEAVNKANSGHPGIVLGASPIVYTLFTKFMNLNPSNPSWFNRDRFVLSAGHGSALLYSALHLSGF NLSIEEIKNFRQLNSKTPGHPEFGHTQGVEATTGPLGQGFAMGVGMALGESHLAGMYNKDDLKLINHFTYVLCGDGDLQE GVCQEAISFAGRYKLNKLIVLHDSNDIQLDAPVEVAQSEDIQLKFKAAGWNTLKVENGEDLIAIENAIKSAQQSDKPTYI EVKTIIGIGSTNQGTTKVHGAPLGNDIQTVKNYFNWNESEFVIPQDVYDFWKENVLNRGVEANNQWNEMFEKYKESNPQL AEQLLKSIDKQWDIDLKELEALNKSTEQATRVSSGEVFNLLSKNIPAIIGGSADLCESTKIKGADGNYDFDNTKARNIMY GVREFAMSAINNGMALHGGLLPVASGFFVFADYLKPALRMSAIMNIQTLSVFTHDSVAVGEDGPTHQPIEQLAMLRSIPN MSVYRPCDMAETIASYYNALNNKNNPSVIIATRQNLKELDHSSNLIDQVKKGAYILSETPNANITLIATGSEVSLALDIK QILERENQKVNVVSMINMNEFNKQSKEYQDSIINRNTTRFSIELGSTYGWHKFLGDQGKAYGIDTFGYSAPFADVIKEIK FTSEEIAKDIISVLK |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| tktA | AAO17218.1 | TktA | Not tested | tcd island | Protein | 3e-123 | 42 |
