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Name : LM220_06132 (LM220_06132) Accession : YP_008288658.1 Strain : Listeria monocytogenes J1-220 Genome accession: NC_021830 Putative virulence/resistance : Virulence Product : internalin Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 255225 - 257627 bp Length : 2403 bp Strand : + Note : Derived by automated computational analysis using gene prediction method: GeneMarkS+. DNA sequence : GTGAGAAGAAAACGATATGTATGGTTGAAAAGTATACTAGTAGCAATATTAGTATTTGGCAGTGGAGTATGGATTAACAC GAGTAACGGGACAAATGCTCAGGCAGCTACAATTACACAAGATACTCCTATTAATCAGATTTTTACAGATACAGCTCTAG CGGAAAAAATGAAGACGGTCTTAGGAAAAACGAATGTAACAGACACGGTCTCGCAAACAGATCTAGACCAAGTTACGACG CTTCAGGCGGATAGATTAGGGATAAAATCTATCGATGGATTGGAATACTTGAACAATTTAACACAAATAAATTTCAGCAA TAATCAACTTACGGACATAACTCCACTTAAAGATTTAACTAAGTTAGTTGATATTTTGATGAATAATAATCAAATAGCAG ATATAACTCCGCTAGCTAATTTGTCGAATCTAACTGGTTTGACTTTGTTCAACAATCAGATAACGGATATAGACCCGCTT AAAAATCTAACAAATTTAAATCGGCTAGAACTATCTAGTAACACGATTAGTGATATTAGTGCGCTTTCAGGTTTAACTAG TCTACAGCAATTATCTTTTGGTAATCAAGTGACAGATTTAAAACCATTAGCTAATTTAACAACACTAGAACGACTAGATA TTTCAAGTAATAAGGTGTCGGATATTAGTGTTCTGGCTAAATTAACCAATTTAGAAAGTCTTATCGCTACTAACAACCAA ATAAGTGATATAACTCCACTTGGGATTTTAACAAATTTGGACGAATTATCCTTAAATGGTAACCAGTTAAAAGATATAGG CACATTGGCGAGTTTAACAAACCTTACAGATTTAGATTTAGCAAATAACCAAATTAGTAATCTAGCACCACTGTCGGGTC TAACAAAACTAACTGAGTTAAAACTGGGAGCTAACCAAATAAGTAACATCAGTCCCCTAGCAGGTCTAACCGCACTCACT AACTTAGAGCTAAATGAAAATCAGTTAGAAGATATTAGCCCAATTTCTAACCTGAAAAATCTCACATATTTAACGTTGTA CTTTAATAATATAAGTGATATAAGCCCAGTTTCTAGTTTAACAAAGCTTCAAAGATTATTTTTCTATAATAACAAGGTAA GTGACGTAAGCTCACTTGCGAATTTAACCAATATTAATTGGCTTTCGGCTGGGCATAACCAAATTAGCGATCTTACACCA TTGGCTAATTTAACAAGAATTACCCAATTAGGATTGAATGACCAAGAATGGACAAATCCACCAGTGAACTACAAAGTAAA TGTATCCATTCCAAACACGGTGAAAAATGTGACGGGCGCTTTGATTGCACCAGCTACTATTAGCGATGGTGGTAGTTATG CAGAACCTGATATAACATGGAATTTACCTAGTTATACCAATGAAGTAAGTTATACCTTTAACCAATCTGTCACCATTGGA AAAGGAACGACAACATTTAGTGGAACTGTGACGCAGCCACTTAAGGCAATTTTTAATGCTAAGTTTCATGTGGACGGCAA AGAAACAACCAAAGAAGTGGAAGCTGGGAATTTATTGACTGAACCAGCTAAGCCTGTAAAAGAAGGTTATACATTTGTTG GGTGGTTTGATGCCCAAACCGGCGGAACTAAATGGAATTTCAGTACGGATAAAATGCCGACAAATGACATCGATTTATAT GCGCAATTTAGTATTAACAGCTACACAGCAACGTTTGATAATGACGGTGTAACAACATCTCAAACAGTAGATTATCAAGG CTTGCTACAAGAACCTACGGCACCAACAAAAGAAGGTTATACTTTCAAAGGCTGGTATGACGCAAAAACTGGTGGTGACA AGTGGGATTTTGCAACTAGTAAGATGCCTGCTAAAAACATCACCTTATATGCTCAATATAGCGCCAATAGCTATACAGCA ACCTTTGATGTTGATGGAAAAACAACGACTCAAGCAGTAGACTATCAAGGACTTCTAAAAGAACCAAAAACGCCAACAAA AGCCGGATATACTTTCAAAGGTTGGTATGACGAAAAAACAGATGGTAAAAAATGGGATTTTGCGACAGATAAAATGCCAG CAAATGATATTACGCTGTACGCTCAATTCACGAAAAATCCTGTGGCACCACCAACAACTGGAGGGAACACTCCGCCGACT ACAAATAACGGAGGGAACACTACACCACCTTCCGCAAATATACCTGGAAGCAACACATCTAACACATCAACTGGGAATTC AGCTAGCACAACAAGTACAATGAACGCTTATGACCCTTATAATTCAAAAGAAGCTTCACTCCCTACAACTGGTGATAGCG ATAATGCGCTCTACCTGTTGATAGGATTGTTAGCAGTAGGAACTGCAGTGGCTCTTACTAAAAAAGCACGTGCTAGTAAA TAG Protein sequence : MRRKRYVWLKSILVAILVFGSGVWINTSNGTNAQAATITQDTPINQIFTDTALAEKMKTVLGKTNVTDTVSQTDLDQVTT LQADRLGIKSIDGLEYLNNLTQINFSNNQLTDITPLKDLTKLVDILMNNNQIADITPLANLSNLTGLTLFNNQITDIDPL KNLTNLNRLELSSNTISDISALSGLTSLQQLSFGNQVTDLKPLANLTTLERLDISSNKVSDISVLAKLTNLESLIATNNQ ISDITPLGILTNLDELSLNGNQLKDIGTLASLTNLTDLDLANNQISNLAPLSGLTKLTELKLGANQISNISPLAGLTALT NLELNENQLEDISPISNLKNLTYLTLYFNNISDISPVSSLTKLQRLFFYNNKVSDVSSLANLTNINWLSAGHNQISDLTP LANLTRITQLGLNDQEWTNPPVNYKVNVSIPNTVKNVTGALIAPATISDGGSYAEPDITWNLPSYTNEVSYTFNQSVTIG KGTTTFSGTVTQPLKAIFNAKFHVDGKETTKEVEAGNLLTEPAKPVKEGYTFVGWFDAQTGGTKWNFSTDKMPTNDIDLY AQFSINSYTATFDNDGVTTSQTVDYQGLLQEPTAPTKEGYTFKGWYDAKTGGDKWDFATSKMPAKNITLYAQYSANSYTA TFDVDGKTTTQAVDYQGLLKEPKTPTKAGYTFKGWYDEKTDGKKWDFATDKMPANDITLYAQFTKNPVAPPTTGGNTPPT TNNGGNTTPPSANIPGSNTSNTSTGNSASTTSTMNAYDPYNSKEASLPTTGDSDNALYLLIGLLAVGTAVALTKKARASK |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| inlA | CAC20628.1 | internalin A | Virulence | Internalin | Protein | 0.0 | 98 |
| Gene | GenBank Accn | Product | ID of source DB | Alignment Type | E-val | Identity |
| LM220_06132 | YP_008288658.1 | internalin | VFG0075 | Protein | 0.0 | 98 |
