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Name : LM1816_01762 (LM1816_01762) Accession : YP_008286260.1 Strain : Listeria monocytogenes J1816 Genome accession: NC_021829 Putative virulence/resistance : Virulence Product : internalin Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 656433 - 658826 bp Length : 2394 bp Strand : - Note : Derived by automated computational analysis using gene prediction method: GeneMarkS+. DNA sequence : GTGAGAAGAAAACGATATGTATGGTTGAAAAGTATACTAGTAGCAATATTAGTATTTGGCAGTGGAGTATGGATTAACAC GAGTAACGGGACAAATGCTCAGGCAGCTACAATTACACAAGATACTCCTATTAATCAGATTTTTACAGATACAGCTCTAG CGGAAAAAATGAAGACGGTCTTAGGAAAAACGAATGTAACAGACACGGTCTCGCAAACAGATCTAGACCAAGTTACGACG CTTCAGGCGGATAGATTAGGGATAAAATCTATCGATGGATTGGAATACTTGAACAATTTAACACAAATAAATTTCAGCAA TAATCAACTTACGGATATAACGCCACTTAAAGATTTAACTAAGTTAGTTGATATTTTGATGAATAATAATCAAATAGCAG ATATAACTCCGCTAGCTAATTTGACGAATCTAACTGGTTTGACTTTGTTCAACAATCAGATAACGGATATAGACCCGCTT AAAAACCTAACAAATTTAAATCGGCTAGAACTATCTAGTAACACGATTAGTGATATTAGTGCGCTTTCAGGTTTAACTAG TCTACAGCAATTATCTTTTGGTAATCAAGTGACAGATTTAAAACCATTAGCTAATTTAACAACACTAGAACGACTAGATA TTTCAAGTAATAAGGTGTCGGATATTAGTGTTCTGGCTAAATTAACCAATTTAGAAAGTCTTATCGCTACTAACAACCAA ATAAGTGATATAACTCCACTTGGGATTTTAACAAATTTGGACGAATTATCCTTAAATGGTAACCAGTTAAAAGATATAGG CACATTGGCGAGTTTAACAAACCTTACAGATTTAGATTTAGCAAATAACCAAATTAGTAATCTAGCACCACTGTCGGGTC TAACAAAACTAACTGAGTTAAAACTGGGAGCTAACCAAATAAGTAACATCAGTCCCCTAGCTGGTCTAACCGCCCTCACT AACTTAGAGCTAAATGAAAATCAGTTAGAAGATATTAGCCCAATTTCTAACTTGAAAAATCTCACATATTTAACGTTGTA CTTTAATAATATAAGTGATATAAGCCCAGTTTCTAGTTTAACAAAGCTTCAAAGATTATTTTTCTATAATAACAAGGTAA GTGACGTAAGCTCGCTTGCGAATTTAACCAATATTAATTGGCTTTCGGCTGGGCATAACCAAATTAGCGATCTTACACCA TTGGCTAATTTAACAAGAATTACCCAATTAGGATTGAATGACCAAGAATGGACAAATCCACCAGTGAACTACAAAGTAAA TGTATCCATTCCCAACACGGTGAAAAATGTGACGGGCGCTTTGATTGCACCAGCTACTATTAGCGATGGCGGTAGTTACG CAGAACCTGATATAACATGGAACTTACCTAGTTATACCAATGAAGTAAGTTATACCTTTAATCAATCTGTCACCATTGGA AAAGGAACGACAACATTTAGCGGAACAGTGACGCAGCCACTTAAGGCAATTTTTAATGCTAAGTTTCATGTGGACGGCAA AGAAACAACAAAAGAAGTGGAAGCTGGGAATTTATTGACTGAACCAGCTAAGCCTGTAAAAGAAGGTTACACATTTATTG GGTGGTTTGATGCCCAAACCGGCGGAACTAACTGGAATTTCAGTACGGATAAAATGCCGACAAATGACATCGATTTATAT GCGCAATTTAGTATTAACAGCTACACAGCAACCTTGGATAATGACGGTGTAACAACATCTCAAACAGTAGATTATCAAGG CTTGCTACAAGAACCTACGGCACCAACAAAAGAAGGTTATACTTTTAAAGGCTGGTATGACGCAAAAACTGGCGGTGACA AGTGGGATTTTGCAACTAGTAAGATGCCTGCTAAAAACATCACCTTATATGCTCAATATAGCGCCAATAGCTATACAGCA ACCTTTGATGTTGATGGAAAAACAACGACTCAAGCAGTAGACTATCAAGGACTTCTAAAAGAACCAAAAACGCCAACAAA AGCCGGATATGCTTTCAAAGGTTGGTATGACGAAAAAACAGATGGTAAAAAATGGGATTTTGCGACAGATAAAATGCCAG CAAACGATATTACGCTGTACGCTCAATTCACGAAAAATCCTGTGGCACCACCAACAACTGGAGGGAACACTCCGCCGACT ACAAATAACGGAGGGAACACTACACCACCTTCCGCAAATATACCTGGAAGCAACACATCAACTGGGAATTCAGCTAGCAC AACAAGTACAATGAACGCTTATGACCCTTATAATTCAAAAGAAGCTTCACTCCCTACAACTGGCGATAGCTATAATGCGC TCTACCTGTTGATAGGATTGTTAGCAGTAGGAACTGCAGTGGCTCTTACTAAAAAAGCACGTGCTAGTAAATAG Protein sequence : MRRKRYVWLKSILVAILVFGSGVWINTSNGTNAQAATITQDTPINQIFTDTALAEKMKTVLGKTNVTDTVSQTDLDQVTT LQADRLGIKSIDGLEYLNNLTQINFSNNQLTDITPLKDLTKLVDILMNNNQIADITPLANLTNLTGLTLFNNQITDIDPL KNLTNLNRLELSSNTISDISALSGLTSLQQLSFGNQVTDLKPLANLTTLERLDISSNKVSDISVLAKLTNLESLIATNNQ ISDITPLGILTNLDELSLNGNQLKDIGTLASLTNLTDLDLANNQISNLAPLSGLTKLTELKLGANQISNISPLAGLTALT NLELNENQLEDISPISNLKNLTYLTLYFNNISDISPVSSLTKLQRLFFYNNKVSDVSSLANLTNINWLSAGHNQISDLTP LANLTRITQLGLNDQEWTNPPVNYKVNVSIPNTVKNVTGALIAPATISDGGSYAEPDITWNLPSYTNEVSYTFNQSVTIG KGTTTFSGTVTQPLKAIFNAKFHVDGKETTKEVEAGNLLTEPAKPVKEGYTFIGWFDAQTGGTNWNFSTDKMPTNDIDLY AQFSINSYTATLDNDGVTTSQTVDYQGLLQEPTAPTKEGYTFKGWYDAKTGGDKWDFATSKMPAKNITLYAQYSANSYTA TFDVDGKTTTQAVDYQGLLKEPKTPTKAGYAFKGWYDEKTDGKKWDFATDKMPANDITLYAQFTKNPVAPPTTGGNTPPT TNNGGNTTPPSANIPGSNTSTGNSASTTSTMNAYDPYNSKEASLPTTGDSYNALYLLIGLLAVGTAVALTKKARASK |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| inlA | CAC20628.1 | internalin A | Virulence | Internalin | Protein | 0.0 | 97 |
| inlF | AAB67968.1 | internalin | Virulence | Internalin | Protein | 8e-136 | 45 |
| Gene | GenBank Accn | Product | ID of source DB | Alignment Type | E-val | Identity |
| LM1816_01762 | YP_008286260.1 | internalin | VFG0075 | Protein | 0.0 | 97 |
