Name : M637_04850 (M637_04850) Accession : YP_008274774.1 Strain : Listeria monocytogenes J2-064 Genome accession: NC_021824 Putative virulence/resistance : Virulence Product : internalin Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 968085 - 970487 bp Length : 2403 bp Strand : + Note : Derived by automated computational analysis using gene prediction method: GeneMarkS+. DNA sequence : GTGAGAAGAAAACGATATGTATGGTTGAAAAGTATACTAGTAGCAATATTAGTATTTGGCAGTGGAGTATGGATTAACAC GAGTAACGGGACAAATGCTCAGGCAGCTACAATTACACAAGATACTCCTATTAATCAGATTTTTACAGATACAGCTCTAG CGGAAAAAATGAAGACGGTCTTAGGAAAAACGAATGTAACAGACACGGTCTCGCAAACTGATTTAGACCAAGTTACGACG CTTCAGGCAGATAGATTAGGGATAAAATCTATCGATGGATTGGAATACTTGAACAATTTAACACAAATAAATTTCAGCAA TAATCAACTTACGGATATAACGCCACTTAAAGATTTAACTAAGTTAGTTGATATTTTGATGAATAATAATCAAATAGCAG ATATAACTCCGCTAGCTAATTTGACGAATCTAACTGGTTTGACTTTGTTCAACAATCAGATAACGGATATAGACCCGCTT AAAAATCTAACAAATTTAAATCGGCTAGAACTATCTAGTAACACGATTAGTGATATTAGTGCGCTTTCAGGTTTAACTAA TCTACAGCAATTATCTTTTGGTAATCAAGTGACAGATTTAAAACCATTAGCTAATTTAACAACACTAGAACGACTAGATA TTTCAAGTAATAAGGTGTCGGATATTAGTGTTCTGGCTAAATTAACCAATTTAGAAAGTCTTATCGCTACTAACAACCAA ATAAGTGATATAACTCCACTTGGGATTTTAACAAATTTGGACGAATTATCCTTAAATGGTAACCAGTTAAAAGATATAGG CACATTGGCGAGTTTAACAAACCTTACAGATTTAGATTTAGCAAATAACCAAATTAGTAATCTAGCACCACTGTCGGGTC TAACAAAACTAACTGAGTTAAAACTGGGAGCTAACCAAATAAGTAACATCAGTCCCCTAGCAGGTCTAACCGCACTCACT AACTTAGAGCTAAATGAAAATCAGTTAGAAGATATTAGCCCAATTTCTAACCTGAAAAATCTCACATATTTAACGTTGTA CTTTAATAATATAAGTGATATAAGCCCAGTTTCTAGTTTAACAAAGCTTCAAAGATTATTTTTCTATAATAACAAGGTAA GTGACGTAAGCTCGCTTGCGAATTTAACCAATATTAATTGGCTTTCGGCTGGGCATAACCAAATTAGCGACCTTACACCA TTGGCTAATTTAACAAGAATTACCCAATTAGGATTGAATGACCAAGAATGGACAAATCCACCAGTGAACTACAAAGTAAA TGTATCCATTCCAAACACGGTGAAAAATGTGACGGGCGCTTTGATTGCACCAGCTACTATTAGCGATGGCGGTAGTTACG CAGAACCTGATATAACATGGAATTTACCTAGTTATACCAATGAAGTAAGTTATACCTTTAACCAATCTGTCACCATTGGA AAAGGAACGACAACATTTAGTGGAACTGTGACACAGCCACTTAAGGCAATTTTTAATGCTAAGTTTCATGTGGACGGCAA AGAAACAACCAAAGAAGTGGAAGCTGGGAATTTATTGACTGAACCAGCTAAGCCTGTAAAAGAAGGTTATACATTTGTTG GGTGGTTTGATGCCCAAACCGGCGGAACTAAATGGAATTTCAGTACGGATAAAATGCCGACAAATGACATCGATTTATAT GCGCAATTTAGTATTAACAGCTACACAGCAACGTTTGATAATGACGGTGTAACAACATCTCAAACAGTAGATTATCAAGG CTTGCTACAAGAACCTACGGCACCAACAAAAGAAGGTTATACTTTCAAAGGCTGGTATGACGCAAAAACTGGCGGTGACA AGTGGGATTTTGCAACGAGTAAGATGCCTGCTAAAAACATCACCTTATATGCTCAATATAGCGCCAATAGCTATACAGCA ACCTTTGATGTTGATGGAAAAACAACGACTCAAGCAGTAGACTATCAAGGACTTCTAAAAGAACCAAAAACGCCAACAAA AGCCGGATATACTTTCAAAGGTTGGTATGACGAAAAAACAGATGGTAAAAAATGGGATTTTGCGACAGATAAAATGCCAG CAAATGATATTACGCTGTACGCTCAATTCACGAAAAATCCTGTGGCACCACCAACAACTGGAGGGAACACTCCGCCGACT ACAAATAACGGAGGGAACACTACACCACCTTCCGCAAATATACCTGGAAGCAACACATCTAACACATCAACTGGGAATTC AGCTAGCACAACAAGTACAATGAACGCTTATGACCCTTATAATTCAAAAGCAGCTTCACTCCCTACAACTGGTGATAGCG ATAATGCGCTCTACCTGTTGATAGGATTGTTAGCAGTAGGAACTGCAGTGGCTCTTACTAAAAAAGCACGTGCTAGTAAA TAG Protein sequence : MRRKRYVWLKSILVAILVFGSGVWINTSNGTNAQAATITQDTPINQIFTDTALAEKMKTVLGKTNVTDTVSQTDLDQVTT LQADRLGIKSIDGLEYLNNLTQINFSNNQLTDITPLKDLTKLVDILMNNNQIADITPLANLTNLTGLTLFNNQITDIDPL KNLTNLNRLELSSNTISDISALSGLTNLQQLSFGNQVTDLKPLANLTTLERLDISSNKVSDISVLAKLTNLESLIATNNQ ISDITPLGILTNLDELSLNGNQLKDIGTLASLTNLTDLDLANNQISNLAPLSGLTKLTELKLGANQISNISPLAGLTALT NLELNENQLEDISPISNLKNLTYLTLYFNNISDISPVSSLTKLQRLFFYNNKVSDVSSLANLTNINWLSAGHNQISDLTP LANLTRITQLGLNDQEWTNPPVNYKVNVSIPNTVKNVTGALIAPATISDGGSYAEPDITWNLPSYTNEVSYTFNQSVTIG KGTTTFSGTVTQPLKAIFNAKFHVDGKETTKEVEAGNLLTEPAKPVKEGYTFVGWFDAQTGGTKWNFSTDKMPTNDIDLY AQFSINSYTATFDNDGVTTSQTVDYQGLLQEPTAPTKEGYTFKGWYDAKTGGDKWDFATSKMPAKNITLYAQYSANSYTA TFDVDGKTTTQAVDYQGLLKEPKTPTKAGYTFKGWYDEKTDGKKWDFATDKMPANDITLYAQFTKNPVAPPTTGGNTPPT TNNGGNTTPPSANIPGSNTSNTSTGNSASTTSTMNAYDPYNSKAASLPTTGDSDNALYLLIGLLAVGTAVALTKKARASK |
Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
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inlF | AAB67968.1 | internalin | Virulence | Internalin | Protein | 3e-137 | 45 |
Gene | GenBank Accn | Product | ID of source DB | Alignment Type | E-val | Identity |
M637_04850 | YP_008274774.1 | internalin | VFG0075 | Protein | 0.0 | 98 |