Gene Information

Name : CFSAN002069_10800 (CFSAN002069_10800)
Accession : YP_008250972.1
Strain : Salmonella enterica CFSAN002069
Genome accession: NC_021812
Putative virulence/resistance : Virulence
Product : membrane protein
Function : -
COG functional category : -
COG ID : -
EC number : -
Position : 2226715 - 2243400 bp
Length : 16686 bp
Strand : -
Note : Derived by automated computational analysis using gene prediction method: GeneMarkS+.

DNA sequence :
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GTATGGAATTTTCAATTTACCACAGCGTTATCCGATGGCTCGCATGACGTAACGGTAAAAGTAGAAGATATTGCCGGTAA
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GGGTTGATAATACAGACCATATTATTAATGAAAAGAATCCTGCACTGACAGGAACCGCTGCACCCTATTCAACGGTTAAA
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AGGTTTGGTTGATGGCGATCATAGAATAACCGCTTCAGTTGAAGATATCGCTGGCAACATTGCCCATTCGGATCCTTTCT
TAATTAGCGTCGATACTGCTATTTCAATACCGATAGTTTCATTGAGCCCGGATTCAGATTCGGGAATTTCAGATGATAAT
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AAGAGATCGAACTTTCTCACCTCAATGGTAGTTGGTTATTTACACCAGGGAATACGTGGGCGGATGGCAGCTACACGTTA
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TGATGGGGTGGAACTGGTCAACGATAGCGGCGTGAAAGGCGATAATATGACCAACGACGACCGTCCCCACTTTCGTGTGA
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GGAAGCTGGGAGTATATCTGGCCGACAGACCTGGCAGATGGTCAATACACGCTAACGGTGGAAGCGACTGATAAAGCAGG
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CGCGTTACGGTCAGCGTGGAGCATGGCGGCGTCACCACCACATTTGACGCCACGAAAGGCACAGGCGGATGGACCTTTAC
GCCGCCGACATCATGGGCGGATGGTGATTATACCCTGAGTGTGTCAGTCGAAGATAAAGCGGGGAACACCAGCCATTCTG
CATCGCTGACGGTGACGGTGGACACGCAAATCGCCATTAATAACATTGAACTGGTCAATGACAGCGGTATTCCCAACGAT
AATCTGACTAATAACGTGCGTCCGCACTTCCAGGTGACGGTACCGACGGATGTCAACGTGGTGCGCCTGAGCATTGACGG
CGGCAAGACGTGGTTCAACGCTACCCAGAACGCGACGCCGGGCGTCTGGGATTATATCTGGCCGGATGATGTGGCCGACG
GAGGCTATACCCTGACGGTAGAAGCGACCGATGAGGCGGGAAATAAGACAACACAGACGCTCGATTTCACCATCGATACC
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GCCGGGCTTTACCCTCAACAATATTGATACCGATGTCAGCCGGGTAACAGTGGAGGTAATGCACAATGGCATTAAACAGG
AGGTGCCACTGGTTCAGACCGGCGGACAGTGGCGCTTTGCGCCGACCAGCGACTGGGCGGACGGCGACTATATCCTGACG
GTGAAGGTAGAAGATAGGGCCGGAAATGTGAAGCAGTCCGCGCCGTTGACGGTGACAGTAGACACGCACATCGCCATTGA
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TACCGGCGGATGTTAACGGTGTAAGACTGAGCATTGATGGCGGCAAAACGTGGTTTGACGCCACGCAGAGCGCGACGCCG
GGCGTCTGGGATTATACCTGGCTGACGAATGTGGCTAACGGCCCTCACACCCTGATGGTGGAAGCGTCCGACAAGGCGGG
AAACAAAACGACGCAGAAACTGGACTTCATCATCGATACCATGCTGTCAGAACCGACGATTACCCTGGACAGTGCGGATG
ACAGCGCCGCTGGCGATAACATCACCAACGTTAAGATGCCAGGCTTTACCCTCGGTAATATCGACGCCGACGTGACCAAA
GTGGTGGTGACGGTGGCGCATGATGGTAAGAACCAACAGATAGAGTTGATTAAGAACGGCGGTGTGTGGCGCTTTACGCC
GGGCGCAGCCTGGACCGATGGCGACTATACGTTGACGGTAAAGGTAGAAGATAAGGCGGGTAATACAAATTATTCTGCGC
CGCTGACGGTGACTATCGATACGCAAACGTCTATTGATCGCATTGAGCTTCTTAATGACACGGGTATTGTCGGGGATAAC
CTGACCAATGAAGCACGTCCACAGTTTCATATTACGGTACCGACGGACGTGAACTCTGTGCAACTGAGTCTTGATGGCGG
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ATACCCTGACAGTGAAAGCAACCGATGTTGCAGGCAACACGGCGACGGAAACGCTCAATTTTATCATTGATACCACATTG
TCGACACCGACCATCACGCTGGATAGCGCAGATGATAGCGGCACCGCCAACGATAATAAGACTAACGTTAAAACGCCGGG
TTTTATTATCGGAGGTATTGATTCTGACGTGACTCAGGTCGTCGTGCAGGTGATGCGCGATGGTCACAGCGAGGAGGTGG
AGCTGACGCAGACTAACGGGCAGTGGCGTTTTGTACCCGGCAGCGCGTGGACTGATGGCGACTATACGCTGACGGTAACG
GTGAAAGATGAGGCGGGTAATATTCGCCACTCAGCGCCGTTGACGGTCACCATCGATACGCAAATCGCCATTGACCATAT
TGAACTGGTCAATGACAGCGGTATTCCCGACGATAATCTGACCAATGAAGCGCGCCCGCACTTCCAGGTGACGGTACCGA
CGGATGTCAACGTGGTGCGCCTGAGCATTGACGGCGGCAAGACGTGGTTCAACGCTACCCAGAGCGCGACGCCGGGCGTC
TGGGATTATACCTGGCTGGCTGATGTGGGAGAGGGTAAGCATACCCTGACAGTGGAGGCGACCGACAAGGCGGGAAACAA
AACGACGCAGCAACTGGACTTCATCATCGATACCCTACTGTCAGAACCGACTATCGTGCTGGACAACACGGACGACAGCG
GAACAAAAGGCGATAACCTGACCAACGTAAATAAGCCGACGTTTTTACTGGGCAATATTGACGCAGACGCGCGGTATGTC
ACGGTTGAGGTGCAGCATGGCGGCACGAAAGAAGTGCTGACGGCCACCAAAGACGCGACCGGCAACTGGAGCGTGACACC
GACCGGCACATGGGCAGATGGCGACTATACGCTGACGGTGAGGGTGGAAGATGAGGCGGGGAACGAAAAACACTCAGCGT
CGCTGACGGTCACTGTTGATACCCAAATCACCATTGATGCTATTGAACTGGTTAATGATAACGGTATTCCCGGCGACAAT
ATGACTAACGACGCCCATCCGCAGTTCCGCGTGACGGTACCGGGGGACGTTAACGAAGTCAGTCTGAGCATTGACGGTGG
CGTGACCTGGGTTAAGGCGACACAGAGCGCGACGCCGGGCGTCTGGAATTATACCTGGCCGGGCACCGTGCCGGATGGCG
ACTATACGCTGAATGTGAAAGCGACTGACAATGCGGGTAATACGGTGACGGAGACACTCCACTTCACTATTGATACCACG
CTGTCGACGCCGGTCATCGTACTGGATAGCGCGGACGACACCGGCATCCAGGGCGATAACATGACCAATCGCACCCAGCC
GACATTTAACTTGCAACATATTGATGATGATGCCGTTCGCGTTACGGTCAGCGTGGAGCATGGCGGCGTCACCACCACAT
TTGACGCCACGAAAGGTGTAGGCGGATGGACCTTTACGCCGCCGACATCATGGGGGGCGGGCGATTATACCCTGAGTGTG
TCAGTCGAAGATAAAGCGGGGAACACCAGCCATTCGGCATCGCTGACGGTGACGGTGGACACGCAAATCGCCATTAATAA
CATTGAACTGGTCAATGACAGCGGTATTCCCGACGATAATCTGACTAATAACGTGCGTCCGCAGTTCCAGGTGAAGGTAC
CGACGGATGTCAACGAGGTGCGCCTGAGCATTGACGGCGGCAAGACATGGTTCAACGCTACCCAGAGCGCGACGCCGGGC
GTCTGGGATTATACCTGGCTGGCTGATGTGGGAGAGGGGAAGCATACCCTGACAGTGGAGGCGACCGACAAGGCGGGAAA
CCAGACGACGCAGCAACTGGACTTCATCATCGATACCCTACTGTCAGAACCGACTATCGTGCTGGACAACACGGACGACA
GCGGAACAAAAGGCGATAACCTGACCAACGTAAATAAGCCGACGTTTTTACTGGGCAATATTGACGCAGACGCGCGGTAT
GTCACGGTTGAGGTGCAGCATGGCGGCACGAAAGAAGTGCTGACGGCCACCAAAGACGCGACCGGCAACTGGAGCGTGAC
ACCGACCGGCACATGGGCAGATGGCGACTATACGCTGACGGTGAGGGTGGAAGATGAGGCGGGGAACGAAAAACACTCAG
CGTCGCTGACGGTCACTGTTGATACCCAAATCACCATTGATGCTATTGAACTGGTTAATGATAACGGTATTCCCGGCGAC
AACCTGACCAATGACGTTCGTCCACACTTCCGTGTCACGGTGCCAGGGGATGTCAACGAGGTACGTCTGAGTATCGACGG
CGGTAATACGTGGGTTCGTGCAACACAGGGCACGGCAGGGATCTGGGATTACACCTGGCCGAAAGATGTGACCGACGGGC
TACATACCCTGACGGTAGAAGCGACCGATAAGGCGGGAAATAAGACGACGCAGACGCTCGATTTTACCATTGATACCCGG
CTGTCAACGCCTACCATCACTATGGATAGCAGGGACGATACAGGTGCCATTGGCGATCATATTACGAGCGTCAAAAGACC
GGGCTTTACCATTGGCAATATTGACTCCGATGCGCAATCGGTCATTTTGCGGATCACACAGGGCGGCAATAGCCAGGAAG
TGACACTAACCCAGGTTGGAGGACAGTGGCGCTTTACGCCAGATGCTGACTGGGCGGACGGTAGCTATACGCTAACGGTA
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TATTACATTGGTCAATGATCATGGCGTGCCTGATGACAATCTAACTAACAGTACCCGTCCGCAGTTTGAGATCACGGTGC
CGGCGGATGTGAATTCTGTGCAACTAAGCATTGATGGGGGCGCAAACTGGGTAAGCGCGGCGCAGGGTATCGAAGGCGTC
TGGGGCTATACCTGGCCAACGGATATGGGCGATGGAAAACACACCCTAACCGTCATGGTCACCGACAGAGCGGGCAATAC
GGCGACGCAAACGCTTGAATTTTTCATCGACACCCGGTTGTCGACGCCGACCATTGCGCTGGATAGCACGGATGATACCG
GTACGCCTGGCGATGATATGACCAATCGCACCCGACCGACCTTTATTCTGCAGAATATCGATTCGGATGTTATCAACGTT
ACAGTCAGCGTCACGCATAATGGAACGACAACCTCGTTTACCGCGACACAGGGGGCTGGAGGCTGGAGCTTTACACCGCC
AGCGCCGTGGGGCGACGGTGATTATACGCTGACGGTGACAGTGGAGGATCGGGCGGGAAATACGCGTCCGTCTACGCCGC
TGACGGTGACAGTGGATACGCAAATAGCCATTGATCATATTGAATTAGTCAACGATAGCGGCGTCCCTGGCGATAATATC
ACAAAACATGTGCGTCCGCAGTTCCAGATCTCGGTACCGGATGATGTGGAAAAGGTTCTTCTGAGTATTGACGGCGGCAC
GACCTGGGTTACTGCAATCAAGAGTTCGACGGCTGGCATTTGGGATTACACCTGGCCGACGGATATGCCAGAGGGACAGC
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TTGACGCCAACCATTGAGCTGGCGCCCGATCAGGATACCGGACAGAATAAGAACGATAATCTGACCAGCGTCACTCAGCC
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TGGTACTCACCGAATCAGCCGACGGCTGGCGTTATCGACCGGATTCTGCTTTGGCGGACGGTAGCTACACATTCACCGTG
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GGCGGGGAATGTAAAAGAATCTGCGCCGTTAGAGGTGCGTATTGATACCACGACAACCATTAACAATATCGTATTGCTTA
ATGATACTGGCGTGCAGAATGATCAATTAACGAATGTTGCCAAACCGTCATTCAGAATTGACGTTCCCGGTGATGTCATC
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CCCGAATACTCTGGTTGACGGCACATATACCCTTCGCGTAGAGGCCACGGATGAGGCAGGTAATATTGCGAATAAAGATT
TAGTATTTAATATCGATACTAATATACAGGTTCCGACTATTGCTTTAGACGCAGGACAAGATACCGGAGCGAATACAGCC
GATAATATCACTAATATTTCACGACCCACCTTTACGATTGGTAATGTTGACCCCGATGTTATTAAAGTCGTGGTGACGAT
TGATGGTCATGATTATAACGCGACTAAGGTTGGGGCTGGTTGGCAATTTACACCAGGCAATGCCATTCCGGATGGTTCTT
ATAATATTACCGTTACGGTTGAAGATAAGGCCGGAAATACCGCGACATCGAAACCATTACCTGTTGTGATAGATACGACG
GCTGAAATTGAAAGCGTCACGTTGGTTACAGATAGCGGTGATAGCGATGTAGATAACATTACCAAAGTCGACAAGCCGCA
GTTTAGTATTGTTACCGCTGATGATATTACCCATGTGCGCGTTAAAATCGATAACGCCGCTAATTGGATTGAACTCACAA
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CTGCCGGATGGCATGTATACCATCAACGTCGTCGCAACAGATGTCGCGGGAAATACTGCGCAAACGCAGGAAAGATTCAC
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GTCCTGAGTTCAAAGGGCTCGCCGAAGCGTTCTCGACGATTATGATTCAGTGGGATGGGAAAGTGGTCGGCTCGGCAAAC
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GATGGCACATGGCGCGCGCCGATACTGCTGCAAGATGATGGTACGTTTAATATTCATTTCAGCATTACTGACGTTGCTGG
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GGGAAGTTTGGGTTAATGACAAAGGCCACTGGCAGATGCCGGTGAACCCGCTTTATTTCACAGAAGGCCAGCTGGATATC
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TACCAGCGAGCTTGATGACAATAAATCATCATCGAAAACGGACTGGTGGAGTAATAGCTCCACTATTACCATGAGAGGTA
TGGGGGAAATTGGCGCTACGGTATCATTAATCGTGGCAGGGGTCACGCTGGCAACCGCTGTCGTTGCGGCTAATGGGCAG
TGGGAGTTATCGACCGATCAACTTCCGGAAGGGAAATACGATATCACTTTGAGTATTGAGGATAACGCAGGCAACCGTAA
GGAAGAGGTACATGAAATATTTATTGATCGAACGCCGCCAAACGCTCCGGTCGTAACTTATTCAGATATTGTCAACGATC
TAATTATTATGCAGGGAACGGCGGAAGCCAAATCTCAGCTAATAATAACCGATAGTAATGGGAATACTTATACGTTAACC
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TGGTAACCGGAGTGATGATGTCCCTCTCGATATCATGAAAGAGACTCCTGTTATTTCATTATCTCCAGACTCAGACAGTG
GTACGGTGGGCGATAATATTACGCGAGATAATCAGCCTACCTTTATTATCGGGAATCTGGAAAGCGATGTTGTGGTCGTT
CAGGTCGATATCAATGGGACCGTATATAATGCTGAAAAAAATGCCGATGGCGTTTGGTTCTTTACGCCAGGTACACCGTT
AGCTGATGGTTCCTACACGATATCGGTAATCGCAAGCGATGCCGCGGGTAATCAGAAAAACTCGTTACCCATTACCGTTA
CGATCGACAGTACGCTGACCGTGCCGGAGATTGCGCTGGCAGCAGGTGAAGACAATGGCGCTTCAGACAGCGATAACGTG
ACGAATCACAATCACACCCAGCCTAAGTTTACGCTGCAGCATATTGATGCTGACGTGACCGGGGTGACCGTAAACGTGAC
GCATAATGGCGTGACAGACATCTATCAGGCGACGCAAGACGCGGATGGCTGGACATTCACGCCGCCAGCCGCCTGGAATG
ATGGTACCTACACGCTGAGCGTGACGGTGGTGGATCGCGCGGGGAACTCACTGCAATCTGCTTCGCTGGAGGTGACGGTT
GACTCAACGGTGACGGTAACAGCGGATAGCCAGCATGACGATGCGATCGATGACGCCACGGCAACAGCGGTTACTCCACC
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AGACAGCCTATAGTATTACATTGTTAAACGCTGACTCTGGGGATGAAATAGATCGTTCAATTAGTCAGACACCTTCTTTT
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Protein sequence :
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KTEPNAIISVINSETGEEVIFKANDKGEWTFNFTSDSVEGVNNLTFTVEDVAGNKKDFSFSYIIDTVAPVPPTVSLEDFV
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TEDDINDSPSTSSVGHNNNGAIDVFAVNEVTLPVDNQEEHA

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
SC4140 YP_219127.1 inner membrane protein Not tested SPI-4 Protein 0.0 99
siiE CAE11797.1 large repetitive protein Virulence SPI-4 Protein 0.0 99
STM4261 NP_463126.1 inner membrane protein Not tested SPI-4 Protein 0.0 99

• Homologs from VFDB (virulence genes)

GeneGenBank Accn Product ID of source DB Alignment Type E-val Identity
CFSAN002069_10800 YP_008250972.1 membrane protein VFG0581 Protein 0.0 99