Gene Information

Name : lhe_0249 (lhe_0249)
Accession : YP_008235751.1
Strain : Lactobacillus helveticus CNRZ32
Genome accession: NC_021744
Putative virulence/resistance : Unknown
Product : Neopullulanase
Function : -
COG functional category : -
COG ID : -
EC number : 3.2.1.135
Position : 258553 - 260274 bp
Length : 1722 bp
Strand : +
Note : -

DNA sequence :
ATGCAATTAGCAGCATTAAAACACAGAACTGAAAGTGAAGACAGCTTTGTAATTGATGCGACTCATGTTCGTGTTCGTTT
TCATAGCGCAAAGAATGATGTTGAAAAGGTTATTGTGCACTATTGCGATAACTATTTGCCATTAAACCAGGCTAAAACAA
TTGAAATGACTAAAATTGGTGAAGGCCAAGTCGAGGATCACTGGGGAGCCACCCTTGAGGCACCATTCCATCGTTTAAAG
TACACATTTGAAGTAATTGGTAATGATGGAACCAGCGTTGTTGTAGGTGATAGGGCAATTAGCAGCGATGTTGAAAGTGC
TCTGATGGAAGACGGATATTATTTTAAGGTGCCGTATTGTCATGATATTGATATGGTTAAGACACCAGAATGGGTAAGAC
ATACTGTTTGGTACCAAATTTTCCCAGAGCGTTTTGCTAATGGTGATAAATCTAATGATCCTAAAAATGTAAAGCCTTGG
AATCCTGAAGACCATCCTGGTCGAGAAGACTACTACGGTGGTGATTTGCAAGGTGTGTTAGACCATTTGGATTATCTAAA
GAAGCTAGGAGTAAATGGCTTATACTTCTGTCCTGTTTTTAAAGCAGGGTCCAACCACAAATATGACACGATTGATTACT
TGCAAATTGATCCGGAATTCGGTGATAAAGATCTATTTGCCAAGGTAGTTAATGAAGCTCATGCACGTGGCATGAAAGTT
ATGCTAGATGCGGTGTTTAACCACTTAGGTGATAAGTCAATGCAATGGCAAGATGTGGTCAAAAATGGCCCAAGTTCTCG
TTTTGCTGGCTGGTTCCACATTAATGAATATCCGGTTGAACCATATCATGATCCATTGCAAGGTGAAGGAAATCCTCAAT
TTGATACTTTTGCCTTTGAAAAACACATGCCAAAATTAAATACTGCTAACCCTGAAGTACAAGACTTCTTGCTAGAAATA
GCAACTTACTGGGTGAAATACTTTGACATTGATGCTTGGCGTTTGGATGTTGCCAATGAAGTGGATCATCATTTCTGGAA
GAAGTTTCATAAGGCTGTGACCGATATCAAGCCAGACTTTTACATTGTCGGTGAAGTTTGGCACTCAGCTCGTCCATGGC
TTAATGGTGATGAATTTACAGGTGTAATGAATTATCCATATACTTTGCAAATTGAAGATCATTTCTTTAAGCACAAGCTA
ACAGCTGATCAAATGACCAAGCGTTTAACTGATCAGCTCATGAAGTACCGTGATTCAACTAATGCGGCAATGATGAACAT
GCTTGATTCACATGATACTGCTAGAATTTTGACAGTGGCTAACGGCGATCAAGATTTGGCTTTGCAGGCATTAACCTTTG
AATTTGTGCAAAAAGGCAGTCCATGTATTTATTACGGTACTGAAATGGGAATGGCTGGCGGCAATGACCCAGACTGTCGT
AAGCCGATGGATTGGTCAAAAGAAGATGGACCTGTTTGGCAAAGAGTTCATGAACTGATTAAGTTCCGTTTAGACCATGA
TGAGACCTTCGGAAAGGGTACAATTAAGTTACACGTAACAAAAAATGGCTTGATTGAGGTTGATAGAGACGGAATTGAAT
CTGTTAAGGCATACTTTAATACCACCGATCATGATGTAAAAATCGATTGTAAAGATTCATTTAGTCAAGATTATCAAAAT
GGAGTATTGGCTCCAAAAGGCTTTGTAATCACGGTTCGCTAA

Protein sequence :
MQLAALKHRTESEDSFVIDATHVRVRFHSAKNDVEKVIVHYCDNYLPLNQAKTIEMTKIGEGQVEDHWGATLEAPFHRLK
YTFEVIGNDGTSVVVGDRAISSDVESALMEDGYYFKVPYCHDIDMVKTPEWVRHTVWYQIFPERFANGDKSNDPKNVKPW
NPEDHPGREDYYGGDLQGVLDHLDYLKKLGVNGLYFCPVFKAGSNHKYDTIDYLQIDPEFGDKDLFAKVVNEAHARGMKV
MLDAVFNHLGDKSMQWQDVVKNGPSSRFAGWFHINEYPVEPYHDPLQGEGNPQFDTFAFEKHMPKLNTANPEVQDFLLEI
ATYWVKYFDIDAWRLDVANEVDHHFWKKFHKAVTDIKPDFYIVGEVWHSARPWLNGDEFTGVMNYPYTLQIEDHFFKHKL
TADQMTKRLTDQLMKYRDSTNAAMMNMLDSHDTARILTVANGDQDLALQALTFEFVQKGSPCIYYGTEMGMAGGNDPDCR
KPMDWSKEDGPVWQRVHELIKFRLDHDETFGKGTIKLHVTKNGLIEVDRDGIESVKAYFNTTDHDVKIDCKDSFSQDYQN
GVLAPKGFVITVR

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
SPN23F_09660 YP_002510949.1 alpha-amylase Not tested PPI-1 Protein 2e-128 45