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Name : lhe_1043 (lhe_1043) Accession : YP_008236456.1 Strain : Lactobacillus helveticus CNRZ32 Genome accession: NC_021744 Putative virulence/resistance : Unknown Product : trehalose-6-phosphate hydrolase Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 1214128 - 1215789 bp Length : 1662 bp Strand : + Note : - DNA sequence : ATGAATGATTTAGGCAAAAAAGTTATTTACCAAATTTATCCCAAATCTTTTTATGACTCTAATGGTGATGGAATTGGCGA TATTCCAGGCATTATTCAAAAAATTGACTATATTAAGAAACTTAATGTTGATATGATTTGGTTTAATCCATTTTTTGTAT CGCCGCAGAATGACAGCGGCTATGATATTGCAGATTACTATAATATCGATCCTCGCTTTGGTACGATGGCTGATTTTGAA GAATTGGTTGCTAAATTAAAGGAAATCGGTGTTGGCGTCATGTTAGATATGGTGCTTAATCACTGTTCTACTGAGAATAT TTGGTTTAAAAAAGCATTGGCAGGGGATGAAAAGTACCGCAAGTTTTTTTATTTGAGAAAGGCTAAGCCAGATGGCAGCG TACCTAATAATTGGCAAAGCAAATTCGGTGGTTCTGCCTGGGCCAAATTTGGTGATACAGATTATTATTACCTTCATTTA TATGATCCAACTCAGGCTGACCTTGATTGGCATAATCCTGAAGTTAGAAAAGAGTTGTTCAAGGTAATTAACTTCTGGCG CAGCAAGGGCATACATGGCTTCCGCTTTGATGTAATTAATGTTATTGGCAAGGATGAAGAATTGGTTGATTCAACTGATC CAGTTGAAGAAAAAAGTTTGTACACAGATACTCCTGTAGTTCATAAGTATTTAAAGGAAATGAACGCTGCAACTTTTGGT CAAGATCCCGATTCTGTAACAGTAGGAGAAATGTCATCAACCACAATTGCTAATTCAATTGAATACTCCAAGCCAAGTGA ACATGAATTATCCATGGTCTTTACTTTCCATCATTTGAAAGTTGATTATAAAGATGGTGAAAAATGGTCTAAGATGCCAT TTGATTTTATGAAGCTCAAGGAATTATTTACTGAATGGCAAGAAAAGATGGACCAAGGTGGGGGTTGGAATGCGCTATTT TGGAATAATCATGATCAACCTTGGGCGTTGAATCGTTTCGGTAATACTGGAAAGTATCGTGAAAAGTCCGCAGAGATGCT TGCAACTGCAACTCATTTAATGCGTGGTACGCCATACATTTATATGGGTGAGGAAATCGGGATGATGGATCCAGATTATT CATCTATGAATGATTACGTTGATGTTGAAGCAAAAAATGCATTTAAAGAATTAACGGCAAAAGGCATGAGTGAAAAAGAC GCTTTTGAAATCATTAAGACCAAGGCAAGAGATAATTCACGTGTGCCAATGCATTGGGATGATAGTCAATATGCTGGCTT TAGCGATGTAAAGCCATGGCTGATGCCAACTGATCAAAAGCAAGTTAATGTAGAGAAAGAACTATCAAGTGGCGAAATTT TTGACTATTATCAAAAACTAATTAAGTTGCGTAAGAATGAAAAGTTAATTTCTGATGGCCATATTAAGATGTTCTTGAAG GATCATCCACAAGTTTTTGCATATGAACGCTTCTTAGATAATAGTGATAAAAAATTATTAGTCTTTACTAACTTCTATGG CAAGGAATGTCAGGCTAAATTACCTAAAGAATATGTTAATAAGAACTATCAAGTTTTAATTAGCAATTATGAACATAACA GTAACCAATTTAAACAAGAGATCATCTTAAAGCCGTATGAGGCTTTAGCAGTTGTGATTTAG Protein sequence : MNDLGKKVIYQIYPKSFYDSNGDGIGDIPGIIQKIDYIKKLNVDMIWFNPFFVSPQNDSGYDIADYYNIDPRFGTMADFE ELVAKLKEIGVGVMLDMVLNHCSTENIWFKKALAGDEKYRKFFYLRKAKPDGSVPNNWQSKFGGSAWAKFGDTDYYYLHL YDPTQADLDWHNPEVRKELFKVINFWRSKGIHGFRFDVINVIGKDEELVDSTDPVEEKSLYTDTPVVHKYLKEMNAATFG QDPDSVTVGEMSSTTIANSIEYSKPSEHELSMVFTFHHLKVDYKDGEKWSKMPFDFMKLKELFTEWQEKMDQGGGWNALF WNNHDQPWALNRFGNTGKYREKSAEMLATATHLMRGTPYIYMGEEIGMMDPDYSSMNDYVDVEAKNAFKELTAKGMSEKD AFEIIKTKARDNSRVPMHWDDSQYAGFSDVKPWLMPTDQKQVNVEKELSSGEIFDYYQKLIKLRKNEKLISDGHIKMFLK DHPQVFAYERFLDNSDKKLLVFTNFYGKECQAKLPKEYVNKNYQVLISNYEHNSNQFKQEIILKPYEALAVVI |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| malL | YP_251987.1 | oligosaccharide alpha-1,6-glucosidase | Not tested | SCCmec | Protein | 7e-92 | 42 |
