|
Name : hsdR (CA347_205) Accession : YP_008127088.1 Strain : Staphylococcus aureus CA-347 Genome accession: NC_021554 Putative virulence/resistance : Unknown Product : type-1 restriction enzyme R protein Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 232030 - 234819 bp Length : 2790 bp Strand : + Note : - DNA sequence : ATGGCATACCAAAGTGAATACGCATTAGAAAATGAAATGATGAATCAACTTGAACAATTGGGTTACGAAAGGGTATCGAT ACGTGATAATAAGCAATTGCTTGATAATTTCAGAACGATTTTAAATGAGCGTCATGCGGACAAATTAGAAGGCAATCCCT TAACAGATAAAGAGTTTCAACGTCTGTTAACGATGATTGATGGGAAAAGTATTTTCGAGAGTGCCCGTATTTTACGTGAT AAATTACCACTTAGACGTGATGATGAGTCTGAGATTTATTTGTCGTTTTTAGATACGAAAAGTTGGTGTAAAAATAAGTT TCAAGTGACGAATCAAGTATCTGTCGAAGATAGATATAAAGCACGTTATGATGTAACGATATTAATCAACGGACTACCCC TTGTCCAAGTTGAATTGAAACGTCGAGGTATTGATATTAATGAGGCGTTTAACCAAGTAAAACGTTACCGTAAACAAAAT TACACAGGCTTATTCCGCTACATACAAATGTTTATCATTAGTAATGGTGTTGAAACGCGATACTTTTCTAATAATGATAG CGAACTATTGAAGAGTCACATGTTTTATTGGAGTGACAAACAGAATAACCGAATCAATACATTGCAATCGTTTGCTGAGT CGTTTATGAGACCTTGTCAATTAGCTAAGATGATATCGCGCTATATGATTATTAATGAAACAGATAGAATACTGATGGCA ATGCGCCCGTATCAAGTGTATGCGGTAGAAGCACTAATTCAACAAGCGACTGAGACAGGGAATAATGGATATGTATGGCA TACAACTGGAAGTGGTAAGACATTGACTTCTTTTAAAGCGAGTCAGATTTTATCACAACAAGATGACATTAAGAAAGTTA TCTTTTTGGTTGACCGTAAAGACTTGGATAGTCAAACAGAAGAGGAATTTAATAAATTTGCTAAGGGTGCTGTCGACAAA ACTTTTAATACCTCGCAACTGGTACGCCAACTAAATGATAAAAGTTTGCCACTTATTGTAACGACAATTCAAAAAATGGC TAAAGCGATTCAAGGTAATGCCCATTTATTAGAACAGTATAAAACGAATAAAGTTGTATTTATTATTGATGAGTGTCATC GCAGTCAATTTGGTGACATGCATCGTCTAGTTAAACAACATTTCAAAAATGCCCAATATTTTGGATTCACTGGTACGCCA CGTTTCCCAGAAAATAGTAGTCAAGATGGTAGAACAACTGCAGATATTTTCGGTAGATGCTTACATACGTATTTAATTAG AGATGCCATTCATGATGGTAATGTACTTGGTTTCTCAGTTGACTATATTAATACTTTTAAAAATAAAGCTTTAAAAGCAG AAGATAACAGCATGGTTGAAGCAATTGATACGGAAGAAGTATGGTTAGCGGATAAACGTGTGGAATTAGTAACACGACAT ATCATCAATAATCATGATAAATATACACGTAATCGTCAATATTCAAGTATATTTACAGTTCAAAGTATTCACGCGCTTAT TAAATATTATGAGACATTTAAGCGACTTAACAAAAAGTTGGAACAACCATTAACGGTAGCTGGTATATTTACTTTTAAAC CTAATGAAGATGATCGTGATGGTGAAGTGCCATATCATTCACGTGAAAAATTAGAGATAATGATTAGTGATTATAATAAA AAGTTCGAGACGAATTTTTCAACAGACACGACTAATGAGTATTTTAATCATATTTCAAAAAACGTTAAAAAGGGCGTTAA AGATAGTAAAATTGATATCTTAATCGTTGTTAATATGTTCTTAACTGGTTTTGATAGTAAAGTACTGAACACTTTATATG TTGATAAGAATTTAATGTATCATGATTTAATTCAAGCGTATTCACGTACAAATAGGGTTGAAAAAGAATCAAAGCCATTT GGTAAAATTGTAAACTATCGTGACTTGAAAAAAGAGACAGACGATGCACTGAGAGTATTCTCACAAACAAATGATACGGA TACAATTTTAATGCGTAGTTATGAAGAGTATAAAAAAGAATTTATGGACGCTTATCGTGAGCTTAAAATGATTGTGCCGA CACCACACATGGTTGATGACATTCAAGATGAAGAAGAGCTAAAGCGCTTTGTTGAAGCTTATCGTTTATTAGCTAAAATA ATATTACGTTTAAAAGCATTTGATGAGTTTGAGTTTACAATTGATGAAATTGGAATGGATGAACAAGAGAATGAAGACTA TAAAAGTAAATATTTAGCCGTGTACGATCAAGTAAAAAGAGCGACGGCTGAGAAAAATAAAGTATCCATTTTAAATGATA TTGATTTCGAAATAGAAATGATGCGTAATGATACGATTAATGTGAATTATATTATGAATATATTGAGACAAATTGATCTT GAAGACAAAGCGGAACAACGTCGTAACCAAGAACAAATTAGACGTATTTTAGATCATGCAGATGATCCGACATTGAGGTT AAAACGAGATTTAATTAGAGAATTCATCGACAATGTTGTACCTTCTTTAAATAAGGATGATGATATCGATCAAGAATATG TTAATTTCGAAAGTATTAAAAAAGAAGCGGAGTTCAAAGGCTTTGCTGGAGAGAGATCTATCGATGAACAAGCCCTAAAA ACAATTTCAAATGACTACCAGTATAGTGGTGTAGTAAACCCACATCACCTTAAAAAAATGATTGGTGATTTGCCATTGAG AGAAAAACGTAAAGCAAGAAAAGCCATTGAATCTTTCGTGGCAGAAACAACTGAAAAATACGGTGTGTAA Protein sequence : MAYQSEYALENEMMNQLEQLGYERVSIRDNKQLLDNFRTILNERHADKLEGNPLTDKEFQRLLTMIDGKSIFESARILRD KLPLRRDDESEIYLSFLDTKSWCKNKFQVTNQVSVEDRYKARYDVTILINGLPLVQVELKRRGIDINEAFNQVKRYRKQN YTGLFRYIQMFIISNGVETRYFSNNDSELLKSHMFYWSDKQNNRINTLQSFAESFMRPCQLAKMISRYMIINETDRILMA MRPYQVYAVEALIQQATETGNNGYVWHTTGSGKTLTSFKASQILSQQDDIKKVIFLVDRKDLDSQTEEEFNKFAKGAVDK TFNTSQLVRQLNDKSLPLIVTTIQKMAKAIQGNAHLLEQYKTNKVVFIIDECHRSQFGDMHRLVKQHFKNAQYFGFTGTP RFPENSSQDGRTTADIFGRCLHTYLIRDAIHDGNVLGFSVDYINTFKNKALKAEDNSMVEAIDTEEVWLADKRVELVTRH IINNHDKYTRNRQYSSIFTVQSIHALIKYYETFKRLNKKLEQPLTVAGIFTFKPNEDDRDGEVPYHSREKLEIMISDYNK KFETNFSTDTTNEYFNHISKNVKKGVKDSKIDILIVVNMFLTGFDSKVLNTLYVDKNLMYHDLIQAYSRTNRVEKESKPF GKIVNYRDLKKETDDALRVFSQTNDTDTILMRSYEEYKKEFMDAYRELKMIVPTPHMVDDIQDEEELKRFVEAYRLLAKI ILRLKAFDEFEFTIDEIGMDEQENEDYKSKYLAVYDQVKRATAEKNKVSILNDIDFEIEMMRNDTINVNYIMNILRQIDL EDKAEQRRNQEQIRRILDHADDPTLRLKRDLIREFIDNVVPSLNKDDDIDQEYVNFESIKKEAEFKGFAGERSIDEQALK TISNDYQYSGVVNPHHLKKMIGDLPLREKRKARKAIESFVAETTEKYGV |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| SSP0054 | YP_300144.1 | type I site-specific restriction-modification system restriction subunit | Not tested | SCC15305cap | Protein | 0.0 | 75 |
