Gene Information

Name : CA347_2042 (CA347_2042)
Accession : YP_008128858.1
Strain : Staphylococcus aureus CA-347
Genome accession: NC_021554
Putative virulence/resistance : Unknown
Product : phage tail tape measure protein, TP901 family, core region
Function : -
COG functional category : -
COG ID : -
EC number : -
Position : 2093181 - 2097710 bp
Length : 4530 bp
Strand : -
Note : -

DNA sequence :
ATGGGAGAAAGAATAAAAGGTTTATCTATAGGTTTGGATTTAGATGCAGCAAATTTAAATAGATCATTTGCAGAAATCAA
ACGAAACTTTAAAACTTTAAATTCTGACTTAAAGTTAACCGGTAACAACTTCAAATATACCGAAAAATCAACTCATAGTT
ACAAACAAAGGATTAAAGAACTTGATGGAACTATCACAGGTTATAAGAAAAACGTTGATGATTTAGCCAAGCAATATGGC
AAGGTATCTCAAGAACAGGGCGAAAACAGCGCGGAAGCTCAAAAATTACGACAAGAATATAACAAACAAGCAAATGAGCT
GAATTTTTTAGAAAAAGAACTAGAAAAAACAACAACTGAGTTTGAAGAGTTCAAAAAAGCTCAAGTTGAAGCTCAAAGAA
TGGCAGAAAGTGGCTGGGGAAAAACCAGTAAAGTTTTTGAAAGTATGGGACCTAAATTAACAAAAATGGGTGATGGTTTA
AAATCCATTGGTAAAGGTTTGATGATTGGTGTTACCGCACCTGTTTTAGGTATTGCAGCAGCATCAGGAAAAGCTTTTGC
AGAAGTTGATAAAGGTTTAGATACAGTTACCCAAGCAACAGGAGCAACCGGCGGAGAGCTTAAGAAGTTGCAGAATTCAT
TTAAAGATGTTTATGGCAACTTTCCAGCAGATGCTGAGACTGTAGGCGGTGTTTTAGGGGAAGTTAACACAAGGTTAGGT
TTCACTGGCAAAGAACTTGAGAGTGCCACAGAGTCATTCTTGAAATTTAGTCACATAACAGGTTCTGAAGGCGTACAAGC
CGTTCAATTAATTACGCGTGCAATGGGTGATGCAGGTATTGAAGCTGATGAGTATCAAAGTGTACTTGATATGGTAGCGA
AAGCAGCACAGGCTAGCGGTATAAGTGTTGATACATTAGCTGATAGCATTACTAAATACGGTGCTCCAATGAGGGCTATG
GGCTTTGAGATGAAAGAATCAATCGCTTTATTCTCTCAATGGGAGAAATCAGGTGTTAATACTGAAATAGCCTTCAGTGG
TTTGAAAAAAGCTATATCCAATTGGGGTAAAGCTGGTAAAAATCCAAGAGAAGAATTTAAGAAGACATTAGCAGAAATTG
AAAAGACGCCGGATATAGCTAGCGCAACAAGTTTAGCGATTGAAGCATTTGGTGCAAAAGCAGGTCCTGATTTAGCAGAT
GCTATTAAAGGTGGTCGTTTTAGTTATCAAGAATTTTTAAAAACTATCGAAGATTCCCAAGGCACAGTAAATCAAACGTT
TAAAGATTCTGAAAGTGGCTCCGAAAGATTTAAAGTAGCAATGAATAAATTAAAATTAGTAGGTGCTGATGTATGGACTT
CTATTGAAAGTGCGTTTGCACCAGTAATGGAAGAATTAATCAAAAAGCTATCTATAGCGGTTGATTGGTTTTCCAATTTA
AGTGATGGTTCTAAAAGATCAATTGTTATTTTCGGTGGTATTGCTGCTGCAATTGGTCCTGTAGTTTTTGGATTAGGCGC
ATTTATAAGTACAATTGGCAATGCAGTAACTGTATTAGCCCCACTATTAGCTGGTATTGCAAAGGCTGATGGATTAATTA
GTTTTTTATCGACTAAAGTACCTATATTAGGAACTGTCTTCACGGCTTTAACTGGTCCAATTGGCATTGTATTAGGTGTT
TTGGCTGGCTTAGCAGTCGCATTTACAATTGCTTATAAGAAATCTGAAACTTTCAGAAATTTTGTTAATGGTGCAATTGA
AAGTGTTAAACAAACATTTAGTAATTTTATTCAATTTATTCAACCTTTCATTGATTCTGTTAAAAACATCTTTAAACAAG
CGATATCAGCAATAGTTGATTTTGCTAAAGATATTTGGAGTCAAATTAATGGATTCTTTAATGAAAACGGAATTTCTATT
GTTCAAGCGCTTCAAAATATATGCAATTTTATCAAAGCTATATTTGAATTTATTATAAATTTTGTAATTAAACCAATCAT
GTTCGCGATTTGGCAAGTGATGCAATTTATTTGGCCGGCGGTTAAAGCTTTAATTGTCAGTACTTGGGAGAATATAAAAG
GTGTGATACAAGGAGCTTTAAATATCATACTAGGTTTAATTAAGTTCTTCTCAAGTTTATTTACTGGAGATTGGCGAGGA
GTTTGGGATGCGATTGTTATGATTCTTAAAGGAGTCGTTCAATTAATATGGAATTTAATTCAATTATGGTTTGTAGGCAA
AATACTTGGCGTTGTTAGGTACTTTGGCGGATTGCTAAAAGGATTAATAGCAGGTATTTGGGACGTAATAAAAAGTATAT
TCAGTAAATCTTTATCAGCAATTTGGAATGCGACAAAAAGTATTTTTGGATTCTTATTTAATAGTGTCAAATCAATTTTC
ACGAATATGAAAAATTGGTTATCTAATACTTGGAGTAGTATCCGTACGAATACGATAGGAAAAGCGCAGTCATTATTTAG
TGGCGTCAAATCAAAATTTACTAATTTATGGAATGCGACGAAAGAAATTTTTAGTAATTTAAGAAATTGGATGTCAAATA
TTTGGAATTCCATTAAAGATAATACGGTAGGAATTGCTAGCCGTTTATGGAGTAAGGTACGTGGAATTTTTACAAATATG
CGTGACGGCTTACAAAGTATTATCAGCAAAATTAAAAGTCATATCGGCGGTATGGTAGATGCTATTAAAAAAGGACTTAA
TAAATTAATCGACGGTTTAAACTGGGTCGGTGGTAAGTTGGGCATGGATAAAATACCTAAGTTACATACTGGTACAGAGC
ACACACATACTACTACAAGATTAGTTAAGAACGGTAAGATTGCACGTGACACATTCGCTACAGTTGGAGATAAGGGACGC
GGAAATGGTCCAAATGGTTTTAGAAACGAAATGATTGAATTCCCTAATGGTAAACGTGTAATCACACCAAATACAGATAC
TACTGCTTATTTACCTAAAGGCTCAAAAGTATATAACGGTGCACAAACTTATTCAATGTTAAACGGAACTCTTCCAAGAT
TTAGTTTAGGTACTATGTGGAAAGATATTAAGTCCGGTGCATCATCAGCATTTAACTGGACAAAAGATCAAATAGGTAAA
GGTACCAAATGGCTTGGCGATAAAGTTGGCGATGTTTTAGATTTTATTGAAAATCCAGGAAAACTTTTAAATTATATACT
TGAAGCTTTTGGAATTGATTTCAATTCTTTAACTAAAGGAATGGGAATTGCAGGCGACATAACAAAAGCTGCATGGTCTA
AGATTAAGAAAAGTGCTACTGATTGGATAAAAGAAAATTTAGAAGCTATGGGCGGTGGCGATTTAGTCGGCGGAATATTA
GACCCTGACAAAATTAATTATCATTATGGACGTACCGCAGCTTATACCGCTGCAACTGGAAGACCATTTCATGAAGGTGT
CGATTTTCCATTTGTATATCAAGAAGTTAGAACGCCTATGGGTGGTAGACTTACAAGAATGCCGTTTATGTCTGGTGGTT
ATGGTAACTATGTAAAAATTACTAGTGGCGTTATCGATATGCTATTTGCGCATTTGAAAAACTTTAGCAAATCACCACCT
AGTGGCACGATGGTAAAGCCCGGCGATGTTGTTGGTTTAACTGGTAATACCGGATTTAGTACAGGACCACACTTACATTT
TGAAATGAGGAGAAACGGACGCCATTTTAACCCTGAACCATATTTAAGAAATGCAAAGAAAAAAGGTAGGTTATCAATTG
GTGGCGGTGATGCTACTTCTGGAAGTGGTGCAACTTATGCCAGCCGAGTAATCCGACAAGCGCAAAGTATTTTAGGAGGA
CGTTATAAAGGTAAGTGGATTCATGACCAGATGATGCGAGTTGCAAAGCGTGAAAGCAACTATCAATCAAATGCAGTGAA
TAATTGGGATATTAATGCTCAAAGAGGAGACCCGTCTAGAGGATTATTCCAAATTATCGGCTCAACTTTTAGAGCTAACG
CTAAACGAGGGTACACTAATTATAATAATCCAGTACATCAAGGTATCTCAGCAATGCAGTACATTGTTAGACGATATGGT
TGGGGTGGTTTTAAACGTGCTGGTGATTACGCATATGCTACAGGTGGAAAAGTTTTTGATGGTTGGTATAACTTAGGTGA
AGACGGTCATCCAGAATGGATTATTCCAACAGATCCAGCTCGTAGAAATGATGCAATGAAGATTTTGCATTATGCAGCAG
CAGAAGTAAGAGGGAAAAAAGCGAGTAAAAATAAGCGTCCTAGCCAATTATCAGACTTAAACGGGTTTGATGATCCTAGC
TTATTATTGAAAATGATTGAACAACAGCAACAACAAATAGCTTTATTACTGAAAATAGCACAATCTAACGATGTGATTGC
AGATAAAGATTATCAGCCGATTATTGACGAATACGCTTTTGATAAAAAGGTGAACGCGTCTATAGAAAAGCGAGAAAGGC
AAGAATCAACAAAAGTAAAGTTTAGAAAAGGAGGAATTGCTATTCAATGA

Protein sequence :
MGERIKGLSIGLDLDAANLNRSFAEIKRNFKTLNSDLKLTGNNFKYTEKSTHSYKQRIKELDGTITGYKKNVDDLAKQYG
KVSQEQGENSAEAQKLRQEYNKQANELNFLEKELEKTTTEFEEFKKAQVEAQRMAESGWGKTSKVFESMGPKLTKMGDGL
KSIGKGLMIGVTAPVLGIAAASGKAFAEVDKGLDTVTQATGATGGELKKLQNSFKDVYGNFPADAETVGGVLGEVNTRLG
FTGKELESATESFLKFSHITGSEGVQAVQLITRAMGDAGIEADEYQSVLDMVAKAAQASGISVDTLADSITKYGAPMRAM
GFEMKESIALFSQWEKSGVNTEIAFSGLKKAISNWGKAGKNPREEFKKTLAEIEKTPDIASATSLAIEAFGAKAGPDLAD
AIKGGRFSYQEFLKTIEDSQGTVNQTFKDSESGSERFKVAMNKLKLVGADVWTSIESAFAPVMEELIKKLSIAVDWFSNL
SDGSKRSIVIFGGIAAAIGPVVFGLGAFISTIGNAVTVLAPLLAGIAKADGLISFLSTKVPILGTVFTALTGPIGIVLGV
LAGLAVAFTIAYKKSETFRNFVNGAIESVKQTFSNFIQFIQPFIDSVKNIFKQAISAIVDFAKDIWSQINGFFNENGISI
VQALQNICNFIKAIFEFIINFVIKPIMFAIWQVMQFIWPAVKALIVSTWENIKGVIQGALNIILGLIKFFSSLFTGDWRG
VWDAIVMILKGVVQLIWNLIQLWFVGKILGVVRYFGGLLKGLIAGIWDVIKSIFSKSLSAIWNATKSIFGFLFNSVKSIF
TNMKNWLSNTWSSIRTNTIGKAQSLFSGVKSKFTNLWNATKEIFSNLRNWMSNIWNSIKDNTVGIASRLWSKVRGIFTNM
RDGLQSIISKIKSHIGGMVDAIKKGLNKLIDGLNWVGGKLGMDKIPKLHTGTEHTHTTTRLVKNGKIARDTFATVGDKGR
GNGPNGFRNEMIEFPNGKRVITPNTDTTAYLPKGSKVYNGAQTYSMLNGTLPRFSLGTMWKDIKSGASSAFNWTKDQIGK
GTKWLGDKVGDVLDFIENPGKLLNYILEAFGIDFNSLTKGMGIAGDITKAAWSKIKKSATDWIKENLEAMGGGDLVGGIL
DPDKINYHYGRTAAYTAATGRPFHEGVDFPFVYQEVRTPMGGRLTRMPFMSGGYGNYVKITSGVIDMLFAHLKNFSKSPP
SGTMVKPGDVVGLTGNTGFSTGPHLHFEMRRNGRHFNPEPYLRNAKKKGRLSIGGGDATSGSGATYASRVIRQAQSILGG
RYKGKWIHDQMMRVAKRESNYQSNAVNNWDINAQRGDPSRGLFQIIGSTFRANAKRGYTNYNNPVHQGISAMQYIVRRYG
WGGFKRAGDYAYATGGKVFDGWYNLGEDGHPEWIIPTDPARRNDAMKILHYAAAEVRGKKASKNKRPSQLSDLNGFDDPS
LLLKMIEQQQQQIALLLKIAQSNDVIADKDYQPIIDEYAFDKKVNASIEKRERQESTKVKFRKGGIAIQ

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
SAKOR_01932 YP_008492120.1 hypothetical protein Not tested ¥ÕSa3 Protein 0.0 100
SAV1955 NP_372479.1 phi PVL ORF 15 and 16-like protein Not tested ¥ÕSa3 Protein 0.0 99
SAUSA300_1930 YP_494581.1 phi77 ORF001-like protein, phage tail tape measure protein Not tested ¥ÕSa3 Protein 0.0 98
SAUSA300_1930 YP_494581.1 phi77 ORF001-like protein, phage tail tape measure protein Not tested ¥ÕSa3 Protein 0.0 98
SA1766 NP_375064.1 hypothetical protein Not tested ¥ÕSa3 Protein 0.0 96
MW1895 NP_646712.1 hypothetical protein Not tested ¥ÕSa3 Protein 0.0 52