Gene Information

Name : PP4_03580 (PP4_03580)
Accession : YP_008111395.1
Strain : Pseudomonas putida NBRC 14164
Genome accession: NC_021505
Putative virulence/resistance : Unknown
Product : putative amino acid transporter
Function : -
COG functional category : -
COG ID : -
EC number : -
Position : 417629 - 418978 bp
Length : 1350 bp
Strand : -
Note : -

DNA sequence :
ATGGCCAACCAACCTAGCTCTACCCCCGCCCAGCTTCGCCGTGTTCTCGGCCTCCCCGCCCTGGTGTTCTTCGGCCTGGT
CTACATGGTCCCGCTGACCATCTTCACCACCTACGGCATCGTCACCGAACTCACCGGTGGCCGCACCGCCGGCGCCTACC
TGGTCACCCTGGTGGCCATGCTGTTCACCGCTGCGTCCTACAGCTTCATGGTCAAACGCTTCCCGGTGGCGGGCTCGGCG
TATTCCTACACCAACATGGCCTTCGGCCCCAATATCGGCTTCCTTGCCGGCTGGTCGCTGCTGCTCGACTACCTGTTCCT
GCCGATGATCAACTACCTGCTGATCGGCCTGTTCCTCAACATCGCGTTCCCGGCAGTGCCCGCCTGGGCCTTCGTACTCG
CCTGCATCGCCCTGGTGACAGTGCTGAACGTGGTCGGCATCAACTCGGTGGCCAAGACCAGCAACCTGATCGTCGGCGCG
CAGATCGTATTTATCGGCGTGTTTGTCGCGCTGTCCTGCCAGACACTCGCCGGCCAGCCGCTCGATCTGCTGTCGCCGCT
GCTGGGTGACGGCAGCAAACCAGGCTTCGGTCACTTGATGGCTGGCGCAGCGGTGCTGTGCCTGTCGTTCCTCGGCTTCG
ACGCCGTATCGACCCTGGCCGAAGAATGCCGCGACGCACGCCGCGACGTGCCACGGGCGATCATCCTCACCACCCTGTTT
GCCGGCTTGCTGTTCACCCTGCTGGCCTACGTCAGCCAACTGGTGCTGCCGGGCAGCAGCTTCGCCAATGCCGATGCGGC
GGCCAACGAAGTGATGTTCAAGGCTGGCGGGCAGTTCCTTACCAACTTCTTCACCGCCGCTTATGTTGCAGGCAGCCTGG
GTTCGGCGCTGGCCTCGCAGGCGGCGGTGTCGCGCATCCTGTTCACCATGGGCCGCGACAACGTGCTGCCACGCCGTAGC
TTCGGCTACCTGTCGCCGCGCTTTGGTACGCCAGTGTTCGCTATCTTGCTGGTGTCAGCCTTCTCGCTGCTGGCGCTGGT
GATCGACCTGGCTACCCTCGCCTCGCTGATCAGCTTCGGCGCGCTGGTGGCGTTCTCGGCGGTGAACCTGGCGGTGGTGA
AGACGCACCTGATGGACGATGCAAGCCAGCGGGATGCCAAGGGGCTGCTGAGCTATGGCGTGGTGCCACTGGTGGGATTG
GGGCTGACACTGTGGCTGTGGACGAGCCTGTCGGCGCTGACGCTGGTGATCGGGTTGTGCTGGTTTGCGCTGGGGTTGGC
GTATCTGGCGGCGCTGACTGCCGGTTTCCGCCGCCCAGTGCGTATGGTGGACTTCTCCGAAGCCGGCTGA

Protein sequence :
MANQPSSTPAQLRRVLGLPALVFFGLVYMVPLTIFTTYGIVTELTGGRTAGAYLVTLVAMLFTAASYSFMVKRFPVAGSA
YSYTNMAFGPNIGFLAGWSLLLDYLFLPMINYLLIGLFLNIAFPAVPAWAFVLACIALVTVLNVVGINSVAKTSNLIVGA
QIVFIGVFVALSCQTLAGQPLDLLSPLLGDGSKPGFGHLMAGAAVLCLSFLGFDAVSTLAEECRDARRDVPRAIILTTLF
AGLLFTLLAYVSQLVLPGSSFANADAAANEVMFKAGGQFLTNFFTAAYVAGSLGSALASQAAVSRILFTMGRDNVLPRRS
FGYLSPRFGTPVFAILLVSAFSLLALVIDLATLASLISFGALVAFSAVNLAVVKTHLMDDASQRDAKGLLSYGVVPLVGL
GLTLWLWTSLSALTLVIGLCWFALGLAYLAALTAGFRRPVRMVDFSEAG

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
unnamed AAK01507.1 putative amino acid/amine transport protein Not tested PAGI-1 Protein 5e-49 41