Gene Information

Name : LRI_0856 (LRI_0856)
Accession : YP_008099210.1
Strain : Lactobacillus reuteri I5007
Genome accession: NC_021494
Putative virulence/resistance : Unknown
Product : glycosyltransferase
Function : -
COG functional category : -
COG ID : -
EC number : -
Position : 865036 - 866574 bp
Length : 1539 bp
Strand : +
Note : COG: COG0438

DNA sequence :
ATGACTGTATATAATATTAATTTAGGAATTGGCTGGGCCAGTAGTGGTGTCGAGTATGCTCAGTCATATCGTGCACAAGC
ATTTCGTAATCTTAACATTTCAGCAAAGTTTGTTTTTTCGGACTTGATTTTAGGAAATAATATTGCCGATCTAACTGCTA
ATCTAGGTTTTAATGCTGATCAGATTATTTGGCTTTACAACTTTTTTACTGATATTAAAATTGCTCCCTCAACCTTTTTA
CTCGATACTTTTGTTGAGCAGAATCATCTTGAGCAGCGAAATTTTAGCCTTCTGCCCAATAATGGCACGAAAGAGTTGCA
ATACAAATCTGAAGAAGAAAAATTAACGATCGTGCCACGCTATAACAATCGAGAGAAACAGACGATTGATCAGGTCACTT
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AAGGATAATCAGGTTATTTTTCGAGAATTTTATAATGAAAATGGGACGATTGCGTATACTCAACACTTAGATGGGGATGG
TCACGAATTATTTGAATTTCCTGATCAAAATTATTATTCAAAAACTGATCTTTATCGTGAAATGCTTCGGAAATTTAATT
TTAAAGCTGATGATATAATTATTCTTGATCGAATGGATGAAGATAAGCAGTTAGTTAATGGCCAATTGATTTTTGAACAT
CATTTACCAGCAAAACTGGTTATCCCTGTTCATGCTGACCACTACGACAAGCATTATACAAATGATCATCAAGTATTATG
GAATAATTTTTATGAATATCAATTCATGCATTATCAAGATGTAGCTGCTTATGTCGTTGCGACTGATCGACAACGTGATT
TGCTAGCTAGTCAGCAAAAGCATTTCAACCACGCTAAACCACAAATTAATACTATCCCGGTTGGTAGTTTGGAACACTTG
GTAAAGCCAAAAGGGACCCGTAAAAAACATTCTTTAATTACTGCTTCTCGATTAGCCAACGAAAAACATATTGATTGGGT
TATTGAAGCAACCGTTGCGGCACATAAAATAGTTTCGGACCTAACCTTGGATATTTACGGCGAGGGTGGTGAACGGAGTC
GGTTGCAAAACTTAATCACAAAAAATAATGCTGATTCTTATATTAAATTAATGGGGCAACATGATCTAAAGGATGTTTAT
CAAAAGTATGAGACATATATTGCGGGTTCAACTAGTGAAGGTTTTGGATTAAGCTTAATGGAAGCAGTGGGTTCAGGTTT
ATCGATGATTGGTTTTGATGTTCCCTATGGTAATCAGACTTTCATTGTAGATCAACAAAATGGTTATTTATTGCCATATA
CTGAAGATTGGAGTAATTCACGTAAAGAACAATTACTAGCTGATGCTATTGTTAAAAACTTTACTGAAGCCGACTTAACA
TCTTTCCATGAAAAATCATATTCATTAGCTGAGTCGTATTTGACTAAGAATGTTGCTAAACAATGGCAGCAATTGATAGG
AGAGTTACAGCATGCTTAA

Protein sequence :
MTVYNINLGIGWASSGVEYAQSYRAQAFRNLNISAKFVFSDLILGNNIADLTANLGFNADQIIWLYNFFTDIKIAPSTFL
LDTFVEQNHLEQRNFSLLPNNGTKELQYKSEEEKLTIVPRYNNREKQTIDQVTYIFNNRLIKRDFYSYTKYATEYYSGEE
KDNQVIFREFYNENGTIAYTQHLDGDGHELFEFPDQNYYSKTDLYREMLRKFNFKADDIIILDRMDEDKQLVNGQLIFEH
HLPAKLVIPVHADHYDKHYTNDHQVLWNNFYEYQFMHYQDVAAYVVATDRQRDLLASQQKHFNHAKPQINTIPVGSLEHL
VKPKGTRKKHSLITASRLANEKHIDWVIEATVAAHKIVSDLTLDIYGEGGERSRLQNLITKNNADSYIKLMGQHDLKDVY
QKYETYIAGSTSEGFGLSLMEAVGSGLSMIGFDVPYGNQTFIVDQQNGYLLPYTEDWSNSRKEQLLADAIVKNFTEADLT
SFHEKSYSLAESYLTKNVAKQWQQLIGELQHA

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
gtf1 YP_006310686.1 glycosyltransferase Not tested FWisland_3 Protein 5e-104 44
SH0041 YP_251956.1 hypothetical protein Not tested SCCmec Protein 2e-95 42