Name : LRI_0855 (LRI_0855) Accession : YP_008099209.1 Strain : Lactobacillus reuteri I5007 Genome accession: NC_021494 Putative virulence/resistance : Unknown Product : preprotein translocase SecA Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 862673 - 865021 bp Length : 2349 bp Strand : + Note : COG: COG0653 DNA sequence : ATGACGTACCCCAATTTTAGGTTACAAAAAGTAAAACATACCCTTGCTAAAGTAAATGCATTAACCGCTGAAATGCGAGG GATGAGCGATGAAGAGCTTAAACATCAAACTGTTCTATTAAAAAAAGAATTAGCTAATGGTAAAACAGTTGATGATATCT TACCACGGGCATTTGCGACCATTCGGGAAGCGGACTACCGGATTTTAGGAATGTTTCCATATGATGTGCAAGTTATGGGG GCGATTGTCTTAAATCAAGGTAATATTGCGGAAATGAAAACTGGGGAAGGTAAAACTTTAACAGCGACAATGCCTCTTTA CCTAAATGCGTTGACTGGTAAAGGAGCGATGCTATTAACACCTAATGGTTATCTTGCCCAACGTGATAAAGAGCAATTGC AGCCAGTCTATGAGTGGTTAGGGTTAACAGTAAGTCTTGGCTTTACAAATAGTGATCAGAAACCATTACCACAAGTAAAA AGAGAATGGTATAACTCTGACATTGTTTATACGACAGCTAGTAGTCTGGCATTTGATTACTTATTTAATAATTTAGCAAC ACGTATTGATGACCAATATTTACGACCATTTAACTATGTAATCATCGATGAAGTTGACGCAATTTTACTTGATGAGGCAA CTTCACCTTTTGTGGTATCAAGTACTCCCATGGTTCAATCAAATTTATATCGGTTGACAGATGATTTTATTCACACTCTC CAACCCGAAATTGATTATAAACTGAATGAAGATCGAACCGCAGTCTGGCTTACATTACATGGAATTAGACAAGCACAGCG CTTTTTTCGTATTACTGATCTATTTACAAATAGGTATCGGGAAGTATATCGTCATATTATCCTTGCCCTACGTGCTCATT TTATTATGGAAAATGGTCATGATTATTTAGTTAGCGAAGGGAAAGTTGTTTTACTTGATGAGGCAAATGGTCGGTTAAAA AGAGGGGTAAAGGTCAGTACAGGGTTGCATCAAGCAATTGAGGCAAAAGAACAGGTTGATCTTACTCCTAACCAACAAGT AGCGGCTTCAATTACCTTTCCTAGTTTGTTTGGTTTATTTAACAAAATTGCTGGAATGAGCGGAACTGTCAAAAGTGATG AGCAAGAATTCTTTGAAGTGTATAAGATGCGAGTTATTCAGATTCCAACTCGGAAAAAGGTAATCCGTCGAGATTATCCA GAGCAAATTTATTTAACAACTCGTCAAAAGTTAATACATGCCCTTGATGAGACAATTGAGCTTCATAAAGCAGGGCGTCC GGTTTTATTAGTGGCTGGTTCGGTAGAAAATTCAGAAATAATTTCTGAATTATTGTTGGATCAAGGAATTCCTCATAATG TCTTGAATGCTTTTAATGTTGCAAGAGAAGCTGATATTGTAAAAGATGCCGGACAAAGAGGAGCGGTGACTGTTGCTACC AATATGGCTGGCCGAGGAACTGACATCAAACTCGGAGCCGGAGTCAAAGAATTAGGCGGCCTTGCAGTTATTGGTACTGA GATGTTACCAACGCGAGTGAAATTACAACTTGCTGGACGAGCAGGACGTCAGGGTGATCCGGGCTCAAGTAAATTTTATA TTTCTCTAGAAGATAGCTACCTTGCTAAGAACAGTACCAAACGGTTCAAAAATTATTATCGTCAATTACAAAAGAAAAAG ACTGATAAACAGTTACGTAGTCCGCGTTTAAAAATGAGTATAGCAATGCTTAATGACCGGGTAGCTGCTAATCAGCAAAT GGCACGCAGCAATGTCAATAAGAATGAAATTGCATTAAAAATTCAGCGTAAGTATCTTTATGATCGGCGTGACCAGTTAA TGAGAACAGCACATTTAGAAACAGAAGTTGGAAAATGGTTAAGCAGAGGGATTTCTCTTTACCTTGATAAAAAAGTAAAA TGGAATGCCCTAGAATTACGACATTTAATGAATCAACATTTTACTTATGATGTTGTGGATTTGCCGGATAATCTAGAATT AGACCACAAAAAAATACAAAAATATTTAGAGCAATTTTGTCAAAAAGAGCTAGAACAGAAAGCTAAAGTATTAATTAATA GCGAACAATTAAATCAGTTTTATCGTTCAGCTTTATTAAATGCGCTTGATAGTAGCTGGACTGACCAGATGGCTTATTTA TCGAAACTATCAGTTATCGTTCAGCCATGGACAACAGCACAACGGAATCCTAAGTTTATGTACCAAGAAAAAGCTTATCA AGCATTTGAAAAAATGTTTGATACTGTCGCCAAAAAAGTAGTTGATAACTTAATGCTAAGTACTATTAGATTAAATAAAG ATAATAATTTAATTGTTCATTTTAATTAA Protein sequence : MTYPNFRLQKVKHTLAKVNALTAEMRGMSDEELKHQTVLLKKELANGKTVDDILPRAFATIREADYRILGMFPYDVQVMG AIVLNQGNIAEMKTGEGKTLTATMPLYLNALTGKGAMLLTPNGYLAQRDKEQLQPVYEWLGLTVSLGFTNSDQKPLPQVK REWYNSDIVYTTASSLAFDYLFNNLATRIDDQYLRPFNYVIIDEVDAILLDEATSPFVVSSTPMVQSNLYRLTDDFIHTL QPEIDYKLNEDRTAVWLTLHGIRQAQRFFRITDLFTNRYREVYRHIILALRAHFIMENGHDYLVSEGKVVLLDEANGRLK RGVKVSTGLHQAIEAKEQVDLTPNQQVAASITFPSLFGLFNKIAGMSGTVKSDEQEFFEVYKMRVIQIPTRKKVIRRDYP EQIYLTTRQKLIHALDETIELHKAGRPVLLVAGSVENSEIISELLLDQGIPHNVLNAFNVAREADIVKDAGQRGAVTVAT NMAGRGTDIKLGAGVKELGGLAVIGTEMLPTRVKLQLAGRAGRQGDPGSSKFYISLEDSYLAKNSTKRFKNYYRQLQKKK TDKQLRSPRLKMSIAMLNDRVAANQQMARSNVNKNEIALKIQRKYLYDRRDQLMRTAHLETEVGKWLSRGISLYLDKKVK WNALELRHLMNQHFTYDVVDLPDNLELDHKKIQKYLEQFCQKELEQKAKVLINSEQLNQFYRSALLNALDSSWTDQMAYL SKLSVIVQPWTTAQRNPKFMYQEKAYQAFEKMFDTVAKKVVDNLMLSTIRLNKDNNLIVHFN |
Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
secA2 | YP_006310687.1 | preprotein translocase subunit SecA2 | Not tested | FWisland_3 | Protein | 1e-165 | 45 |