Name : LRI_1272 (LRI_1272) Accession : YP_008099626.1 Strain : Lactobacillus reuteri I5007 Genome accession: NC_021494 Putative virulence/resistance : Unknown Product : pyruvate dehydrogenase complex E3 component Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 1293894 - 1295321 bp Length : 1428 bp Strand : - Note : COG: COG1249 DNA sequence : ATGGCTGATGTTGAACAAAAGGATACAGTAATTGTTGGTGGAGGTCCTGGTGGTTATGTAGCCGCTATTCGAGCTTCAGA ATTAGGTCAAAAGGTTACCTTAATTGATAAGGGAGAACCAGGTTTAGGTGGTGTTTGTTTAAACGTTGGATGTGTACCAT CTAAAGCATTAATTGCTGCTGGCCACCGTTACCAAGAAACTTTAGATTCATCTATTTACGGTATTTCTAAAACCGATGCA AAATTAGACTTTACTAAGACTCAAGAATGGAAGGACCATAAAGTTGTCGACCGTATGATTCGTGGAGTTAAGATGCTTTT GAAGAAGCATAAGGTTGAAATCATTGATGGAGAGGCAATTCTTGATAATGACCACCAACTTCGTGTAATTAAGCCTGGTC CAAAGCAATTCATGGATAATGATAATGGTCGGACTATCACATGGAAGAATTTGATTCTTGCAACAGGAAGTCGTCCAGTA GAAATTCCTCATTTTAAGTTTGAAGGCCGCGTTATTGATTCAACCGGGGGCTTAAACCTCAAGGAAGTACCAGAAGAATT AGTTGTAATTGGTGGTGGCTACATTGGTACAGAATTAGCTGGTGCCTATGCTGATCTTGGTGCTCATGTAACGATTATTG AAGGTACTGATTCAATTCTTGGTGGATTTGACCACGATATGGTTGATATTGTTGTCAAGAATCTTGAAAAGAAGGGCGTA GACATTGTAACTAAGGCAATGGCTAAAGATTCTCAGCAAGATGAAAATAGTGTTACTGTCACTTATGAAGTCGATGGCAG TAAAAAGAGCATTAAAGCAGACTACTGCATGGTATCTGTTGGTCGTAAACCAAATACTGATGATTTTGGCCTTGATATGA CAAATGTTAAGTTAAACGACCGCCATCAGGTAATTGTTGATGAACAAGGCCGGACGAATGTACCTGGTATTTGGGCTATT GGAGATATTGTTCCTGGTCCTGCACTTGCTCACAAGGCATTCTTTGAAGCTAAGACTGCCGCTGGTGCAATCGCCGGTAA GAATACTGCTAACGATTGGGTTGGAGTACCAATGGTTTGTTTTGCTGATCCAGAATTAGCTCAAGTTGGTATGACGGTTG AAGAAGCTAAAGATAAAGGAATTGATGTATCTACTGCTCAGTTCCCATTTGCCGGTAATGCCCGTGCCGTTTCTCTTGAT GCTGCCGAAGGATTTATTCGCTTAATCTATACTAAAGATAAGAAGAATGTTATTGGTGCTCAAGGTGTCGGTCCTGGTGT TAGTGACCTTGCTGGTGAACTTTCATTGATTGTCAACTGTGGTATGAATGTTGAAGATGTTGCTTTAACAATTCACCCAC ACCCAACATTGAATGAACCTGTTCAAGAAGCTGCAGATATTGCGCTTGGCTTCCCAACACACATCTAA Protein sequence : MADVEQKDTVIVGGGPGGYVAAIRASELGQKVTLIDKGEPGLGGVCLNVGCVPSKALIAAGHRYQETLDSSIYGISKTDA KLDFTKTQEWKDHKVVDRMIRGVKMLLKKHKVEIIDGEAILDNDHQLRVIKPGPKQFMDNDNGRTITWKNLILATGSRPV EIPHFKFEGRVIDSTGGLNLKEVPEELVVIGGGYIGTELAGAYADLGAHVTIIEGTDSILGGFDHDMVDIVVKNLEKKGV DIVTKAMAKDSQQDENSVTVTYEVDGSKKSIKADYCMVSVGRKPNTDDFGLDMTNVKLNDRHQVIVDEQGRTNVPGIWAI GDIVPGPALAHKAFFEAKTAAGAIAGKNTANDWVGVPMVCFADPELAQVGMTVEEAKDKGIDVSTAQFPFAGNARAVSLD AAEGFIRLIYTKDKKNVIGAQGVGPGVSDLAGELSLIVNCGMNVEDVALTIHPHPTLNEPVQEAADIALGFPTHI |
Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
SE0077 | NP_763632.1 | dihydrolipoamide dehydrogenase component of pyruvate dehydrogenase E3 | Not tested | SCCpbp4 | Protein | 6e-85 | 45 |