Gene Information

Name : LRI_1272 (LRI_1272)
Accession : YP_008099626.1
Strain : Lactobacillus reuteri I5007
Genome accession: NC_021494
Putative virulence/resistance : Unknown
Product : pyruvate dehydrogenase complex E3 component
Function : -
COG functional category : -
COG ID : -
EC number : -
Position : 1293894 - 1295321 bp
Length : 1428 bp
Strand : -
Note : COG: COG1249

DNA sequence :
ATGGCTGATGTTGAACAAAAGGATACAGTAATTGTTGGTGGAGGTCCTGGTGGTTATGTAGCCGCTATTCGAGCTTCAGA
ATTAGGTCAAAAGGTTACCTTAATTGATAAGGGAGAACCAGGTTTAGGTGGTGTTTGTTTAAACGTTGGATGTGTACCAT
CTAAAGCATTAATTGCTGCTGGCCACCGTTACCAAGAAACTTTAGATTCATCTATTTACGGTATTTCTAAAACCGATGCA
AAATTAGACTTTACTAAGACTCAAGAATGGAAGGACCATAAAGTTGTCGACCGTATGATTCGTGGAGTTAAGATGCTTTT
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CAAAGCAATTCATGGATAATGATAATGGTCGGACTATCACATGGAAGAATTTGATTCTTGCAACAGGAAGTCGTCCAGTA
GAAATTCCTCATTTTAAGTTTGAAGGCCGCGTTATTGATTCAACCGGGGGCTTAAACCTCAAGGAAGTACCAGAAGAATT
AGTTGTAATTGGTGGTGGCTACATTGGTACAGAATTAGCTGGTGCCTATGCTGATCTTGGTGCTCATGTAACGATTATTG
AAGGTACTGATTCAATTCTTGGTGGATTTGACCACGATATGGTTGATATTGTTGTCAAGAATCTTGAAAAGAAGGGCGTA
GACATTGTAACTAAGGCAATGGCTAAAGATTCTCAGCAAGATGAAAATAGTGTTACTGTCACTTATGAAGTCGATGGCAG
TAAAAAGAGCATTAAAGCAGACTACTGCATGGTATCTGTTGGTCGTAAACCAAATACTGATGATTTTGGCCTTGATATGA
CAAATGTTAAGTTAAACGACCGCCATCAGGTAATTGTTGATGAACAAGGCCGGACGAATGTACCTGGTATTTGGGCTATT
GGAGATATTGTTCCTGGTCCTGCACTTGCTCACAAGGCATTCTTTGAAGCTAAGACTGCCGCTGGTGCAATCGCCGGTAA
GAATACTGCTAACGATTGGGTTGGAGTACCAATGGTTTGTTTTGCTGATCCAGAATTAGCTCAAGTTGGTATGACGGTTG
AAGAAGCTAAAGATAAAGGAATTGATGTATCTACTGCTCAGTTCCCATTTGCCGGTAATGCCCGTGCCGTTTCTCTTGAT
GCTGCCGAAGGATTTATTCGCTTAATCTATACTAAAGATAAGAAGAATGTTATTGGTGCTCAAGGTGTCGGTCCTGGTGT
TAGTGACCTTGCTGGTGAACTTTCATTGATTGTCAACTGTGGTATGAATGTTGAAGATGTTGCTTTAACAATTCACCCAC
ACCCAACATTGAATGAACCTGTTCAAGAAGCTGCAGATATTGCGCTTGGCTTCCCAACACACATCTAA

Protein sequence :
MADVEQKDTVIVGGGPGGYVAAIRASELGQKVTLIDKGEPGLGGVCLNVGCVPSKALIAAGHRYQETLDSSIYGISKTDA
KLDFTKTQEWKDHKVVDRMIRGVKMLLKKHKVEIIDGEAILDNDHQLRVIKPGPKQFMDNDNGRTITWKNLILATGSRPV
EIPHFKFEGRVIDSTGGLNLKEVPEELVVIGGGYIGTELAGAYADLGAHVTIIEGTDSILGGFDHDMVDIVVKNLEKKGV
DIVTKAMAKDSQQDENSVTVTYEVDGSKKSIKADYCMVSVGRKPNTDDFGLDMTNVKLNDRHQVIVDEQGRTNVPGIWAI
GDIVPGPALAHKAFFEAKTAAGAIAGKNTANDWVGVPMVCFADPELAQVGMTVEEAKDKGIDVSTAQFPFAGNARAVSLD
AAEGFIRLIYTKDKKNVIGAQGVGPGVSDLAGELSLIVNCGMNVEDVALTIHPHPTLNEPVQEAADIALGFPTHI

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
SE0077 NP_763632.1 dihydrolipoamide dehydrogenase component of pyruvate dehydrogenase E3 Not tested SCCpbp4 Protein 6e-85 45