Name : MSA_8740 (MSA_8740) Accession : YP_008086615.1 Strain : Streptococcus agalactiae ILRI005 Genome accession: NC_021486 Putative virulence/resistance : Unknown Product : Transcription accessory protein (S1 RNA-binding domain) Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 753043 - 755337 bp Length : 2295 bp Strand : + Note : - DNA sequence : TTGTTCGAAAATATTTTGAAAAGAATTAAAGCAGACCTGGTCTGTTTTTTATTGTTAGATTATAAAAACGCTATCTTGAA ATCGCTTTTTAAAACTCTTCGTAAGTCAAAAATATGCTATAATAAAAGCGTTATGGAAAATTTAAATATTACACAAATTG CTATTGATTTAGGTATTAAAGCGTCACAAATCGAAAAGGTTTTAGAATTAACAGATGAAGGAAATACTATTCCTTTTATT GCCCGTTATCGTAAAGAAATGACAGGTAATTTGGATGAAGTTCAAATCAAATCAATTATTGACCTTGATAAGAGTATGAC AGCTCTTTCAGATCGTAAAACTACGGTCTTAGCCAAAATTGAAGAACAAGGAAAGTTGACTCAAGAACTCAAAAAGGCTA TTGAAGAAGCAACTAAACTAGCAGATGTTGAGGAACTCTACCTACCTTATAAAGAAAAACGTCGTACGAAAGCTACGATT GCACGTGAAGCAGGTCTTTTTCCTTTAGCACGTCTTATTTTACAAAATAAGGATAACCTTGAGGAAGAAGCTCAAAACTA TCTTACAGATGGTTTTGAGACAACTACGAAGGCACTTTCTGGAGCAGTAGATATTCTTATCGAAGCTTTTTCTGAGGATA ATAAATTACGTTCATGGACATATAATGAGATCTGGAACTACAGCTCAATCACTGCAGTTGTTAAAGATGAGTCACTTGAT GAAAAACAGGTCTTCAAAATCTACTATGACTTTTCTGAAAAAATAAGTAAACTCCATGGCTATCAAGTTTTAGCATTGAA TCGTGGTGAGAAAATGGGTGTTCTTAAGGTTAATTTTGAGCATAACCTTGAAAAAATGTTTCGCTTTTTTGCTGTTCGAT TTAAAGAAACTAGCCAATATATAGATGACCTTATTGTACAGACTGTCAAGAAAAAAATCGTTCCAGCTATGGAACGCCGT ATCCGTACAGAACTAAGTGAAGGAGCAGAAGATGGTGCAATTTCACTGTTTTCAGAGAATCTTCGTAACTTATTGTTAGT CTCACCGCTTAAGGGGAAAATGGTGTTAGGTTTTGACCCTGCCTTTCGTACAGGAGCAAAATTAGCAGTAGTAGACCAAA CTGGAAAATTAATGACAACACAAGTGATTTATCCAGTTCCTCCAGCTAATCAAGCAAAAATCGAACAATCAAAAATAGAG TTAGCAAAACTTATCAAAGAATTCAATATAGAAATTATTGCTATAGGGAATGGAACAGCGAGTCGTGAATCAGAAGCATT TGTTGCAGAAGTTTTACAAGATTTTCCAGACGTATCCTATGTGATTGTTAACGAAAGTGGTGCCTCTGTTTATTCAGCCT CAGAATTGGCACGTCATGAATTTCCAGACTTAACGGTTGAAAAACGTTCGGCCATCTCAATTGCAAGACGTCTGCAAGAC CCATTAGCAGAACTAGTCAAAATTGATCCAAAATCTATTGGTGTGGGTCAATATCAACATGATGTTAGCCAAAAAAAATT AGCAGAAAATCTTGATTTTGTTGTTGAAACTGTAGTTAACCAAGTAGGTGTTAATGTTAATACAGCAAGTCCAGCCTTGT TAGCTCATGTTTCAGGTTTAAATAAAACAATATCTGAAAATATTGTTAAATATCGTGAAGAGAATGGGCAAATTAAGTCA CGTGCTGAAATTAAGAAAGTACCCAGATTAGGAGCAAAAGCTTTTGAGCAAGCTGCTGGATTCTTACGTATTCCTAATGC TAAAAATTTCTTGGATAATACAGGTGTTCACCCTGAGTCTTATGAAGCTGTTAAAAAGTTGCTTGACCAACTGACTATCA AAGAATTAGATGATCTTGCTAAAGAGAAGTTACAAAACCTTGACTTAATTGCAACAGCAGAAAGTATTGGGGTAGGTCAA GAAACATTAAAAGACATTATAGAAGATCTTTTGAAACCAGGTCGTGATTTGCGTGATGATTTTGAAGCGCCTGTTTTGAG ACATGATGTTTTAGATGTCAGTGATTTAAAAGTTGGACAGGAATTGCAAGGAACTGTTCGAAACGTCGTTGATTTTGGTG CTTTTGTTGATATTGGTGTTCATGAAGATGGTCTAATCCACCAGTCTCGCCTTATTAAGCGAAAACGCGATAAAAAAACT AGAAAAATGCCTCCTTTACCACATCCAAGCAAATATCTCTCTGTTGGTGATATTGTAACTGTTTGGGTTGTAGAGGTAGA TGCGGAGCGTAGCAGAATTGGACTTAGTCTTATCAAGCCAGACGGACTTGACTAA Protein sequence : MFENILKRIKADLVCFLLLDYKNAILKSLFKTLRKSKICYNKSVMENLNITQIAIDLGIKASQIEKVLELTDEGNTIPFI ARYRKEMTGNLDEVQIKSIIDLDKSMTALSDRKTTVLAKIEEQGKLTQELKKAIEEATKLADVEELYLPYKEKRRTKATI AREAGLFPLARLILQNKDNLEEEAQNYLTDGFETTTKALSGAVDILIEAFSEDNKLRSWTYNEIWNYSSITAVVKDESLD EKQVFKIYYDFSEKISKLHGYQVLALNRGEKMGVLKVNFEHNLEKMFRFFAVRFKETSQYIDDLIVQTVKKKIVPAMERR IRTELSEGAEDGAISLFSENLRNLLLVSPLKGKMVLGFDPAFRTGAKLAVVDQTGKLMTTQVIYPVPPANQAKIEQSKIE LAKLIKEFNIEIIAIGNGTASRESEAFVAEVLQDFPDVSYVIVNESGASVYSASELARHEFPDLTVEKRSAISIARRLQD PLAELVKIDPKSIGVGQYQHDVSQKKLAENLDFVVETVVNQVGVNVNTASPALLAHVSGLNKTISENIVKYREENGQIKS RAEIKKVPRLGAKAFEQAAGFLRIPNAKNFLDNTGVHPESYEAVKKLLDQLTIKELDDLAKEKLQNLDLIATAESIGVGQ ETLKDIIEDLLKPGRDLRDDFEAPVLRHDVLDVSDLKVGQELQGTVRNVVDFGAFVDIGVHEDGLIHQSRLIKRKRDKKT RKMPPLPHPSKYLSVGDIVTVWVVEVDAERSRIGLSLIKPDGLD |
Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
NMB0075 | NP_273139.1 | transcriptional accessory protein Tex | Not tested | IHT-A | Protein | 5e-132 | 46 |