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Name : hsdM1 (Abm4_0075) Accession : YP_008074442.1 Strain : Methanobrevibacter sp. AbM4 Genome accession: NC_021355 Putative virulence/resistance : Unknown Product : type I restriction-modification system M subunit HsdM1 Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 85634 - 87643 bp Length : 2010 bp Strand : + Note : - DNA sequence : ATGAGTACTTTTCAAGAAAAATCCAGTTTTATTTGGAATTTAGCTGATTTATTAAGGGGGTCTTATAAAAGAAATGAGTA TCAAAGAGTAATTTTACCTTTCACTGTGTTAAAACGTTTTGATTCTGTATTAGAATATTCAAAAAAAGATGTTGTTGATA TGTATGAAAAATATAAAAATATAACATCTAATATTGATCCAATTCTTAAAAATGTAGCTGTTGATGAAGAAGACAATAAA TTAGGTTTTTATAATTTTTCTATTTATAATTTTGATTCTTTACTAAAAGATCCAGATAACATAGAAGATAACATTATTTT TTATTTGGATTGTTTTAGTGATAATGTTAAGGATATCTTCGAAAATTTTGATATTAAAACAGAAATTAATAACTTATCTA AAGCTAATTTATTGTATTTGATTGTTAAAAAATTTAGCGAAACAAACATTGATTTAAGTCCAAAAACAGTATCAAATCAT GAAATGGGTACTATTTTTGAAGAATTAATTAGAAAATTTTCAGAACAATCTAACGAAGAAGCAGGTGAGCATTTTACTCC GAGAGATGTGGTTAAATTAATGACAGAATTAATGTTTATTGAAGATGATATTAATGAAAAAGAATCAATTAAATTAATTT ATGACCCTGCATGCGGTACTGGTGGGATGCTTACTAGCTGTAAAGAATTTATTAATAATTTAAATGAAGATGTTGATGTA GTACTTTACGGACAAGAGATTAATCCCGAAATATATGCTATTTGTAAAGCGGATATGCTTATGAAAGGTGAAAATGCTAA CAACATAAAAGGTCCATCAAGTACACTTTCAGATGATCAGTTATCTTCAATGAAATTTGATTATATGATATCTAATCCAC CTTATGGTAGAAATTGGGAATTAGATGAAGATGTTGTTAAAAAAGAATCAAAATGTGGTTTTGAAGGAAGATTTGGTGCA GGAATCCCTCGTAAAAGTGATGGACAATTACTTTTTATTGAACACATGATTTCAAAGATGAAAGATAATGAAAAATCAAG AATTGCCGTGATTACAAATAGTTCACCATTATTCATTGGAGATGCGGGTTCTGGAGAAAGTGAAATAAGGAAATGGATAA TAGAAAATGATTATTTAGAAGCAATCATAGGATTACCTAATCAATTGTTCTTTAATACTGGAATTAAAACATATATTTGG ATATTAACCAACCAAAAGGAAAGTAAAAGAAAAAGAAAAATACAATTAATTGATGCAACAGAAGAATATGAACCAATGAA AAAGAATTTAGGTAATAAAAGACACCAAATATCTGAAAATAACATACATAATATACTTAAATATTATAAATTATATGAAG AAGGAGATAAAGTTAAAATATTGGATAATAATGATTTTGGGTACACAAAAGTAACAATAGAAAGGCCAAAACAACTTAAT TATTGTGTAAACAAGAGAAGAATAAATAATCTTTATTCATATTCTCAATTTAAAAAATTATCTGAAAGTAATTCAAAAGA TATTAAAATTAAACAAAAGGAAGAACAAAAAGGTAAAGAAAAACAAGAAAAAGTAAAACAAGCATTATTTAAAATTCCAA GTAAACTATATAAAAATTGGGATGAATTTGAAATAGAAGTTAAAAAAGTACTTGAGCCATTTAATTTTAAGCCCTCTTTT ATAAAAAATGTGATTGAAAAATTATCAGAACATGATGATACTGCAGATTATGTAATAGATAAAAAAGGCAATAAAAAAGC TGATTCAAATTTAAGGGATTATGAAAAAATACCTTTAAAAGAGGATGTTGATGAATATCTTAAAGAAGAGGTTTTTAATT ATTATCCGGATGCTTGGATTGATAATAAAAAAAATAAAATAGGTTATGAAATTAATTTTACAAAATATTTCTATGTTTAT GAAAAACCTAGATCTCTTGATGAAATAAATAAGGATATAAAAGATGTAACTAGTGAAATTAGTAGGTTATTGGATTTAAA CCATTTATAA Protein sequence : MSTFQEKSSFIWNLADLLRGSYKRNEYQRVILPFTVLKRFDSVLEYSKKDVVDMYEKYKNITSNIDPILKNVAVDEEDNK LGFYNFSIYNFDSLLKDPDNIEDNIIFYLDCFSDNVKDIFENFDIKTEINNLSKANLLYLIVKKFSETNIDLSPKTVSNH EMGTIFEELIRKFSEQSNEEAGEHFTPRDVVKLMTELMFIEDDINEKESIKLIYDPACGTGGMLTSCKEFINNLNEDVDV VLYGQEINPEIYAICKADMLMKGENANNIKGPSSTLSDDQLSSMKFDYMISNPPYGRNWELDEDVVKKESKCGFEGRFGA GIPRKSDGQLLFIEHMISKMKDNEKSRIAVITNSSPLFIGDAGSGESEIRKWIIENDYLEAIIGLPNQLFFNTGIKTYIW ILTNQKESKRKRKIQLIDATEEYEPMKKNLGNKRHQISENNIHNILKYYKLYEEGDKVKILDNNDFGYTKVTIERPKQLN YCVNKRRINNLYSYSQFKKLSESNSKDIKIKQKEEQKGKEKQEKVKQALFKIPSKLYKNWDEFEIEVKKVLEPFNFKPSF IKNVIEKLSEHDDTADYVIDKKGNKKADSNLRDYEKIPLKEDVDEYLKEEVFNYYPDAWIDNKKNKIGYEINFTKYFYVY EKPRSLDEINKDIKDVTSEISRLLDLNHL |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| SAS0027 | YP_042160.1 | type I restriction enzyme methylase | Not tested | SCC476 | Protein | 1e-95 | 45 |
