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Name : hsdR2 (Abm4_0518) Accession : YP_008074863.1 Strain : Methanobrevibacter sp. AbM4 Genome accession: NC_021355 Putative virulence/resistance : Unknown Product : type I restriction-modification system R subunit HsdR2 Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 619185 - 621923 bp Length : 2739 bp Strand : + Note : - DNA sequence : ATGCCAATTCAAAGTGAAGAAACATTAGAGAAAAATTTAATTGCACAATTGCAAGAAAATGGATATGAATATGTTAATGT TAAAAATGAAGATGAATTAAAAGAAAATTTCAGATTGCAACTTGAAAAATTAAATAATTGTAGTTTTTCTGATGTGGAAT TTGACCGTATTTTGGTATACTTAGATAGTGGCAGTATATTTGATAAGGCTAAAAAATTAAGAGATAAATATTATGTTGAT AGGGATAAAGACTCTTTTTATATTAAATTTTTAAATACAAAAGAATGGTGTAAAAACATTTTTCAAGTAGCTAATCAAAT CACTGTTCATGGTCTTCATGAAAATAGATATGATGTAACTATTCTTATTAATGGATTACCTCTTGTTCAAATAGAACTTA AAAGAAGAGGGGGAAATATTAAAGAGGCTTTTGATCAAATTATTAGATATAAATCTCATTCATATAGTGGTCTTTTTAAT TATATTCAATTATTTGTTATAAGTAATGGTGTTAATACTAAATATTTTGCAAATGGTTCTAAAAATGATCTTAATTTTGA ATTTACCTTCTTCTGGAAAGATGTGAAAAATAACAATTATCATTCATTAGACCAATTTACAGATACCTTTTTAGAAAAAT GTAATATTGCAGAAATTATTTCAAAATATATGATTTTAAATGAATCATCTAAAACCTTAATGGTTTTAAGAGCCTATCAG ATATATGCTGTAAAAGCAGTATTACATCAGGCATTAGAAGTTAAACAAAATGGTTATATTTGGCATACAACAGGTAGTGG AAAAACTATTACCTCTTATAAGGTAAGCCAACTTTTAGCAGAAGATGAATCTATATACAAGGTTCTTTTCATTGTTGATA GACGTGATTTGGATATTCAAACAAATAAAGAGTTTAACAGTTTTTGTAATGGTTGTGTTAATGAAACAAAGCATACAGGT GCTTTAATTAAACATTTAACCACAACCGGTAATGGTAAACTTGTTACAACAACTATACAAAAATTATCAAAAGCAGTTAA AACAAGGGGGGATATGAAGAAACTCCAAGACATTCGTGATAAAAATATTATTCTAATTTATGATGAGTGTCATAGAAGCC AATTTGGTGAAATGCATCAATCCATTATTAATTTCTTTAATAATGCATTATCTTTTGGTTTTACTGGAACTCCCATATTT GAAGAAAATTCCAATGGCCTAAAAACTACTAAAAGCATTTTTGGAAAAAGACTTCATGAATACTCAATTAAAGATGCTAT TGCAGATAATAATGTTTTAGGTTTTTCAATTGATTATTTTGGTGGAGCTAAAATGCTTACTGAAACTGATTTGGAAGTTG AAGGAATTGATAAGAGAGAATACTTTGAATCTGATAAGCGTCTTAATCAAATCGTAGATTATATAATTAAAAGTTATGAT AATAAAACTAAAAATCGTGAATTTAATGCAATGTTTACAGTTGCACGTGGTGGAGTAATTCACAAATATTATGATTTATT TAAAAAGAAAAAAGATGAAGGAAAACACAATTTAAAGGTTGCTACTATCTTTACATATGTTGCTAATGAAGATTTGTCTG ATAACAAACAGTTATCACGAGATAAACTTGATAAATATATGGATGACTATAATGAGATGTTTGGTACTAATTTCAGTACT GATGATTTTAAAGCTTACTATGTAGATGTTTCTAAAAGAATGAAAAATAGGGAAATTGATTTACTTTTAGTTGTTGACAT GTTTTTAACTGGATTTGATAGTAAACTTTTAAATACATTATATGTAGATAAAAATCTTCAATATCATGGTTTATTACAAG CATTTTCTAGAACAAATAGAATATATAATATGCGTAAATCTCATGGAAATATCATTTGTTTTAGAAATCTTAAGGAAAAT ACTGATAGGGCAATTAGATTATTCTCTGATTCTAATGCATCTGAGGATATTATTTTACCACCATATGGCTTCTTTGTAGA TAAATTTAATAAGGAAGCTGAAAAATTTTATTCCCTTGTTGAAACAGTAAACGATGCAGTTAATTTACAAAGTGAGAAGG ATAAGAAACAATTTGTATTAAATTTCAGAGAACTTTCAAGAATATTAAATAAGATGAATACTTTCTCAGAATTTTCATAT GATGATATTGAAATGACTGAACAGGATTTCTCAGATTATAAAAGTATTTACTTTGATATTCATGATGAACTTAAAAGTCC AGATAAAGAAAAAGTATCTGTTCTTGATGATATTGACTTTGAACTTGAATTGCTTAGAAATGATAAGATCAATGTAGATT ATATTCTTAATATTCTTAAAACAATGGATCCTAAAGATTCAAGTTTTGAGCATGATAAAAAACGTATATTAAATATTATG CAAGAAACTGAACATTTAAGAAGTAAAATCAGTTTAATTGAGAAATTCATTGATGAGGAATTAGGAAATATCAATGATAA AGATTTATCTTTTAATGAAGTATTTGATGGATTCATGTCAAAAGAAAGAGAGAATGCAATTCTGGATATTATTTCTGAAG AGGATTTAAATGAAAAGATTGCTCGTCAAATTTTCGATTATTATGAATATTCCGGTAAACTTGATGAAGATAAACTTAAA AAATCATTTAATCATAATCTCAAATTTAAAGAAAGAAGAAATAAAGTTAAAGAAGTTAAAAATATGATTGAAAATTTCCA TGAAAAATTTGATTATTAA Protein sequence : MPIQSEETLEKNLIAQLQENGYEYVNVKNEDELKENFRLQLEKLNNCSFSDVEFDRILVYLDSGSIFDKAKKLRDKYYVD RDKDSFYIKFLNTKEWCKNIFQVANQITVHGLHENRYDVTILINGLPLVQIELKRRGGNIKEAFDQIIRYKSHSYSGLFN YIQLFVISNGVNTKYFANGSKNDLNFEFTFFWKDVKNNNYHSLDQFTDTFLEKCNIAEIISKYMILNESSKTLMVLRAYQ IYAVKAVLHQALEVKQNGYIWHTTGSGKTITSYKVSQLLAEDESIYKVLFIVDRRDLDIQTNKEFNSFCNGCVNETKHTG ALIKHLTTTGNGKLVTTTIQKLSKAVKTRGDMKKLQDIRDKNIILIYDECHRSQFGEMHQSIINFFNNALSFGFTGTPIF EENSNGLKTTKSIFGKRLHEYSIKDAIADNNVLGFSIDYFGGAKMLTETDLEVEGIDKREYFESDKRLNQIVDYIIKSYD NKTKNREFNAMFTVARGGVIHKYYDLFKKKKDEGKHNLKVATIFTYVANEDLSDNKQLSRDKLDKYMDDYNEMFGTNFST DDFKAYYVDVSKRMKNREIDLLLVVDMFLTGFDSKLLNTLYVDKNLQYHGLLQAFSRTNRIYNMRKSHGNIICFRNLKEN TDRAIRLFSDSNASEDIILPPYGFFVDKFNKEAEKFYSLVETVNDAVNLQSEKDKKQFVLNFRELSRILNKMNTFSEFSY DDIEMTEQDFSDYKSIYFDIHDELKSPDKEKVSVLDDIDFELELLRNDKINVDYILNILKTMDPKDSSFEHDKKRILNIM QETEHLRSKISLIEKFIDEELGNINDKDLSFNEVFDGFMSKERENAILDIISEEDLNEKIARQIFDYYEYSGKLDEDKLK KSFNHNLKFKERRNKVKEVKNMIENFHEKFDY |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| SSP0054 | YP_300144.1 | type I site-specific restriction-modification system restriction subunit | Not tested | SCC15305cap | Protein | 0.0 | 46 |
