|
Name : clpB (SSYRP_v1c08720) Accession : YP_008026972.1 Strain : Spiroplasma syrphidicola EA-1 Genome accession: NC_021284 Putative virulence/resistance : Virulence Product : ATP-dependent Clp protease, ATPase subunit ClpB Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 934315 - 936456 bp Length : 2142 bp Strand : - Note : - DNA sequence : ATGGAATTTCAACAACAGTATGAACCAGGCAAAGATCCAAAAATTCTTGAAAAATTTACCAAAAACTTAAATAAAGAGGC AAGTATTGGTAAATTAGAACCGATTATTGGCCGTGATGATGAAATTAATCGTGTGATTCGAATTTTATCACGTAAAACAA AAAATAACCCTGTTTTAATTGGGGAACCAGGAGTTGGGAAAACCGCAATCGTTGAAGGGCTAGCCCAACGTATTATTAAA GGAGACGTTCCAAGTAATTTAAAAAATAAAGTAATTTATGAATTAGATATGGGAGCTTTAATTGCTGGGGCTAAATTCCA AGGGGAATTTGAAGAACGGCTAAAAGCGATTATGAATAAGGTGAAAGAATCAAATGGGGAAATTATCTTATTTATTGATG AATTACACTTAATTGTTGGCGCAGGTAAAACGCAAGGAAGCATGGATGCTGGAAACTTATTAAAACCAATGTTAGCTCGT GGAGAATTGCATTGTATTGGCGCGACAACATTAGATGAACACCGTTTATACATTGAAAAGGATGCGGCGTTAGAACGAAG ATTCCAAAAAGTAATGGTTAATGAACCAACGATTGAAGAAAGTATCTCTATTTTACGGGGATTAAAAGAACGCTTTGAAA CTTATCATGGGGTTAAAATCCATGATAATGCTTTAGTTGCAGCGGTTAACTTATCGTCACGTTATATTAGTGATCGTTTT TTGCCTGATAAAGCAATTGATTTAGTAGATGAAGCATCAGCAACAATTAAAACAGAAATTGCTTCAGTGCCAACCGAATT AGATACATTAAACCGTAAAATTATTCAGTTAGAAATTGAAAAAGCAGCCTTACAAAAAGAAGCTGATCAAATTTCAAAAG ATCGTTTAGCTGATATTGAAACCGAATTAGCACCATTAAAAACAAAACAAGAAAAATTAGAAGCCCAATGAAATAGTGAA AAAAATGCCATTAAAAATCTAAAAGAGGTTAAATCACAAGTTGAAAAATTAAAAAAAGAACTAGATTTAGCTCAGTTAAC AGGGGACTTCAATCGGGCTGGAGAAATTAAGTATTCATTATTACCAGCATTAGAAGAAAAATTACATCAAGAAGAACAAA TGGCTTCTGAATCACATTTATTAAAAGAAGATGTAACAGAACGTGATATTGCGAAAATTGTTGGTAAATGAACAGGGATT CCTGTTGACCGCTTAGTTGAAAAAGAAAAAAGTAAATTATTAAATTTAAATAAAATTTTACGAAAAAGAGTTCGCGGTCA AAATGAAGCAATTGAAGCTGTTGCGGATGCAATTTTAAGAAGTCGCAGTGGTATTAAAGATCCTGACAAGCCAATTGGAA GTTTTCTTTTTTTAGGACCAACTGGAGTTGGTAAAACAGAAATTGCGCGTAGTTTGGCATACGTCTTATTTAATTCAGAA AAACAAATGGTCCGCTTAGATATGTCAGAATATATGGAAAAACATGCCGTAAGTCGTTTAATTGGAGCCCCTCCGGGCTA TGTTGGCTATGAACAAGGAGGGCAATTAACTGAAGCGGTTCGTCGTAACCCATATTCAATTGTCTTATTTGATGAAATTG AAAAAGCTAATCCTGAAGTGTTAAATATTTTATTACAAATTTTAGATGATGGTCGTATTACTGATGGTCTTGGTAAAACA GTTGACTTTAAAAATACAATCATTATTATGACTTCAAATATTGGGTCAGAATATTTATTAAATGAAAATAATGAAGGTGT AGGCGTTAAAATTCAAAAAGAATTAGCAAAACATTTTAAACCAGAGTTTTTAAACCGGATTGATAATGTTATTGTCTTTA GTGCTTTATCAAAAGAAATTATTAAAGAAATTGTGGAAAAAGAATTAGGGGAATTAACTCAACGAATTGAAGCAAATAAA AATATTCGATTAGTATTTTCCGAAGCTGTTTTAGAAAAAATTATTAATGAAGGCTATGATCGTGAATTTGGAGCTCGACC AATCAAACGTTATATTCAACGCAATATTGAAACGTTAATTGCGCGAGCAATTATTACTGAAGAAATTAAAGAAGGTAATT CATACACAATTGATGTTGATAATAACAAATTAGTAATAAAAACCAGTGCAAAATTAAATTAG Protein sequence : MEFQQQYEPGKDPKILEKFTKNLNKEASIGKLEPIIGRDDEINRVIRILSRKTKNNPVLIGEPGVGKTAIVEGLAQRIIK GDVPSNLKNKVIYELDMGALIAGAKFQGEFEERLKAIMNKVKESNGEIILFIDELHLIVGAGKTQGSMDAGNLLKPMLAR GELHCIGATTLDEHRLYIEKDAALERRFQKVMVNEPTIEESISILRGLKERFETYHGVKIHDNALVAAVNLSSRYISDRF LPDKAIDLVDEASATIKTEIASVPTELDTLNRKIIQLEIEKAALQKEADQISKDRLADIETELAPLKTKQEKLEAQWNSE KNAIKNLKEVKSQVEKLKKELDLAQLTGDFNRAGEIKYSLLPALEEKLHQEEQMASESHLLKEDVTERDIAKIVGKWTGI PVDRLVEKEKSKLLNLNKILRKRVRGQNEAIEAVADAILRSRSGIKDPDKPIGSFLFLGPTGVGKTEIARSLAYVLFNSE KQMVRLDMSEYMEKHAVSRLIGAPPGYVGYEQGGQLTEAVRRNPYSIVLFDEIEKANPEVLNILLQILDDGRITDGLGKT VDFKNTIIIMTSNIGSEYLLNENNEGVGVKIQKELAKHFKPEFLNRIDNVIVFSALSKEIIKEIVEKELGELTQRIEANK NIRLVFSEAVLEKIINEGYDREFGARPIKRYIQRNIETLIARAIITEEIKEGNSYTIDVDNNKLVIKTSAKLN |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| clpC | YP_005163377.1 | ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit | Not tested | Not named | Protein | 3e-118 | 41 |
| Gene | GenBank Accn | Product | ID of source DB | Alignment Type | E-val | Identity |
| clpB | YP_008026972.1 | ATP-dependent Clp protease, ATPase subunit ClpB | VFG2076 | Protein | 5e-108 | 42 |
