Name : nrdE (SSYRP_v1c04410) Accession : YP_008026544.1 Strain : Spiroplasma syrphidicola EA-1 Genome accession: NC_021284 Putative virulence/resistance : Unknown Product : ribonucleoside-diphosphate reductase alpha chain Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 484021 - 486174 bp Length : 2154 bp Strand : + Note : - DNA sequence : ATGACAAAGAAATTTAAATTAAATGATAAAGACATTAATGAAGAATACATTACCTTAAATGCCAGAACAAAACTTTTTGA AAAAGGGAAAGATAATTTTAAATTTGATCAGTTAGCAGCAGAGTCATATTTAAAAAATGTAATTATTCCTAACAGTAAAA TCTTTGAGACTGTAACTCAACGAATTAATTATCTTGTAGATAATAACTATTATGATAAGGATTTAATTAATCAGTATTCG ATTACTGCAATTGAAGAATTAACAAAATTAGCACAAAGCTTTAATCATCGTTTTCCAAGTTTAATGGGAGCCTTAAAATT TTATAACTTTTATGCTTTAAAAAGTTTTGATAGCAAAGAATACTTAGAGAGTTATGAAGAAAGAGTTATTATGAATGCTC TATTTTTTGGCAATGGCAATATTGAAACTGCTAAAAAAATATTAAAACAAATAATGCTTGGTCGTTTTCAACCAGCAACT CCAACTTTTTTGAATGCCGGTAAACAACAACGTGGTGAATATATTTCTTGTTATTTATTACGGATTGAAGACAATATGGA ATCAATTGCTCGTGCTGTTACTTCATCGCTGCAGCTTTCCAAAAAAGGGGGAGGAGTAGCGTTATGTTTAACTAACCTAA GAGAGTTTGGCGCCCCAATTAAAAACATTGTTAACCAAGCAACTGGTGTAATTCCAGTGATGAAAATTTTAGAGGATTGT TTTTCATATGCTAACCAATTAGGGCAACGCCAAGGAGCGGGAGCAGTTTATTTAAATGCTCACCATCCTGATATTATCTT ATTTTTAGATACGAAAAGAGAAAATGCTGATGAAAAAATTCGCATTAAATCTTTATCGCTTGGTGTAATCATTCCGGATA TTACTTTTGAATTAGCTAAAAAAAATGAACAAATGGCTTTGTTTAGCCCCTATGATATTGAAAGAGAATATCATAAACCA ATGAGTGATATTTCAATTACAAAAGAATATTATAATTTATTAAATAATCCAAACATTAAAAAAACATTTATTAATCCCCG TAAATTATTTCAAATGATTGCGGAACTACACTTTGAGAGTGGTTATCCATATTTATTATTTGATGATACTGTTAATAATC GCAATGCTCATCCCGGCCGAATTGTAATGAGTAATCTTTGCAGTGAAATCGCGCAGGTAAGTACTGCTAGTGAATATAAT TCTGATTTAAGTTTTCAAAAAATAGGGGATGATATTTGTTGTAATCTTGGCAGTTTAAACATCGCCAAGATGATGGAAAG TGGATCAGAGTTTGCAGAGACAGTTCAATTAGCTATTGAAGCCCTTGATCATGTTTCGCGAAAAAGTGATTTATCTTCCG CCCCATCAATTGCCCAAGGGAATAAAAAAAACCATGCCGTTGGTTTAGGTGCAATGAACTTACACGGTTTTTTGGCAACT AATCATTTGTTCTATCATTCCCCTGAAGCAGTAGACTTTACCAATATCTTTTTCTATACGATAGCTTATTATGCTTTTAA AGCTTCCAATCAATTAGCTAAAAAATATGGATCTTTTGCTAACTTTGAAAATTCAAAGTTTGCTGATGGTAGTTATTTTG AAAAGTATACTGCTTGTGATGAAAAAAAATGAACACCACAAACCGAAAAAATAATTAATTTATTTAAACAATACGATATT AAAATTCCAACCCAACAAGATTGACTTGATTTAGTCGAAAAGATAAAAAGCAGGGGGTTAGCAAATTCCCATTTGTTAGC AGTTGCACCAACCGGCTCAATTAGTTATCTTTCTTCATGTACACCTAGTTTGCAACCAGTTGTAGATGCAGTAGAAGTTC GAAAAGAAGGAAAATTAGGAAGAATTTATGTTCCTGCTTATCAAATTAATTTTGATAACATGGAATATTATACTTTTGGC GCTTATGAATTAGGTCCAGATCCAATTATTGATATTGCTGCTGCTGCCCAACAACATGTAGATCAAGCAATTTCATTAAC ATTATTTATGACTGAGAAAGCAACTACTCGTGACTTAAATAAAGCTTATATTCGAGCTTTTACAAAAAGATGTGCATCAA TTTATTATGTTAGAATTCGCCAAGAAGTTTTAGCCGATAGTGAAAATTATCAATGTGATGCTTGTGTAATTTAA Protein sequence : MTKKFKLNDKDINEEYITLNARTKLFEKGKDNFKFDQLAAESYLKNVIIPNSKIFETVTQRINYLVDNNYYDKDLINQYS ITAIEELTKLAQSFNHRFPSLMGALKFYNFYALKSFDSKEYLESYEERVIMNALFFGNGNIETAKKILKQIMLGRFQPAT PTFLNAGKQQRGEYISCYLLRIEDNMESIARAVTSSLQLSKKGGGVALCLTNLREFGAPIKNIVNQATGVIPVMKILEDC FSYANQLGQRQGAGAVYLNAHHPDIILFLDTKRENADEKIRIKSLSLGVIIPDITFELAKKNEQMALFSPYDIEREYHKP MSDISITKEYYNLLNNPNIKKTFINPRKLFQMIAELHFESGYPYLLFDDTVNNRNAHPGRIVMSNLCSEIAQVSTASEYN SDLSFQKIGDDICCNLGSLNIAKMMESGSEFAETVQLAIEALDHVSRKSDLSSAPSIAQGNKKNHAVGLGAMNLHGFLAT NHLFYHSPEAVDFTNIFFYTIAYYAFKASNQLAKKYGSFANFENSKFADGSYFEKYTACDEKKWTPQTEKIINLFKQYDI KIPTQQDWLDLVEKIKSRGLANSHLLAVAPTGSISYLSSCTPSLQPVVDAVEVRKEGKLGRIYVPAYQINFDNMEYYTFG AYELGPDPIIDIAAAAQQHVDQAISLTLFMTEKATTRDLNKAYIRAFTKRCASIYYVRIRQEVLADSENYQCDACVI |
Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
cur_1481 | YP_001800875.1 | ribonucleotide-diphosphate reductase subunit alpha | Not tested | Not named | Protein | 1e-174 | 54 |