|
Name : deoA (SSYRP_v1c03750) Accession : YP_008026480.1 Strain : Spiroplasma syrphidicola EA-1 Genome accession: NC_021284 Putative virulence/resistance : Unknown Product : thymidine phosphorylase Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 406682 - 407992 bp Length : 1311 bp Strand : + Note : - DNA sequence : ATGGATATTTTAAATTTCATTGAAAAAAAGAAAAATGGTCAAGAATTAACAAAAGAAGAAATTCATTACTTAATTTCTGA ATATACGAATGGGATTATTCCCGACTATCAAATGGCGGCTTTTTTAATGGCAGTTTATTTTCAGTCAATGTCAGCGAAAG AAATTTTTTATTTAACGGAGGCAATGGTTAATTCAGGAGAAACTTATGATTTATCACAAATTCCTGGTTTTAAAGTTGAT AAACACTCTTCTGGGGGTGTTGGTGATAAAGTTTCATTGATTTATGGCCCACTTGTCGCTTCTTTTGGCTTAAAAGTTGC GAAAATTTCTGGTCGTGGTTTTGGTCATACGGGGGGCACAATTGATAAATTAGAAAGTTTCCCAGGCTTTAAAACTAATT TTACTTTCGATGAATTTGTTAAAATTATTGAAAAAACTAATATGTCAATTATTTCCCAATCACAAGAAATTGTCCCAGCG GATAAAAAGATTTATCAATTACGCGATGTAACCGGAACTTCTGATTCATTACCGTTAATTGCTTCAAGTGTAATGTGTAA AAAAATTGCAACGGGAAGTGATGGGATTGTGTTAGATGTTAAAAGTGGTAGTGGGGCGTTATTAAAAAGTAATTCAGAAG CACGTGAATTAGCCCAAATTATGATTGAATTAGGGTTGGACTTTAATAAAAAAGTAGCAGTTATTATAACTAATATGTCA CAACCATTAGGGCATGCAATTGGTAATTTAATTGAAATTTTTGAGGTTTTAGAAGTATTACAAGGGCGCGGACCACAAGA TTTAATTTATATTAGTTGTAAAGTTGCTGCGTTAAGTCTTTGCCAAGGGGGGATTTTTGATAACCTGGATGAAGCCTTTG CTGCTTGTGAAGCACGCTTAAAAACCCCAGAACCATTAAATTATTTTAAAGCTTTTATTAAAGAACAAGGGGGCGATTTA GCAATTATTGAAAATCTAACCACAATTGAGAATTTATTAAAAGTAACTAATAGAATTGAAATTAAAGCAAAACAAGATGG TTATTTAGAAATCTTTAATACGAGTGAACTTGGGTTCTTAGCATCACGCTTAGGGGCTGGGCGCAGTGAAATGACCGATG AAATTGATCATAAAGCTGGAATTTATTTAAATAAAAAACATGGCGATGTTGTGAAAAAAGATGAAGTTATTATGACATTA TATACAAATCGTTACCCAACCCAAGCAATTTATGAATGACCAGATAAAATTTATCGTGTTGTTGAAAAAGCCCCAAAAGA ACAAGAACTAATTTATGACATTATTCAATAA Protein sequence : MDILNFIEKKKNGQELTKEEIHYLISEYTNGIIPDYQMAAFLMAVYFQSMSAKEIFYLTEAMVNSGETYDLSQIPGFKVD KHSSGGVGDKVSLIYGPLVASFGLKVAKISGRGFGHTGGTIDKLESFPGFKTNFTFDEFVKIIEKTNMSIISQSQEIVPA DKKIYQLRDVTGTSDSLPLIASSVMCKKIATGSDGIVLDVKSGSGALLKSNSEARELAQIMIELGLDFNKKVAVIITNMS QPLGHAIGNLIEIFEVLEVLQGRGPQDLIYISCKVAALSLCQGGIFDNLDEAFAACEARLKTPEPLNYFKAFIKEQGGDL AIIENLTTIENLLKVTNRIEIKAKQDGYLEIFNTSELGFLASRLGAGRSEMTDEIDHKAGIYLNKKHGDVVKKDEVIMTL YTNRYPTQAIYEWPDKIYRVVEKAPKEQELIYDIIQ |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| deoA | YP_005163381.1 | Thymidine phosphorylase | Not tested | Not named | Protein | 3e-76 | 45 |
