|
Name : polA (SSYRP_v1c09950) Accession : YP_008027093.1 Strain : Spiroplasma syrphidicola EA-1 Genome accession: NC_021284 Putative virulence/resistance : Unknown Product : DNA polymerase I Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 1083833 - 1086436 bp Length : 2604 bp Strand : - Note : - DNA sequence : ATGAATAAAATTTTACTAATTGATGGAAACTCATTAATCTTTCGGGCTTTTTATGCAACAGCCTATAGTGGTGAAATGTT AAAAAGTTTAGATGGAACACCAACAAATGCCGTTTATGCTTTTGCTAATATGTTAAATAAAATCTTAAAAGATAATAATT ATTATAGTGTTGTTGTGGCTTTTGATAAGGGAAAAATTAATTTTCGCCATGACTTAATTGCTGATTATAAAGCGGGAAGA AGTAAAACCCCAGAAGAATTAGTACAGCAATTTCCAATTGTGAAAGAATTTTTAGATAGTTATCAAATTCCTTATTTAGA AAAAGAAGGATATGAAGCCGATGATTTGCTAGGTTGTTTAGCTAAGCAAGCTGAGACGCAAAATTATTATGTTGATATTT TATCAAGTGATAAAGATTTATTTCAATTAATTAGTGATAAAACAAATATTTTAATTCCTCGCCAAGGTGATAGTGCTGAT ATTTTTGATAAAACAGCACTATTAAATAAGTGAGAAGTTAGTCCCGAACAAGTTCCTGATTTAAAAGGTTTAATGGGTGA TCCTTCTGATAATTTAAAAGGAATCCCCGGGGTTGGAGAAAAAACAGCGATCAAGTTAATTAAGGAATATCAAACAATTG AAAATATTTATCAAAATATTGACGATATTAAAGGGAGCTTAAAGAATAATTTAATTAGTCATCAAGCTGAAGCGTTATTA TGTAAGAAAGTAGCAACAATTCTATGTGATTTGGAATTAGGTGATTTTGCTTTTAGCAAACTAGAAGTTAACAAAGAAAA ACTACTAGATTTTTATTTAAAATATAATATGAATTCTTATGTTACTAAACTTTACAATAATAGTGAACCAGTTAAACAGA GTTTAGCCGTTAAAGTTATTACAGAATGAAGCGAGGAATGAAATGAAGATGGGACAACTGTTTTTTTAGAATTGTTTGAT GAAAATTATCATCTATCCGAACTTATAGGGTTTGGAATTGTTAATTCGCATGGTATTTTTTATTTTGATTATACGAGTGC TAAATTTGACACGAGTTTTCATGCTTTTTTAGCAAACGAAAATTATCAAAAATTTACTTATAATGCTAAAAGTTTAATTG TTGGTTTAGGCCGCGATAATATTACAATTAACAATATTAGTTATGACATGATGTTAGCGGGCTATATTTATAATTCAAAC ACAAAAAATACCCTTGATAATTACATTAATTTATTTGCTAAAAAACAAATTTTATCTGATGAATTATTTTATGGCAAAGG GGTTAAAAAAACTATTCCCACGGATTTAAATAAATTAAGTTACTTTATTGGCGAGAAAGCGAATTATATTCACACGTTAC GTGAAAAGATTGTTTCTTTATTAACAAGTAGTAATCAATATCAGTTATATTATGATATTGAATTACCAACAACATTTGCT TTGGCTCGAATGGAACGAGCTGGAGTTAAAGTTGACCAACGAGAGCTATCAAAACAAACTGTTCGAATTGAACAAATTGT TAATGACCTAAATCGTGAAATTAATACAATGGCCAATAAAGAAGTTAATCCTAATTCTCCAAAACAATTATCGGAATTAT TGTATCAAGACTTACAATTAAAAGATCATAAGAAGGGTTCAACAGCCCAAGAAGTTTTAGAAACAATTAAATTAAGTCAC CCAATTATTAGTAAAATTTTGGATTATCGGAAATATCAAAAATTATATTCAACCTATTTAAAAGGGATGGAAAAATACCT TTTCCAAGATGGGAAAGTGCACACAATTTATAAACAAACATTAACAGCAACTGGACGATTATCTTCAGTTGAACCTAATA TGCAAAATATTAGTATTCGCGATGAAGTACAAAAAGAAGTTCGTAAAATTTTTGTTGTCTCATCGGAAGATAATATTTTA TTATCAGCAGACTATTCACAAATTGAATTGCGAATTTTAGCTGATATGTCAAAAGATGATCATATGTTAGCAGCATTTAA TGCTGGAGAAGATATCCATACTAATACGGCGATGAAAATTTTCAATTTGAAAAAAGAAGAAATTACTTCAACAATTCGTC GCAGTGCTAAAGCAGTTAATTTTGGAATCATTTATGGGATTAGTGATTTTGGTTTAGCCAATGATTTAAATATTTCTGTG CCAGAAGCAAAAGAAATTATTCAAAATTATTATCAACAATTCCCAACAATTAAAAATTTCATTGATAGTCAAGTTGAGTT TTGTAAGAATAATGGCTATGTTATGACAATGTTTAACCGTAAACGCTATGTTCCAGAAATTAATGATGCTAATTATATGC AACGGGAATTTGGTAAACGGATTGCAATGAATATGCCAATTCAGGGAACAGCGGCCGATATTATTAAAATAGCTTTAAAA AATATTGATCAAGAATTATTACGCTTAAAGTTAAGAACAAAAATTATTGCCCAAATTCACGATGAATTAATTTTTGAAGT CCCAAAAACAGAATTAGCACAAGTAAAAGCGTTGGTGAAAGATTTAATGGAAAATTCAACAAAACTAAGTGTTAAATTAA CTGTTGATATGGTTGAAGGAGCATCTTGATATCAATTAAAATAA Protein sequence : MNKILLIDGNSLIFRAFYATAYSGEMLKSLDGTPTNAVYAFANMLNKILKDNNYYSVVVAFDKGKINFRHDLIADYKAGR SKTPEELVQQFPIVKEFLDSYQIPYLEKEGYEADDLLGCLAKQAETQNYYVDILSSDKDLFQLISDKTNILIPRQGDSAD IFDKTALLNKWEVSPEQVPDLKGLMGDPSDNLKGIPGVGEKTAIKLIKEYQTIENIYQNIDDIKGSLKNNLISHQAEALL CKKVATILCDLELGDFAFSKLEVNKEKLLDFYLKYNMNSYVTKLYNNSEPVKQSLAVKVITEWSEEWNEDGTTVFLELFD ENYHLSELIGFGIVNSHGIFYFDYTSAKFDTSFHAFLANENYQKFTYNAKSLIVGLGRDNITINNISYDMMLAGYIYNSN TKNTLDNYINLFAKKQILSDELFYGKGVKKTIPTDLNKLSYFIGEKANYIHTLREKIVSLLTSSNQYQLYYDIELPTTFA LARMERAGVKVDQRELSKQTVRIEQIVNDLNREINTMANKEVNPNSPKQLSELLYQDLQLKDHKKGSTAQEVLETIKLSH PIISKILDYRKYQKLYSTYLKGMEKYLFQDGKVHTIYKQTLTATGRLSSVEPNMQNISIRDEVQKEVRKIFVVSSEDNIL LSADYSQIELRILADMSKDDHMLAAFNAGEDIHTNTAMKIFNLKKEEITSTIRRSAKAVNFGIIYGISDFGLANDLNISV PEAKEIIQNYYQQFPTIKNFIDSQVEFCKNNGYVMTMFNRKRYVPEINDANYMQREFGKRIAMNMPIQGTAADIIKIALK NIDQELLRLKLRTKIIAQIHDELIFEVPKTELAQVKALVKDLMENSTKLSVKLTVDMVEGASWYQLK |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| polA | YP_281523.1 | DNA polymerase I | Not tested | Not named | Protein | 1e-151 | 42 |
