Gene Information

Name : HMPREF0409_01491 (HMPREF0409_01491)
Accession : YP_008018598.1
Strain : Fusobacterium sp. 4_8
Genome accession: NC_021281
Putative virulence/resistance : Unknown
Product : hypothetical protein
Function : -
COG functional category : -
COG ID : -
EC number : -
Position : 258321 - 260132 bp
Length : 1812 bp
Strand : +
Note : -

DNA sequence :
ATGAATAGTGTAAGGAAATTAATAAAGTTTTTAATAGATATATTTTTATTAAATATCTCATTAATTATTTCTGTTTTTCT
AAAATATGATCAAATACAAATAACAGATAGAAATACAAATTTCTTTATCTATTATAATATTTCTTTTTGCATTATATATT
TTATTTTAAAAATTTATAATAATAGTTGGAGATTCAGTGGGATATCTGAATATACAGCTTTAATAGCTTTAAGCGTATCT
ACAACAATTTTTTCGTATATACTAAGAATATTTTTTAACTTAGGCATTAAAAGTAGTCTATATTTTGAAACCTTTATTAT
CTTTACATTTTTATTAATACTTTCAAGATTTCTAATGTTTTTAACTAGAATGAAAGGAATTATAAAAAAAGATTTAAATC
AGGAAAATGTACTTATCTATGGAGCAGGAGAATCTGGGGTTTTATTAGTAAAGGAATCTAAAATAAACCCAAATTTTCCA
TATAAAATAGTTGGTTTTTTAGATGATAATATAAATAAAATAGGCGGAAAAGTTTATGGACTAAAAGTTTTAGGTGGTTT
AGAAAAAGTAAAAGAAATAGTAGAAAAAAAAGAGATTTCCAAAATAATTATATCTATGCCATCAGTAAGTCAAAATAAAG
TTTCTAATATTTTAAAAGAAATTAATAAAATAGAGGGCTTATCTGTTAAAATATTACCGAATGTAGACAATTTAATAGAA
GAAGGGAATTTAGCAACTCAACTTAGAAATATAAAATTAGAGGATTTATTAGGTAGAGAAGAAATAAAAATAAACACAAA
GGAAGTATTTGATTTTATTCAGGATAAGATAATATTTGTAACTGGTGGTGGAGGAAGTATTGGATCTGAACTTATTAACC
AAATTGCAAAATATAACCCTAAAAGAATTATTAATATTGAAATTAATGAAAATGCTTCCTATCTTATGGAACTTGAATTA
AAAAGAAAGTATCCTTATTTAGACTATAAAACTGAAATTGCAAGTGTTAGAGATTTTGGTAAGCTAGATATATTATTTAA
TAAATACAAGCCAGATATATTATTCCATGCTGCTGCACATAAACATGTACCACTTATGGAAAATAATCCAGAAGAAGCTA
TAAAAAATAATATATTTGGAACTAAAAATATAGCAGAATGTTGCTTAAAATATAAATTAGAGTCAGTAGTTTTAATTTCA
ACAGATAAGGCTGTAAATCCAACCAACATTATGGGAGCAACAAAAAGAGTTTGTGAAATGATTTTTCAAAAATATTCAGA
AAAATCTTCAAATACAAAATTTATGGCAGTTAGATTTGGAAATGTGTTAGGAAGTAATGGTTCAGTTATTCCAATATTTT
CAAAATTAATAGAAGAGGGAAAGAATTTAACTCTTACTCATAAAGATATAATTAGGTATTTTATGACTATACCAGAAGCA
GCTCAATTAGTTATAGAGGCAGCAACTATTGGTAAAGGTGGAGAAATTCTAATTTTAGATATGGGGGAACCAGTTAAAAT
ATATGATTTAGCTAAGAATATGATTAAATTATCGGGTTCAACTGTTGGAATAGATATAGTTGGATTAAGACCTGGAGAAA
AATTATTTGAAGAATTACTATATGATGTAAATTCATCAGAAAAGACATCAAATAATAAGATATTTATTACTAATATGGAA
AATGAAAAAGTTAAAGTAAATATTGATGATTATTATGCAATTCTTAAAGATTTAATTAAAGAAAATGATATTATTGGTAT
GAGAAGAACTCTTGCTAATATTATTGGAACTTTTAAAGGGAGAGTGGAATAA

Protein sequence :
MNSVRKLIKFLIDIFLLNISLIISVFLKYDQIQITDRNTNFFIYYNISFCIIYFILKIYNNSWRFSGISEYTALIALSVS
TTIFSYILRIFFNLGIKSSLYFETFIIFTFLLILSRFLMFLTRMKGIIKKDLNQENVLIYGAGESGVLLVKESKINPNFP
YKIVGFLDDNINKIGGKVYGLKVLGGLEKVKEIVEKKEISKIIISMPSVSQNKVSNILKEINKIEGLSVKILPNVDNLIE
EGNLATQLRNIKLEDLLGREEIKINTKEVFDFIQDKIIFVTGGGGSIGSELINQIAKYNPKRIINIEINENASYLMELEL
KRKYPYLDYKTEIASVRDFGKLDILFNKYKPDILFHAAAHKHVPLMENNPEEAIKNNIFGTKNIAECCLKYKLESVVLIS
TDKAVNPTNIMGATKRVCEMIFQKYSEKSSNTKFMAVRFGNVLGSNGSVIPIFSKLIEEGKNLTLTHKDIIRYFMTIPEA
AQLVIEAATIGKGGEILILDMGEPVKIYDLAKNMIKLSGSTVGIDIVGLRPGEKLFEELLYDVNSSEKTSNNKIFITNME
NEKVKVNIDDYYAILKDLIKENDIIGMRRTLANIIGTFKGRVE

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
SSP0063 YP_300153.1 capsular polysaccharide biosynthesis protein Not tested SCC15305cap Protein 3e-72 41