|
Name : deoA (SCHRY_v1c03670) Accession : YP_008017713.1 Strain : Spiroplasma chrysopicola DF-1 Genome accession: NC_021280 Putative virulence/resistance : Unknown Product : thymidine phosphorylase Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 400825 - 402135 bp Length : 1311 bp Strand : + Note : - DNA sequence : ATGGATATTTTAAATTTCATTGAAAAAAAGAAAAATGGTCAAGAATTAACAAAAGAAGAAATTCATTATTTAATTTCTGA ATATACAAATGGGATTATTCCCGACTATCAAATGGCGGCTTTTTTGATGGCGGTTTATTTTCAATCAATGTCAGCCAAAG AAATCTTTTATTTAACTGAGGCAATGGTTAATTCAGGGGAAACATATGACTTATCACAAATCCCTGGTTTTAAAGTGGAT AAACATTCTTCTGGGGGTGTTGGTGATAAAGTTTCATTAATTTATGGACCTCTTGTAGCTTCATTTGGCTTAAAAGTTGC GAAAATTTCTGGTCGTGGTTTTGGTCATACTGGAGGCACAATTGATAAATTAGAAAGTTTTCCAGGATTTAAAACTAATT TTACTTTCGATGAGTTTGTTAAAATCATTGAAAAAACTAATATGTCAATTATTTCTCAATCACAAGAAATTGTTCCTGCT GATAAAAAAATTTATCAATTACGGGATGTAACAGGAACTTCTGATTCATTGCCATTAATTGCTTCAAGTGTAATGTGTAA AAAAATTGCCACAGGAAGTGATGGGATTGTTTTAGATGTTAAAAGTGGTAGTGGGGCTTTATTAAAAAGTAATTCAGAAG CTCGTGAATTAGCTCAGATTATGATTGAATTAGGTTTGGATTTTAATAAAAAAGTTGCAGTTATTATTACCAATATGTCC CAACCATTAGGACATACGATTGGTAATTTAATTGAAATTTTTGAGGTTTTAGAAGTACTACAAGGACGAGGGCCACAAGA TTTAATTTATATTAGTTGTAAAGTAGCAGCTTTAAGTCTTTGCCAAGGGGGGATTTTTGATAATCTAGATGAAGCCTTTG CTGCTTGTGAAACGCGTTTAAAAACCCCAGAGCCATTAAATTATTTTAAAGCTTTTATTAAAGAACAAGGGGGAGATTTA TCAATTATTGAAAATATAACCACAATTGAAAATTTATTAAAAGTAAGTAATGTAATTGAAATTAAAGCAAAACAAGATGG TTATTTAGAAATCTTTAATACTAGTGAACTTGGGTTCTTAGCTTCGCGTTTAGGAGCTGGGCGTAGCGAAATGACCGATG AAATTGATCATGGAGCAGGAATTTATTTAAATAAAAAACATGGTGATGTCGTTAAAAAAGATGAAGTTATTATGACATTA TACACGAATCGTTACCCAACCCAAGTAATTTATGAATGACCAGATAAAATTTATCGGATTGTTGAAAAAGCTCCAAAAGA ACAAGAACTAATTTATGACATTATTCAATAA Protein sequence : MDILNFIEKKKNGQELTKEEIHYLISEYTNGIIPDYQMAAFLMAVYFQSMSAKEIFYLTEAMVNSGETYDLSQIPGFKVD KHSSGGVGDKVSLIYGPLVASFGLKVAKISGRGFGHTGGTIDKLESFPGFKTNFTFDEFVKIIEKTNMSIISQSQEIVPA DKKIYQLRDVTGTSDSLPLIASSVMCKKIATGSDGIVLDVKSGSGALLKSNSEARELAQIMIELGLDFNKKVAVIITNMS QPLGHTIGNLIEIFEVLEVLQGRGPQDLIYISCKVAALSLCQGGIFDNLDEAFAACETRLKTPEPLNYFKAFIKEQGGDL SIIENITTIENLLKVSNVIEIKAKQDGYLEIFNTSELGFLASRLGAGRSEMTDEIDHGAGIYLNKKHGDVVKKDEVIMTL YTNRYPTQVIYEWPDKIYRIVEKAPKEQELIYDIIQ |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| deoA | YP_005163381.1 | Thymidine phosphorylase | Not tested | Not named | Protein | 2e-76 | 45 |
