Gene Information

Name : pgm (SCHRY_v1c02970)
Accession : YP_008017645.1
Strain : Spiroplasma chrysopicola DF-1
Genome accession: NC_021280
Putative virulence/resistance : Unknown
Product : phosphoglyceromutase
Function : -
COG functional category : -
COG ID : -
EC number : -
Position : 321408 - 322985 bp
Length : 1578 bp
Strand : +
Note : -

DNA sequence :
ATGAAGGTTAAACAACCAATTTTATTAGCAATTTTAGATGGGTGAGGAATTGCCCCAGATAGTGTTGGGAATGCGGTAAC
ACAAGCGCATATGACAAATGTTTTAGGGTTAATGGAAAAATATCCATGAGTAAAAGCCCATGCGTCAGGGGAATGAGTCG
GATTACCAGAGGGCCAAATGGGAAACTCAGAAGTTGGACATATTCACTTGGGTGCAGGAAGAATTAAATATGAATCATTA
ACTTTAATTAATAAAGCAATTAATGATGGGACATTTAATCAAAATGCGGAAATATTAGCAGCAATTAAGTTTGCGAAAGA
AAATAATGGTGCTTTCCATATTATGGGACTATTTTCAGATGGTGGTGTGCATTCACACATTGACCATATTTTTGCAGCAT
ATCGTTTAGCAGCCCAAGAAGGATTAACTGAGATTTATTTACATGCATTTGGTGATGGACGTGATACAAAACCAGAGTGT
ATTAAAGAATATCTTGAAAAATTTAAAGTGTTACAAGAACAATTAAAAGTTGGAGAAATTGCGACAATTGGTGGTCGTTA
TTATGCAATGGATCGTGATAAAAAATATGATCGTGTTCAAGTGGCATATGATGTTTTAGTATCCCATCAAGGAGCAACAT
TCACTGACCCAATTGCATATATTGATGCTGAATATGCGGCCGGGCGAAATGATGAATTTTTAATGCCTGGGTATAATGTT
AATACTCCAACTGGTTATATTAAACCAGGGGATGGAGTTTTATTTGCTAATTTCCGCCCAGATCGAGCAATCGCAATTGC
TTCAGCAATTACAAATCCTGCTTTTCCGGGGGGAGAAAGTGATAAATATTTTTTACCAAAAGTTGATAATATTTATTTTG
TATCAATGATGAAATATGCTGACACAGTTACTTCACCTCATATTGCTTTTCAAGCAATTGAAGTTACTAATGGTTTAGGA
GAATGATTAAGCAAAAAAGGATATCAACAATTACGAATTGCTGAAACTGAAAAAATTGCCCATGTGACATTCTTCTTTGA
TGGTGGGAAAGATTATTTTAAAAATGGTCTAGCAACCCCTGAAGAAATTACCCTTCCAGGGTCATCACTAGATTTAATTG
CTTCACCAAAAGTAGCAACATATGATTTAATGCCAGAAATGTCAGCGTATGGGATTACTGATAAATTAATTGAAGAATTA
AATAAAAAAGAATTTGATGTTATTATCTTAAACTTTGCTAACTGTGATATGGTTGGTCACACTGGTAATTTAGCAGCGGC
AACAAAAGCAGTCAAAGTAGTTGATGAATGTTTAGGAAAAATTTATCAAGCAATTAAAGCAGTTGATGGAATTATGATTA
TTACTGCCGACCATGGTAACGCTGAGGTAATGTTGGACGAAGAAGGTGGCATAAATAAAAAGCATACTTCACAATTAGTA
CCAATTATTATTACAAAAGCTGATTTAAAACTTCGTCAAGGTGAAGTTGGGATTGCGAATGTTGCACCAACAATTCTTGA
TTTAATTGGAGAAGAAATTCCAGCGGAAATGACCCAGTCTTCATTAATTATTAAATAA

Protein sequence :
MKVKQPILLAILDGWGIAPDSVGNAVTQAHMTNVLGLMEKYPWVKAHASGEWVGLPEGQMGNSEVGHIHLGAGRIKYESL
TLINKAINDGTFNQNAEILAAIKFAKENNGAFHIMGLFSDGGVHSHIDHIFAAYRLAAQEGLTEIYLHAFGDGRDTKPEC
IKEYLEKFKVLQEQLKVGEIATIGGRYYAMDRDKKYDRVQVAYDVLVSHQGATFTDPIAYIDAEYAAGRNDEFLMPGYNV
NTPTGYIKPGDGVLFANFRPDRAIAIASAITNPAFPGGESDKYFLPKVDNIYFVSMMKYADTVTSPHIAFQAIEVTNGLG
EWLSKKGYQQLRIAETEKIAHVTFFFDGGKDYFKNGLATPEEITLPGSSLDLIASPKVATYDLMPEMSAYGITDKLIEEL
NKKEFDVIILNFANCDMVGHTGNLAAATKAVKVVDECLGKIYQAIKAVDGIMIITADHGNAEVMLDEEGGINKKHTSQLV
PIIITKADLKLRQGEVGIANVAPTILDLIGEEIPAEMTQSSLIIK

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
BJAB0868_00302 YP_008211628.1 Phosphoglyceromutase Not tested AbaR26 Protein 7e-90 46
BJAB07104_00298 YP_008207763.1 Phosphoglyceromutase Not tested AbaR25 Protein 7e-90 46