|
Name : polA (SCHRY_v1c10040) Accession : YP_008018339.1 Strain : Spiroplasma chrysopicola DF-1 Genome accession: NC_021280 Putative virulence/resistance : Unknown Product : DNA polymerase I Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 1099844 - 1102447 bp Length : 2604 bp Strand : - Note : - DNA sequence : ATGAATAAAATTTTACTAATTGATGGAAACTCATTAATCTTTCGCGCCTTTTATGCGACAGCATACAGCGGGGAAATGTT AAAAAGTTTAGATGGAACCCCAACGAATGCCGTTTATGCTTTTGCTAATATGTTAAATAAAATCTTAAAAGATAATAATT ATTATAGTGTTGTTGTTGCTTTTGATAAAGGAAAAGTTAATTTTCGCCATGACTTAATTACTGATTATAAAGCAGGACGA AGTAAAGCCCCAGAAGAACTAGTGCAACAATTCCCAATTGTCAAAGAATTTTTGGATAGTTACCAAATCCCATACCTAGA AAAAGAAGGATATGAAGCGGATGACTTATTAGGTTGTTTAGCAAAACAAGCTGAAGCGCAAAACTATTATGTTGATATTT TATCAAGTGATAAAGATTTATTTCAATTAATTACCGATAAAACAAATATTTTAATCCCACGCCAAGGGGATAGTGCTGAT ATTTTTGATAAAACAGCGCTATTAAATAAATGAGAAGTTAGTCCCGAACAAGTTCCTGATTTAAAAGGTTTAATGGGCGA TCCCTCAGATAATTTAAAAGGAATTCCGGGAGTTGGTGGGAAAACAGCGATTAAACTAATTAAGGAATATCAAACGATTG AAAATATTTATCAAAATATTGACAATATTAAGGGTAATTTAAAAAATAATTTAATTAGTCATCAAGATGAAGCGTTATTA TGTAAAAAAGTAGCAACAATTTTATGTGATTTAGATTTAGGAGATTTTGCTTTTAGTAAACTAGAAGTTAACAAAGAAAA ATTACTAGATTTTTATTTAAAATATAATATGAATTCCTATGTTACAAAACTTTACAATAATAATGAACCAGTCAAACAGA GTTTAGAAGTTAAAGTTATTACAGAATGAAATGAGCAATGAAATGAAGATGGGACAACTGTTTTTTTAGAATTGTTTGAT GAAAATTATCATCTCTCAGAACTTATTGGGTTTGGGATTGTTAATTCTCATGGTATTTTCTATTTTGATTACACGAGTGC TAAATTTGATACAAGTTTTCACGCTTTTTTAGCAAACGAAAATTATCAAAAATTTACTTATAACGCCAAAAGCTTAATTG TTGGGTTAGGGCGTGATAACATTACCATTAATAATATTAGTTATGACATGATGTTAGCTGGTTATATTTATAATTCAAAT ACAAGAAATACTCTTGATAATTACATTAATTTATTTGCTAAAAAACAAATTTTATCTGATGAATTATTTTATGGTAAAGG GGTTAAAAAAACGATTCCAACAGATCTTAATAAATTAAGTTACTTTATTGGGGAGAAAGCTAATTACATTCACATGCTAC GCGAAAAGATTGTTACATTATTAACAAATAATAATCAGTACCAGTTGTATTATGATATTGAATTGCCAACAACATTTGCT TTAGCACGAATGGAACGAGCAGGGGTGAAAGTTGACCAACAGGAGTTATCAAAACAAACTGTTCGAATTGAACAAATTGT TAATGATTTAAACCGCGAAATTAATACAATTGCCAATAAAGAAGTGAATCCTAATTCTCCTAAACAATTATCAGAATTAT TGTATCAAGATTTACAATTAAAAGATTACAAGAAAGGGTCAACAGCCCAAGAAGTTTTAGAAACAATTAAGTTAAGTCAC CCAATTATTAGTAAAATTTTGGATTATCGTAAATATCAAAAATTATATTCAACATATTTAAAAGGCATGGAAAAGTACCT TTTCCAAGATGGGAAAGTTCATACAATTTATAAACAAACTTTAACAGTAACAGGACGATTATCCTCAGTTGAACCTAATA TGCAAAATATTAGTATTCGCGATGAAATTCAAAAAGAAGTTCGTAAAATTTTTGTTGTCTCATCGGAAGATAATATTTTA TTATCAGCAGATTATTCACAAATTGAATTACGAATTTTAGCTGATATGTCAAAAGATGACCATATGTTAGCAGCTTTTAA TGCTGGTGAAGATATTCATACTAATACGGCGATGAAAATTTTCAATTTAAAAAGAGCGGAAATTACCCCAGCAATTCGTC GAAGTGCAAAAGCAGTTAATTTTGGAATTATTTATGGGATTAGTGATTTTGGACTAGCAAATGATTTAAATATTTCTGTC CCGCAAGCAAAAGAAATTATTCAAAATTATTATCAACAATTCCCGACAATTAAAAATTTTATTGATAGCCAAGTTGAGTT TTGTAAGAATAATGGTTATGTTGTTACAATGTTTAACCGTAAACGCTATGTTCCAGAAATTAATGATGCTAATTATATGC AACGTGAATTTGGCAAACGGATTGCAATGAATATGCCAATTCAGGGAACAGCGGCTGATATTATTAAAATTGCTTTAAAA AATATTGATCAAGAATTACTACGTTTAAAGTTAAAAACAAAAATTATTGCTCAAATTCACGATGAACTAATTTTTGAAAT CCCAAAAACAGAATTAACACAAGTAAAAGCTTTGGTGAAAGATTTAATGGAAAATTCAACAAAACTAAGTGTTAAATTAA CTGTTGACATGGCAGAAGGAACATCTTGATATCAATTAAAATAA Protein sequence : MNKILLIDGNSLIFRAFYATAYSGEMLKSLDGTPTNAVYAFANMLNKILKDNNYYSVVVAFDKGKVNFRHDLITDYKAGR SKAPEELVQQFPIVKEFLDSYQIPYLEKEGYEADDLLGCLAKQAEAQNYYVDILSSDKDLFQLITDKTNILIPRQGDSAD IFDKTALLNKWEVSPEQVPDLKGLMGDPSDNLKGIPGVGGKTAIKLIKEYQTIENIYQNIDNIKGNLKNNLISHQDEALL CKKVATILCDLDLGDFAFSKLEVNKEKLLDFYLKYNMNSYVTKLYNNNEPVKQSLEVKVITEWNEQWNEDGTTVFLELFD ENYHLSELIGFGIVNSHGIFYFDYTSAKFDTSFHAFLANENYQKFTYNAKSLIVGLGRDNITINNISYDMMLAGYIYNSN TRNTLDNYINLFAKKQILSDELFYGKGVKKTIPTDLNKLSYFIGEKANYIHMLREKIVTLLTNNNQYQLYYDIELPTTFA LARMERAGVKVDQQELSKQTVRIEQIVNDLNREINTIANKEVNPNSPKQLSELLYQDLQLKDYKKGSTAQEVLETIKLSH PIISKILDYRKYQKLYSTYLKGMEKYLFQDGKVHTIYKQTLTVTGRLSSVEPNMQNISIRDEIQKEVRKIFVVSSEDNIL LSADYSQIELRILADMSKDDHMLAAFNAGEDIHTNTAMKIFNLKRAEITPAIRRSAKAVNFGIIYGISDFGLANDLNISV PQAKEIIQNYYQQFPTIKNFIDSQVEFCKNNGYVVTMFNRKRYVPEINDANYMQREFGKRIAMNMPIQGTAADIIKIALK NIDQELLRLKLKTKIIAQIHDELIFEIPKTELTQVKALVKDLMENSTKLSVKLTVDMAEGTSWYQLK |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| polA | YP_281523.1 | DNA polymerase I | Not tested | Not named | Protein | 6e-150 | 41 |
