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Name : nrdE (SLY_0074) Accession : YP_007996279.1 Strain : Candidatus Phytoplasma australiense NZSb11 Genome accession: NC_021236 Putative virulence/resistance : Unknown Product : Ribonucleoside-diphosphate reductase alpha subunit Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 64977 - 67547 bp Length : 2571 bp Strand : + Note : - DNA sequence : ATGTTAGAACAAAAAATCAAAATAATTTATGACGGTTTAAAAAAAGGCCAAGTTTATAATATGGCGCAAAGTCTTGGTTT TGATTTCAAACATATTAGCGAATGCCAAGCAAACGCTATAGATAATGATGTTTTTTTATTAACTCGTAGTGTTAAATTTG GCGAAGTATCTCAAGAAGCGAAACTTTTTTTAGATCAAAATCGTGATAAAGTCATTGGAGTTGCTGTTTCTGGCAATAAA ACCTGGGGTCAAAATTATGGCAAAGCAGGCGATATTATTGCCTCTACTTACAACATCCCTTTAGTTTTAAAATTTGAGGG TTCAGGAATCCAAGAAGAAAGACTTTTTTTAAAAAAATGGCTTCTTAGTTACAAAAAAGAAAAAAATTCCTCATTTTCTT TCAAAAAACCATTACAAAATGATTCTAATTTTTCGGATGTTACTGTTAAAAACACAAATGAACCAACCCCTCCCACACAA AAAATTTTGCCACCCTGGATTCTTCTTAATAATCAAATTATTGATGAAAATGGCAATATTAAAGATTTAAACAAAGACCA AGAAGCTTTAACAAGTTTTTTGTTAGAAGAAGTAAAGCCAAAATTAAAACACTTTGATACTTTAAAAGAAAAATTGACTT TTTTACAAACTAACGAATATTATGAAACTGATTTTTTAAGTCAATATAACGAACAACAAATTAAAGATATTTATAAAATA GCTTATCAAAAACAATTTCGTTTTTCTACTTTTATGGGAGCTTTCAAATTTTATAACGATTATGCCTTAAAAAGCAGAGA CAAAAAGTATTATTTAGAGACTTATGAAGACAGATTGTGCGTTAATGCTTTGTATCACGCTCAAGGAGATTTTGAAATTG CTAAAAGATTGATTAAATCTTTGATTAACCAAGATTTCACCCCAGCAACCCCAACTTTATTAAATGCAGGTAAAAAACAT CGTGGTGAATTTGTTTCTTGTTTCTTGTTAGAAGCAGGTGATTCTTTAAACGATATTGCTCGCATTAATGAATTTTCAAT GCAACTTTCCAAAATTGGTGGTGGAGTTTCTATTAACATTACTAATTTGCGTGCGAAAGGTGAAAGTATTAAAGGAATTA AGGGCGTGTGCAAAGGAGTTGTTGGCGTTTGTAAATTACTCGATCATAGTTTTCGTTATGCCGATCAAATGGGTCAAAGA ACGGGTGCGGGAGCAGTTTATTTAAGTGTTTTTCATGCCGATATTGAAGATTTTTTAAGTACTAAAAAACTGAATGCTGA TGAAGATGTTCGTGTAAAAACTTTATCTCTAGGAGTTATAGTGCCTAATAAAATGATTGAATTGGCAAGAAAAAACGAAG TCATGTATACTTTTTATCCTCATACTGTTTTTTTGGAATACGAAAAAAACTTCGCTGATATTGCAGTTAACATGGATTAT TGGTATGATATTTTGGTAAGCAATCCGAAAGTTCGCAAAAAAGCTATTCAACCGCGTCAATTATTAGAATTGATTGCTCG TATGCAAGGTGAGTCAGGCTATCCTTATTTAATGTTTTGCGATAACGTTAATCAAAACAACACCTCTCATTTACAAGTTA AATTTTCTAACTTATGCACAGAAATTCTTCAACCAACTATCACTTCTCATTATACTGATTACAACCACACCCAAGAAGAT AAAATTGGAATGGATGTATCTTGTAATTTAGCATCCGGTCACATGTCTAATATGATTAATAACAACACCATCAAAGAAAC TGTTTTTATGGCGATGGAAGTGATGAATACAGTTTCCATGAAAACAAATATCAATTATGTTCCTGCAGTGGCCAAAGCTA ATCGATTAAACCGAAGTGTTGGTTTTGGAATCATGGGTCATCATGGTTTTCTAGCTCAAAATTACATTGCTTTTGGCAGT GAAGAAAACAAAGATTTGATTGATGTTTTTTTTAATGCTATTAATTATTATAGTCTCTTGCATTCTTGTCAAAAAGCCAA AAAAACAGGACAAAAATTTTATCTTTTTGAAAAATCTCATTATGCGGATGGATCTTATTTTAAAGGCCGTGGAGAAATTT TACCAAAAACTGATAAAATCAAAAAAATGTTTGCCAATATTCCTTTGCCAAGTGAAAAAGATTGGCAACAACTTAAAAAA GATGTTCAACAATTTGGTCTTTTTAATTCTCATCGTCTAGCTGTTGCACCTAATGGCACAATTGGTTATATTATGGGAAC AACTCCTTCTTTAACACCAATTAAACAATTAGTAGAAGAACGTACATATGGAAATTCCAAAACTTATTGTCCAATGCCTG GATTAAAAGAAACCTCTTTTATGTATGTTACTGCTTACAAGATGAATAAATACCAATTAATTGATGTTATTGCTACCGCT CAAAAACATGTTGATCAAGGGATTTCCTTTGAACTTGGGATAACTTCTGATATTACAACACGTGAATTGCAAAGATATTA TCTTTACGCTCATCATAAAGGTATAAAAACACTTTATTATACTCGCACACAAAAATTAAAAGTTGATGAATGTGAAGCTT GTGGTGTTTAA Protein sequence : MLEQKIKIIYDGLKKGQVYNMAQSLGFDFKHISECQANAIDNDVFLLTRSVKFGEVSQEAKLFLDQNRDKVIGVAVSGNK TWGQNYGKAGDIIASTYNIPLVLKFEGSGIQEERLFLKKWLLSYKKEKNSSFSFKKPLQNDSNFSDVTVKNTNEPTPPTQ KILPPWILLNNQIIDENGNIKDLNKDQEALTSFLLEEVKPKLKHFDTLKEKLTFLQTNEYYETDFLSQYNEQQIKDIYKI AYQKQFRFSTFMGAFKFYNDYALKSRDKKYYLETYEDRLCVNALYHAQGDFEIAKRLIKSLINQDFTPATPTLLNAGKKH RGEFVSCFLLEAGDSLNDIARINEFSMQLSKIGGGVSINITNLRAKGESIKGIKGVCKGVVGVCKLLDHSFRYADQMGQR TGAGAVYLSVFHADIEDFLSTKKLNADEDVRVKTLSLGVIVPNKMIELARKNEVMYTFYPHTVFLEYEKNFADIAVNMDY WYDILVSNPKVRKKAIQPRQLLELIARMQGESGYPYLMFCDNVNQNNTSHLQVKFSNLCTEILQPTITSHYTDYNHTQED KIGMDVSCNLASGHMSNMINNNTIKETVFMAMEVMNTVSMKTNINYVPAVAKANRLNRSVGFGIMGHHGFLAQNYIAFGS EENKDLIDVFFNAINYYSLLHSCQKAKKTGQKFYLFEKSHYADGSYFKGRGEILPKTDKIKKMFANIPLPSEKDWQQLKK DVQQFGLFNSHRLAVAPNGTIGYIMGTTPSLTPIKQLVEERTYGNSKTYCPMPGLKETSFMYVTAYKMNKYQLIDVIATA QKHVDQGISFELGITSDITTRELQRYYLYAHHKGIKTLYYTRTQKLKVDECEACGV |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| cur_1481 | YP_001800875.1 | ribonucleotide-diphosphate reductase subunit alpha | Not tested | Not named | Protein | 1e-123 | 42 |
