Gene Information

Name : serS (SLY_0397)
Accession : YP_007996596.1
Strain : Candidatus Phytoplasma australiense NZSb11
Genome accession: NC_021236
Putative virulence/resistance : Unknown
Product : Seryl-tRNA synthetase
Function : -
COG functional category : -
COG ID : -
EC number : -
Position : 332815 - 334071 bp
Length : 1257 bp
Strand : -
Note : -

DNA sequence :
ATGTTAGATCTTAATTATGTAGTTAAAAACTTATCACATGTTTTGACCAAATTAGAAACAAGAAATCACCCCTTAGATGA
TTTGAAAAAACTCCCTCTTTTATCTTCTCAAAGAAAAGAGTTGTTGTTAAAAATTCAAAAATTAAGACAACAAAAAAATA
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TTAGGTTTTGGGATGTCTAAAACTTATGATATAGAGGTTTTTATCCCAAGTTCTAATTGTTATCGCGAAATTGCCTCCAT
TAGTAATTCTGAGAGTTTCCAATCTAGACGTGCTAATATTAAGTTCCATAATCCGAACAATAACAAAAAAGAATACCTTC
ATATTTTAAATGGTTCTGGTTTAGCTATTGGAAGGACTGTGATTGCTATTTTAGAAAATTACCAAAATTCCGATGGCACT
ATTCGCGTTCCTGAAGTTTTAATTCCTTTTTTAGGAACAGATATTATTAAGCGTTAA

Protein sequence :
MLDLNYVVKNLSHVLTKLETRNHPLDDLKKLPLLSSQRKELLLKIQKLRQQKNKTAQINATQPQNLLKKDNDKSLTRHLE
EQLKTVETAIYDILSNTPNLPHDSLPIGKDEQANQEISRHGVIPQFDFPVKDHVALAKKLDILDFEKAAKITGSRFVVCK
GLGARLERALIQFMMDLHSTKGYQEIIPPYIINEKSMFATGQLPKFEAEVFKISHHKNNWYLNPTAEVPTINLHRDEFFP
SNALPLKYVAYTTSFRQEAGSAGSYSRGIFRQHQFNKVELIQFCHPQNSYSLLDQMLQDSCAVLDLLKLPYRVIVLSTGD
LGFGMSKTYDIEVFIPSSNCYREIASISNSESFQSRRANIKFHNPNNNKKEYLHILNGSGLAIGRTVIAILENYQNSDGT
IRVPEVLIPFLGTDIIKR

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
serS YP_003446791.1 seryl-tRNA synthetase Not tested The aminoglycoside resistance gene cluster Protein 3e-86 50