Name : serS (SLY_0397) Accession : YP_007996596.1 Strain : Candidatus Phytoplasma australiense NZSb11 Genome accession: NC_021236 Putative virulence/resistance : Unknown Product : Seryl-tRNA synthetase Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 332815 - 334071 bp Length : 1257 bp Strand : - Note : - DNA sequence : ATGTTAGATCTTAATTATGTAGTTAAAAACTTATCACATGTTTTGACCAAATTAGAAACAAGAAATCACCCCTTAGATGA TTTGAAAAAACTCCCTCTTTTATCTTCTCAAAGAAAAGAGTTGTTGTTAAAAATTCAAAAATTAAGACAACAAAAAAATA AAACAGCTCAAATAAATGCAACTCAACCACAAAACCTTTTAAAGAAGGATAATGATAAGTCTTTAACTCGTCATTTAGAG GAACAATTGAAAACAGTTGAAACTGCTATTTATGATATTTTAAGCAACACTCCTAATTTACCACACGATTCTTTGCCAAT TGGAAAAGATGAACAGGCCAATCAAGAAATAAGCCGTCATGGTGTAATTCCTCAGTTTGATTTTCCTGTCAAAGACCATG TTGCTTTAGCGAAAAAACTTGATATTTTAGATTTTGAAAAGGCTGCAAAAATTACTGGTAGTCGTTTTGTTGTTTGCAAA GGATTGGGTGCTCGTTTAGAAAGAGCTTTAATCCAATTCATGATGGATTTGCATAGTACAAAAGGTTATCAAGAAATCAT CCCTCCTTATATTATCAATGAAAAATCGATGTTTGCAACTGGTCAGTTGCCTAAATTTGAAGCAGAAGTTTTTAAAATAT CACACCATAAAAATAATTGGTATCTTAATCCAACAGCTGAAGTCCCTACTATTAATTTACATCGTGATGAATTTTTTCCA AGCAACGCTTTACCATTAAAATATGTTGCTTACACAACTTCATTCCGCCAAGAAGCCGGTTCTGCAGGTTCTTATTCAAG AGGTATTTTTAGACAACATCAATTCAATAAAGTTGAATTAATCCAATTTTGTCATCCCCAAAATTCCTATTCTTTATTGG ATCAAATGTTGCAAGATTCGTGCGCTGTTTTGGATTTGTTAAAACTTCCATATAGAGTGATTGTTTTGTCAACAGGAGAT TTAGGTTTTGGGATGTCTAAAACTTATGATATAGAGGTTTTTATCCCAAGTTCTAATTGTTATCGCGAAATTGCCTCCAT TAGTAATTCTGAGAGTTTCCAATCTAGACGTGCTAATATTAAGTTCCATAATCCGAACAATAACAAAAAAGAATACCTTC ATATTTTAAATGGTTCTGGTTTAGCTATTGGAAGGACTGTGATTGCTATTTTAGAAAATTACCAAAATTCCGATGGCACT ATTCGCGTTCCTGAAGTTTTAATTCCTTTTTTAGGAACAGATATTATTAAGCGTTAA Protein sequence : MLDLNYVVKNLSHVLTKLETRNHPLDDLKKLPLLSSQRKELLLKIQKLRQQKNKTAQINATQPQNLLKKDNDKSLTRHLE EQLKTVETAIYDILSNTPNLPHDSLPIGKDEQANQEISRHGVIPQFDFPVKDHVALAKKLDILDFEKAAKITGSRFVVCK GLGARLERALIQFMMDLHSTKGYQEIIPPYIINEKSMFATGQLPKFEAEVFKISHHKNNWYLNPTAEVPTINLHRDEFFP SNALPLKYVAYTTSFRQEAGSAGSYSRGIFRQHQFNKVELIQFCHPQNSYSLLDQMLQDSCAVLDLLKLPYRVIVLSTGD LGFGMSKTYDIEVFIPSSNCYREIASISNSESFQSRRANIKFHNPNNNKKEYLHILNGSGLAIGRTVIAILENYQNSDGT IRVPEVLIPFLGTDIIKR |
Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
serS | YP_003446791.1 | seryl-tRNA synthetase | Not tested | The aminoglycoside resistance gene cluster | Protein | 3e-86 | 50 |