Name : cadA (SLY_0142) Accession : YP_007996345.1 Strain : Candidatus Phytoplasma australiense NZSb11 Genome accession: NC_021236 Putative virulence/resistance : Unknown Product : putative cadmium-transporting ATPase Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 117843 - 119777 bp Length : 1935 bp Strand : - Note : - DNA sequence : TTGAAAGGTGTTATAAATTTGAATGTCAATAACGAAAAAACAAATCAAAAACCCTTAATTTGTTTTTTTATAGGTATCTT TTTATATTTAATTTTTTTCCTTTGGCAACGTTTTAATTTTTCAACCCTACAACCTTTTTCTTTACCATTTGCACTTATTA TTTTATTTTTGTTAGGTTATAGTGTTATTTCAGAAGGTTTTATAGATACTTGCAAAGAATCTAAAGCAAATAAAAAATTT ACTCCTAATATCGACATTTTAATGTCTTTAGCAGCTTTAGGTTCTTTATTTTTAGCGAATCATAGTGAAGCTATTTTATT AATTTTAATTTTTTCTGGAGCATCTTTTTTAGAACAATACGTAGAAAACAAAAGTCAGAAAGAAATAAAAAACCTTTTAA AATTACACCCTTCAGAAGCACGCTTATTGCAAAAAGACGGCAGTACGCAAATTATTTCTTCTCAACATTTAAAAACTCAA GATTTACTTTTAATTTTGGAAGGCGATGCAATTCCTACAGATGGCGTGATTATTTCTGGTTATCCTTGTGTTGATGAATC TAATATTACAGGTGAGTCTATTCCTTGCGAAAAACAACCTGGGGATTTAGTTTATGGAAGCACTATTAATGTTAATAATA CTTTCGTGATGCGTGTGACAACTACTAACGAAAAAACTGTTTTTGCTCAAATTGTGAAATTAGTTTCTCAAACCAAAAAT AGTTTTTCTAAAACAGCTACTTTAATCAAAAAAATAGAACCTGTTTATGTCAAGGCTATTATGTTTATAGTGATTTTTGT TTTAACTATAGGGGGAATTATTAATTTCCTTGATGCAAGTAAGCTGGATTTTGGAAAATTATTTTCTAAAACGATGGTTT TTTTAACAGTTTCTTCCCCTTGTGCTTTAGCTGCTTCTGATATTCCTTCCACTTTGGCAGCAATCACTAATTTAGCTAAA AAAGGAGTTTTATTCAAAAACGTTAAATCTTTAGAGATTATGGCAGAAACCAAAGCTTTTGCATGTGATAAAACAGGGAC TTTAACCGAAGGAAAACCAGAAGTTACGGATCTTTATGTAGACCCTCATATTTCTGAAGAAAAATACCAGCATTATTTAG AAATATTATTAGCCATGGAACAAAAATCTAACCATCCTTTTGCTGCAGCGATTAAAAATTATTTTAATATCCGCTCTCAT TTAATGTTAGAAATCACTAATTTAGTGGGCGTTGGAATAGAAGCTTTTTATCAAAATGATTATTATCTTATTTCTAAAGC AATTGCCTTTCCTAAAGTATCTAAAGATTTGGAAATAAAAACAGAAAAATTTTTATCACAAGGAAAAACAGTTATTTATT TTAGTAGTAATAATCGCGTTCTTATTGCTTTGGCATTTTTAGATAAAGTAAGACTTCCAGCAACGAAATTGATAGATTAT TTTAATAAGAAAAATATTAATACAGTAGTTATTTCAGGCGATAACGAACAAAGCGTTCTTTTTTTAAAAGAAGAATTGAA TTTAAAGCAAGCTTGGGGTAATAATTTACCTATACAAAAAGTAAAAAAAATTCAGCAATTACAAAACAAATACGGAATAA CAGTTATGGTAGGAGATGGCGTTAATGATGCTCCTGCTTTAAGAGTTGCTGATGTTGGTATTGCAATGCAAAATGGCACA GATGTTTCTATTGATGTTGCAGATGCTGTTTTAATGAAAAATGACTTATCTAAAATTATTTATACCCATAAAGTAGCTCT TAAATTAAATAAAATTATTCGACAAAATATTTTTTTTGCTATGAGTGTTGTTGTCGTTCTTAATTTAATAAACATGATAA CTCAAATCCCTTTACCTTTGGCTGTTTTTTGCCACGAAGGAAGTACTTTATTAGTCATTTTGAATGCTTTAAGACTTTTA AAAAGCGAAAAATAG Protein sequence : MKGVINLNVNNEKTNQKPLICFFIGIFLYLIFFLWQRFNFSTLQPFSLPFALIILFLLGYSVISEGFIDTCKESKANKKF TPNIDILMSLAALGSLFLANHSEAILLILIFSGASFLEQYVENKSQKEIKNLLKLHPSEARLLQKDGSTQIISSQHLKTQ DLLLILEGDAIPTDGVIISGYPCVDESNITGESIPCEKQPGDLVYGSTINVNNTFVMRVTTTNEKTVFAQIVKLVSQTKN SFSKTATLIKKIEPVYVKAIMFIVIFVLTIGGIINFLDASKLDFGKLFSKTMVFLTVSSPCALAASDIPSTLAAITNLAK KGVLFKNVKSLEIMAETKAFACDKTGTLTEGKPEVTDLYVDPHISEEKYQHYLEILLAMEQKSNHPFAAAIKNYFNIRSH LMLEITNLVGVGIEAFYQNDYYLISKAIAFPKVSKDLEIKTEKFLSQGKTVIYFSSNNRVLIALAFLDKVRLPATKLIDY FNKKNINTVVISGDNEQSVLFLKEELNLKQAWGNNLPIQKVKKIQQLQNKYGITVMVGDGVNDAPALRVADVGIAMQNGT DVSIDVADAVLMKNDLSKIIYTHKVALKLNKIIRQNIFFAMSVVVVLNLINMITQIPLPLAVFCHEGSTLLVILNALRLL KSEK |
Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
cadA | YP_005732869.1 | cadmium-translocating P-type ATPase | Not tested | Type-V SCCmec | Protein | 1e-107 | 44 |
SE0062 | NP_763617.1 | copper-transporting ATPase copA | Not tested | SCCpbp4 | Protein | 2e-107 | 44 |