Gene Information

Name : cadA (SLY_0142)
Accession : YP_007996345.1
Strain : Candidatus Phytoplasma australiense NZSb11
Genome accession: NC_021236
Putative virulence/resistance : Unknown
Product : putative cadmium-transporting ATPase
Function : -
COG functional category : -
COG ID : -
EC number : -
Position : 117843 - 119777 bp
Length : 1935 bp
Strand : -
Note : -

DNA sequence :
TTGAAAGGTGTTATAAATTTGAATGTCAATAACGAAAAAACAAATCAAAAACCCTTAATTTGTTTTTTTATAGGTATCTT
TTTATATTTAATTTTTTTCCTTTGGCAACGTTTTAATTTTTCAACCCTACAACCTTTTTCTTTACCATTTGCACTTATTA
TTTTATTTTTGTTAGGTTATAGTGTTATTTCAGAAGGTTTTATAGATACTTGCAAAGAATCTAAAGCAAATAAAAAATTT
ACTCCTAATATCGACATTTTAATGTCTTTAGCAGCTTTAGGTTCTTTATTTTTAGCGAATCATAGTGAAGCTATTTTATT
AATTTTAATTTTTTCTGGAGCATCTTTTTTAGAACAATACGTAGAAAACAAAAGTCAGAAAGAAATAAAAAACCTTTTAA
AATTACACCCTTCAGAAGCACGCTTATTGCAAAAAGACGGCAGTACGCAAATTATTTCTTCTCAACATTTAAAAACTCAA
GATTTACTTTTAATTTTGGAAGGCGATGCAATTCCTACAGATGGCGTGATTATTTCTGGTTATCCTTGTGTTGATGAATC
TAATATTACAGGTGAGTCTATTCCTTGCGAAAAACAACCTGGGGATTTAGTTTATGGAAGCACTATTAATGTTAATAATA
CTTTCGTGATGCGTGTGACAACTACTAACGAAAAAACTGTTTTTGCTCAAATTGTGAAATTAGTTTCTCAAACCAAAAAT
AGTTTTTCTAAAACAGCTACTTTAATCAAAAAAATAGAACCTGTTTATGTCAAGGCTATTATGTTTATAGTGATTTTTGT
TTTAACTATAGGGGGAATTATTAATTTCCTTGATGCAAGTAAGCTGGATTTTGGAAAATTATTTTCTAAAACGATGGTTT
TTTTAACAGTTTCTTCCCCTTGTGCTTTAGCTGCTTCTGATATTCCTTCCACTTTGGCAGCAATCACTAATTTAGCTAAA
AAAGGAGTTTTATTCAAAAACGTTAAATCTTTAGAGATTATGGCAGAAACCAAAGCTTTTGCATGTGATAAAACAGGGAC
TTTAACCGAAGGAAAACCAGAAGTTACGGATCTTTATGTAGACCCTCATATTTCTGAAGAAAAATACCAGCATTATTTAG
AAATATTATTAGCCATGGAACAAAAATCTAACCATCCTTTTGCTGCAGCGATTAAAAATTATTTTAATATCCGCTCTCAT
TTAATGTTAGAAATCACTAATTTAGTGGGCGTTGGAATAGAAGCTTTTTATCAAAATGATTATTATCTTATTTCTAAAGC
AATTGCCTTTCCTAAAGTATCTAAAGATTTGGAAATAAAAACAGAAAAATTTTTATCACAAGGAAAAACAGTTATTTATT
TTAGTAGTAATAATCGCGTTCTTATTGCTTTGGCATTTTTAGATAAAGTAAGACTTCCAGCAACGAAATTGATAGATTAT
TTTAATAAGAAAAATATTAATACAGTAGTTATTTCAGGCGATAACGAACAAAGCGTTCTTTTTTTAAAAGAAGAATTGAA
TTTAAAGCAAGCTTGGGGTAATAATTTACCTATACAAAAAGTAAAAAAAATTCAGCAATTACAAAACAAATACGGAATAA
CAGTTATGGTAGGAGATGGCGTTAATGATGCTCCTGCTTTAAGAGTTGCTGATGTTGGTATTGCAATGCAAAATGGCACA
GATGTTTCTATTGATGTTGCAGATGCTGTTTTAATGAAAAATGACTTATCTAAAATTATTTATACCCATAAAGTAGCTCT
TAAATTAAATAAAATTATTCGACAAAATATTTTTTTTGCTATGAGTGTTGTTGTCGTTCTTAATTTAATAAACATGATAA
CTCAAATCCCTTTACCTTTGGCTGTTTTTTGCCACGAAGGAAGTACTTTATTAGTCATTTTGAATGCTTTAAGACTTTTA
AAAAGCGAAAAATAG

Protein sequence :
MKGVINLNVNNEKTNQKPLICFFIGIFLYLIFFLWQRFNFSTLQPFSLPFALIILFLLGYSVISEGFIDTCKESKANKKF
TPNIDILMSLAALGSLFLANHSEAILLILIFSGASFLEQYVENKSQKEIKNLLKLHPSEARLLQKDGSTQIISSQHLKTQ
DLLLILEGDAIPTDGVIISGYPCVDESNITGESIPCEKQPGDLVYGSTINVNNTFVMRVTTTNEKTVFAQIVKLVSQTKN
SFSKTATLIKKIEPVYVKAIMFIVIFVLTIGGIINFLDASKLDFGKLFSKTMVFLTVSSPCALAASDIPSTLAAITNLAK
KGVLFKNVKSLEIMAETKAFACDKTGTLTEGKPEVTDLYVDPHISEEKYQHYLEILLAMEQKSNHPFAAAIKNYFNIRSH
LMLEITNLVGVGIEAFYQNDYYLISKAIAFPKVSKDLEIKTEKFLSQGKTVIYFSSNNRVLIALAFLDKVRLPATKLIDY
FNKKNINTVVISGDNEQSVLFLKEELNLKQAWGNNLPIQKVKKIQQLQNKYGITVMVGDGVNDAPALRVADVGIAMQNGT
DVSIDVADAVLMKNDLSKIIYTHKVALKLNKIIRQNIFFAMSVVVVLNLINMITQIPLPLAVFCHEGSTLLVILNALRLL
KSEK

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
cadA YP_005732869.1 cadmium-translocating P-type ATPase Not tested Type-V SCCmec Protein 1e-107 44
SE0062 NP_763617.1 copper-transporting ATPase copA Not tested SCCpbp4 Protein 2e-107 44