Name : K751_06930 (K751_06930) Accession : YP_007984337.1 Strain : Helicobacter pylori UM066 Genome accession: NC_021218 Putative virulence/resistance : Unknown Product : lactate permease Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 65709 - 67364 bp Length : 1656 bp Strand : - Note : Derived by automated computational analysis using gene prediction method: Protein Homology. DNA sequence : GTGCTAGAATTTCATCAGATTTATGACCCTTTGGGTAATATTTGGTTGAGCGCTCTTGTAGCCTTGTTACCGATTTTGCT ATTTTTCTTATCTTTAATGGTTTTTAAACTCAAAGGTTATACAGCGGCCTTTTTGAGCGTGGCTCTGTCAGCCATTATTG CGGTTTTAGTGTATAAAATGCCTGTTAGCATGGTGGGTTCAAGCTTTCTTTATGGCTTTCTCTATGGCTTATGGCCGATC GCATGGATCATTATTGCGGCGATTTTTTTATACAAACTCAGCGTTAAATCCGGCTATTTTGAAATTTTAAAAGAAAGCGT CCAATCCATCACTTTAGATCACCGGATTTTAGTGATTTTGATTGGCTTTTGTTTTGGCTCGTTTTTAGAAGGAGCGATCG GCTTTGGAGGGCCTATTGCCATTACAGCAGCGATTTTAGTGGGTTTAGGGTTAAGCCCTTTATACGCTGCCGGGTTATGT TTGATCGCCAACACCGCTCCTGTAGCCTTTGGTGCGGTGGGTATCCCTATAAGTGCGATGGCGAGCGCGGTAGGGGTGCC AGCGATTTTGATTTCAGCCATGACGGGTAAAATCCTTTTTTTTGTGAGCTTGTTCGTGCCGTTTTTCATTGTGTTTTTAA TGGATGGCTTTAAGGGGATTAAAGAAACTTTTCCGGCCGTTTTTATCGCGGCTTTTTCTTTCGCTGGTGCGCAATTTTTA AGCTCTAATTACTTGGGGCCAGAATTGCCTGGCATTATTTCAGCCCTTGTTTCACTCGTTGCAACAGCACTCTTTTTGAA ATTTTGGCAGCCTAAAGTGATTTTTAGAAGCGATGGCAAAGCGGCTTCATTCACTAAGAGTAACCATCATATCTGTAAGA TCTATGTCGCTTGGTCTCCTTTTGTGATTCTGGTTTTAGTGATTGTTTTATGGATACAGCCTTTTTTTAAGGCTTTATTT GAAAAAGACGGCTTGTTAGCTTTTTCTAATTTTTATTTTGAATTCAATAACATCAGTAACCACATCTTTAAAAGCCCGCC TTTTGTAGAATCCGATCAAAGCGTGAGTTTTCCGGTGGTGTTTAAATTTTTCTTAATCAACACGGTTGGCACTTCCATTT TTTTGGCCGCTCTTGTTAGCATGCTCGTTTTAAGGGTGCGAGTGAGCGATGCGCTGAGCGTCTTTGGCGAGACTTTAAAA GAAATGCGCTACCCCATTCTTACCATTGGTTTAGTCTTAAGCTTTGCCTATGTGTCTAATTACAGTGGGATTTCTTCCAC TCTAGCCTTAGCGCTCACCCATACGGGCTTAGCTTTCACCTTTTTCTCGCCCTTGATCGGGTGGGTGGGCGTGTTTTTAA CCGGGAGCGATACGAGTTCTAATCTTTTATTTGGCTCTTTACAGCAACTCACCGCCCAACGATTGCACCTCCCTGAGATT TTAACCCTAACGGCTAATACCGTGGGTGGCACTTTGGGCAAGATGATAAGCCCTCAAAGCATCGCTGTCGCTTGCGCGGC AGTGGGATTGGCCGGGAAAGAGAGCGATTTATTCAAATTCACGGTTAAATACTCCCTTATTTTTGTAGCGATCATGGGAG TCGTGATTAGCGCGATTGCGTATTTGATCCCTGAAGTGGTGCCTGCGATAAAGTAG Protein sequence : MLEFHQIYDPLGNIWLSALVALLPILLFFLSLMVFKLKGYTAAFLSVALSAIIAVLVYKMPVSMVGSSFLYGFLYGLWPI AWIIIAAIFLYKLSVKSGYFEILKESVQSITLDHRILVILIGFCFGSFLEGAIGFGGPIAITAAILVGLGLSPLYAAGLC LIANTAPVAFGAVGIPISAMASAVGVPAILISAMTGKILFFVSLFVPFFIVFLMDGFKGIKETFPAVFIAAFSFAGAQFL SSNYLGPELPGIISALVSLVATALFLKFWQPKVIFRSDGKAASFTKSNHHICKIYVAWSPFVILVLVIVLWIQPFFKALF EKDGLLAFSNFYFEFNNISNHIFKSPPFVESDQSVSFPVVFKFFLINTVGTSIFLAALVSMLVLRVRVSDALSVFGETLK EMRYPILTIGLVLSFAYVSNYSGISSTLALALTHTGLAFTFFSPLIGWVGVFLTGSDTSSNLLFGSLQQLTAQRLHLPEI LTLTANTVGGTLGKMISPQSIAVACAAVGLAGKESDLFKFTVKYSLIFVAIMGVVISAIAYLIPEVVPAIK |
Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
glcA | CAE85240.1 | GlcA protein, putative glycolate permease | Not tested | PAI V 536 | Protein | 1e-101 | 52 |