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Name : Clopa_3906 (Clopa_3906) Accession : YP_007942332.1 Strain : Clostridium pasteurianum BC1 Genome accession: NC_021182 Putative virulence/resistance : Unknown Product : glycosidase Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 3925943 - 3927622 bp Length : 1680 bp Strand : - Note : PFAM: Alpha amylase, catalytic domain; TIGRFAM: alpha,alpha-phosphotrehalase DNA sequence : TTGAGTGAACCTTGGTGGAAAAAAAGTGTTGTTTATCAAGTTTACCCACAGAGTTTTAAAGACAGTAATAATGATGGTGT AGGAGACATAAGAGGTATTATTGAAAAGCTGCCTTATATAAAAAGATTAGGAGCTGATGTTATCTGGTTAAATCCAATAT ATGAGTCTCCAAATGTTGATAATGGATATGACATATCTGATTACAGAGCAATTCAAAAACGTTATGGTACTATGGAAGAT TTTGAAGAATTATTAGGTAAGGCACATGAACTTGGCATACGTATTATAATGGATCTGGTTGTTAACCATACGTCAGATCA GCATAAATGGTTTAAAGAGAGCTGTAAAGCAGAAAAAAATAAATATCGTGACTATTATATCTGGAAAGATGGTAAGAATG GTAAGGAACCTAACAATTGGGGATCATCCTTTGGAGGATCTACCTGGGAATATAAAGACAGTGTAGGAAAGTACTATTTG CATCTATTTGCCAAAGAACAGCCAGATTTAAATTGGGAAAATGAAGAAGTAAGAAATGAAGTCTATGATGTCATGCGTTT TTGGCTTGACAAGGGTATTGATGGATTTAGAATGGATGTAATCAACCTGATATCTAAAAGACAGGAATTTAAGGACGGTA CAGAGATTAGAGATAATTCCTTTGCCTCTTACTATGAAGGTGCTTCAAATGGTCCAAGAGTTCATGAATTTTTACATGAA ATGAATGAAAAAGTTTTATCCAAATATAATTTGATTACTGTAGGTGAAACTCCAAATACTACTACTGAGGATGCCATTAA ATATTCCGCTGCCAGCAGAGAAGAGCTTAATATGGTTTTCCAATTTGAACATATGCATGTGGATTATGATGAAAATAGAA AATGGAACATTATGAGACCCAAATTATCTGATTTAAAAAAGGTTCTTTCAAAATGGCAGGAAAGATTAGCAGAGGAAGGC TGGAACAGCTTATACTGGAATAATCACGATCAGGCCAGAGTGGTTTCTCGTTTTGGTGATGATGGTAAATACCGCATAGA ATCAGCAAAAATGCTTGGAACCTTACTTCATATGATGCAAGGTACTCCCTATGTTTATCAAGGTGAAGAACTTGCAATGA CTAATGTTCACTTTGATTCCATAGAAGATTATAAGGATATTGAAATACTTAACCGTTATCATGAACTTGTTGACCTTAAG GGAAAAGATCCTTCTTATGCTTTAAGTGTAATCCATGCTAAAGGTAGAGATAATGCCAGAACTCCAATGCAGTGGGATAA TTCAGAAAATGCAGGATTTTCTCATTCAGAACCATGGATAAAAGTTAATCCGAATTATGTTGATATCAATGCTCAAAAAC AAATTGATGATGAAAATTCTGTTTTCAATTATTATCGTAAACTAATTCAATTAAGGAAAGATTACGATATTATAACAAGT GGAAGATATGAATTAATACTAAAAGATGATTCTGACATTTTTGCATATCTTAGAAAAGGAGAAAATGAAACTTTATTGAC AATTTGTAATTTTACCAATAGAGAAACTATTTTTAGATTACCTGAAAATATTAAATATAATTCTTATGAATTATTAATTG GTAATTATGAAAATAATAATGGCATTGATGCTGATATTAAATTAAAGCCTTATGAGGCTAGAGTTTATTTATTAAAATAA Protein sequence : MSEPWWKKSVVYQVYPQSFKDSNNDGVGDIRGIIEKLPYIKRLGADVIWLNPIYESPNVDNGYDISDYRAIQKRYGTMED FEELLGKAHELGIRIIMDLVVNHTSDQHKWFKESCKAEKNKYRDYYIWKDGKNGKEPNNWGSSFGGSTWEYKDSVGKYYL HLFAKEQPDLNWENEEVRNEVYDVMRFWLDKGIDGFRMDVINLISKRQEFKDGTEIRDNSFASYYEGASNGPRVHEFLHE MNEKVLSKYNLITVGETPNTTTEDAIKYSAASREELNMVFQFEHMHVDYDENRKWNIMRPKLSDLKKVLSKWQERLAEEG WNSLYWNNHDQARVVSRFGDDGKYRIESAKMLGTLLHMMQGTPYVYQGEELAMTNVHFDSIEDYKDIEILNRYHELVDLK GKDPSYALSVIHAKGRDNARTPMQWDNSENAGFSHSEPWIKVNPNYVDINAQKQIDDENSVFNYYRKLIQLRKDYDIITS GRYELILKDDSDIFAYLRKGENETLLTICNFTNRETIFRLPENIKYNSYELLIGNYENNNGIDADIKLKPYEARVYLLK |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| malL | YP_251987.1 | oligosaccharide alpha-1,6-glucosidase | Not tested | SCCmec | Protein | 3e-151 | 56 |
