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Name : Clopa_3902 (Clopa_3902) Accession : YP_007942328.1 Strain : Clostridium pasteurianum BC1 Genome accession: NC_021182 Putative virulence/resistance : Unknown Product : glycosidase Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 3919560 - 3921239 bp Length : 1680 bp Strand : - Note : PFAM: Alpha amylase, catalytic domain DNA sequence : ATGTTAAAGAAAAGATGGTGGGATAAAAGTGTAATCTATCAAGTATATCCTAAAAGTTTCTATGATTCAAATAATGATGG AATAGGTGATATAAAAGGAATTGTTGATAAACTTGATTATTTAAAAGATTTAGGTATAGGTATAATTTGGCTAAGTCCTG TATATAAAAGTCCTATGGATGATAATGGTTATGATATTATGGATTATTATGATATAGATAAGCAATTTGGATCTATGGAA GATATGGGCAACTTAATAAAAGAAGGCAATAAACGCAATATTAAAATAATGATGGATTTAGTTATAAATCATACCTCTGA TGAGCATAATTGGTTTATAGAGTCAAGGAGCAGCAAAAGCAATCCAAAAAGAGATTTTTATATATGGAAAGATCCAAAAC CGGATGGCAGCGCGCCTAACAATTGGAAGTCTATATTTGGTGGATTCGCCTGGGAATATGATGATAATACTAAACAGTAT TATCTACATGTATTTTCAAAAAAACAGCCGGATTTGAATTGGGAAAATGAAGAAGTGAGAATGAAATTATATGATATGGT AAACTATTGGTTGGATAAAGGCTTAGGCGGCTTTAGAGTAGATGCTATAACTTATATAAAAAAGGACAATACCTTTAAGA ATTTAGAATCTACAAATAATGAAGAATTAGTTAATATTAATGGAGGATCTCTAAATCAAAAGGGAATAGAGGATTTTTTA TCTGAATTAAAGAAAAATACATTTTCTAAATATGATATTGTTACAGTAGCAGAAGCGCCTGGTATACCAAGGGAAAAATT AAAAGACTACAGCGGGGCTAATGGTTTTTTTGATTTATTATTTGAATTTGAACATTCTGATTTAGATGTAGCTGAAGATG GAAAGTGGTACACACCTAAAAAATGGACTCTACAAGAATTTAAAGATGCCCTTTTTAAAAGTCAAGAAGTATATAATGAT TTGGGATTTGGCGCACTGTTTTTGGAAAATCATGATCAACCTAGGTCTTTAAATAAATTTATTAAGGAATCAGATATAGG CCAAGCTAGTGCAAAGATGCTGGCTACAATTTATTTTTTATTAAAAGGGATACCATTTATCTATCAGGGTGAGGAAATAG GAATGACTAATGTTAAATATGAATCCATTGAAGATTATAATGATATTTCATCTATTGACCAATATAATAGTGCTATAAAT GATGGCCTATCTAAAGAAGAAGCTTTAGAGGCTGTACACAGAAGAAGCAGAGATAATGGAAGATCTCCTATGCAGTGGGA TGACAGTAAAAATTCTGGATTTACTGAAGTAGAGCCTTGGCTTAAGGTTAATAATAATTATGAAGAAATAAATGTAAAAA ATAATCTGGAATCTGAAGATTCAATTTTAAATTATTATAAGAATTTAATTGATTTACGTAGAAATAGTGATTACTCAGAT GTAATTGTATATGGAAAATATATAGAATTCATGGAAGATGATAAAAATATTTTTGCCTATATAAGAGAATATGAAAATAA GAAACTTTTAGTATTAGCTAATTTCTATGGAGAAAATATTAAAGTTAAATTAAATTGCAATGTAGATAAAGTATTAATTT CAAATTATGATTTAACTAGTATATCAAATGATGAAGTATACTTGAGGCCTTATGAAGCTGTAGTCTTTGGTGTTTTATAA Protein sequence : MLKKRWWDKSVIYQVYPKSFYDSNNDGIGDIKGIVDKLDYLKDLGIGIIWLSPVYKSPMDDNGYDIMDYYDIDKQFGSME DMGNLIKEGNKRNIKIMMDLVINHTSDEHNWFIESRSSKSNPKRDFYIWKDPKPDGSAPNNWKSIFGGFAWEYDDNTKQY YLHVFSKKQPDLNWENEEVRMKLYDMVNYWLDKGLGGFRVDAITYIKKDNTFKNLESTNNEELVNINGGSLNQKGIEDFL SELKKNTFSKYDIVTVAEAPGIPREKLKDYSGANGFFDLLFEFEHSDLDVAEDGKWYTPKKWTLQEFKDALFKSQEVYND LGFGALFLENHDQPRSLNKFIKESDIGQASAKMLATIYFLLKGIPFIYQGEEIGMTNVKYESIEDYNDISSIDQYNSAIN DGLSKEEALEAVHRRSRDNGRSPMQWDDSKNSGFTEVEPWLKVNNNYEEINVKNNLESEDSILNYYKNLIDLRRNSDYSD VIVYGKYIEFMEDDKNIFAYIREYENKKLLVLANFYGENIKVKLNCNVDKVLISNYDLTSISNDEVYLRPYEAVVFGVL |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| malL | YP_251987.1 | oligosaccharide alpha-1,6-glucosidase | Not tested | SCCmec | Protein | 3e-117 | 47 |
